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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s660 | supercontig | LSalAtl2s660:189355..234598 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010036 >EMLSAP00000010036 ID=EMLSAP00000010036|Name=EMLSAP00000010036|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=473bp
MGHQHCMRKNILLDSLEKAFYSFEYKMEKLWIPQNSEFISNKKWIEENFP TNYRVQIISLLSLSGNILTPEALLLLLDIHEKVEQISAGHNTRWKDLCFK VPVANVFLERNKVLTNDKNTTFDRVDDLFISDDNVVPQNEKTEIDYDDAF LEYENESKNGSRYEKLLKILSPKVYCDFVETLNDRCFERSLLEIWKFDRR RIKRLTKDRIVQAINRIQNSPVYGYKTNYDNYMGSIIRNETGHVVSASTL NSVWFTQVNLENVSEVIGLTDEFVNKESLEWELKFVDIFLNASTENISAF GISARSFNDITKKSIFFDGIRLTGGFFIMCIYTVIMLGRLNCVEVRFFAT IAGLFSILLGMVVSLGIISAMGLKYSPVFAMLPFLYLGIGIDDMFIIVQC WYNILEQNKKECSTDQSIKTLEEMMAETMKDAGVTITITSLTDIFAFGIG GITVSQVIYVAFMYIPSFKKIVT back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s660:189355..234598+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010036-705883 ID=EMLSAT00000010036-705883|Name=EMLSAT00000010036|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=45244bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s660:189355..234598+ (Lepeophtheirus salmonis) AGGGGAAGGGCGGGATTAATAATTATTTCATATATAATATAGAATGTTAA
TTATTCTTATATTTTCTTCCTGTGTTTTTAACCGTATTACTAAATTTTTG
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AAAAACTTCCTTAGTCGTACTTTTTTTTTTTAAAGCTAATCACTTCTAGA
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AAAATTGTTTTTACTTTTTTATGTCTTATGAAAAATAAAGAAAATAATTT
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ATTAGACTCTTTGGAAAAAGCTTTTTATAGGTAAGAACTTATTGCTAATA
TGTATGTTTCAATCCAAACATTAATTTKTATATARATACCGAYGTYAAAA
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ACATCCTAAGGCTTCTTGGGGGTAGGTTGTGCAATTAAGTAACAATATGA
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CTCTGGCTACTTTGAGTATTAACAGAGTTATGAGAACAGTTTCTGAAAGG
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CCCCAACCACTTTAGAATATATAATGCAGTATGTATTCTACAAAATACCA
TCCTCTAACCCAAAGTGGTTTTGCTATAAATTAGCTACAGGCCCTTAATT
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GTTTCCTTTGTAAGGCAGCATTAAGGTTTTTAAAGTTTAGCGNACTTTAG
AATATATAATGCAGTATGTATTCTACAAAATACCATCCTCTAACCCAAAG
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CTCAACTCTACTAGAGAAATATTGAACCTTTTGTAAAATCGAAGTTGAGT
GCTCTCACCATCTATTCTATAGCTGCCCTAAGGTGGTTTCCTTTGTAAGG
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GGTCCGGCTCATAATGATGGACCCGACCGTGTATGAAAAAATGAAGTTAG
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TTATTCCCTATACACACAGTGACATAAACAAATTGATATATATATATATA
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AATATGAAATATTGCATTAAGTATCATATATTTATAAAAAACAGTTAAAT
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TTACTTAATTGTAGCCTGACCAACATCTTTGGATCATTCGTCAATCATCC
TCTACATAATGGTGTTGAAGTCCATGCGNNAAATAAGAAGTTTATTTGAT
ATTTACTCTCCATCATTTAAGTGAAAGAACTGATTTATAGACTATACTCA
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TTGATAGTAATATTTTATTAAATTAGTATTTATTTGATTTCTGTTATACA
TTTAAGCAAAAAAAGGTTTGATTTCTAACACTTTCAGTAAGTGGAATAGT
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GTTATGCGAGCTGGTCTTCTGTTTGACCATCATTTTCATCGTGTAATGCT
TGTAATTCGGAGTCTTTAAACTTTTTCGGTGGCTGGCCACGCATCAAATC
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CAGTAAAGCTATTCTTCATCTTTAATCTGCGAAACATAGTAAATTATGTA
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GAAGGAGGAAGATTCAAAAATATATTTTTGTATAACGCATTTGTACACAA
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ATTATGGGCCATAGGTACTTCAAAATATTATCTGAGTAATATGTCAAATT
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TAAGAAATAATAAAATGAGTAATAAATGTATTTAGTTCTAAACAAATCCC
AAGTTAGTTTAAGGTTAATTTATTTATTGTATGATATTGGAATGATAACT
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TGATTTTCTGTTTTGTTTCATAAATATATAAAAAAGAACAAGGTTGATAA
TTATTATTATTATTAAAAATGGGCATTAACAATATTACAAATAWTCTWAA
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CGGGGAAATATTTTTCTACAAATAACATCACAAAATATACATTTTTTAAC
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TCTGAAMCGGCTGSMWTKTCCMTKTTKCCSAAWANCYCCTTGRTGGAGKC
AAWCAGGCTGGCCTTGGTGCTATAGGGATGTCTGTTGGTATGTTTCTCGA
CATAGCCCCAGACAAAATAGTCCAAAGGATTAAGGTCGGGGGAGTTAGGA
GGCCACAAATCCTTGGTTACGACGTCATAACAGTTCTCGGTTAATCACTG
CATGGAGATTTTGGACACATGGCAGGGTGCTGAGTCCTGTTGCCACACCC
AGGCCCTGTCTCCGGCCTTCATGGACCTGGTAGGGTCATCCTCAACCATC
TTTTTTACCTTGTCGACAAAGTCGGTGTCCTTGACCTTCCTGTCGGCGCC
CTCGTCCTTGGGTGCCCTCTTTATGGTGGCATCAACATCCGAGGTGTCCT
CTAGCTTCTTACGGATACACTGAACAGTCCGTAAAATCACTCTTAAGGTT
GAAGCAATCGTTGAATTGGAGATTTCACCTCCATTATTAATCAATGCCAT
GACTACGGCGGRCCTCGAAAGCTCCTCGTTCCACTTATAGGTCTTTATCT
CCTCATATGATGACGGCATGATGCTAACTGAACTACGTCAGCTGATGAGA
ATAGCTTTCCTATTTGGTAACCGGTTTTTTATTTGATAATGTCGTCTTCA
AGTTATCAAGGTTTAAAGTAGGCGAAAATTTGATCCCCGCTCCCTGTATA
TATATAAAGTCCATTTTATCCTATCCTCTCATTTTCAAGTTGTATAGATA
GATTGCACTAGCAATGAGAATTTTCCTTCTCCTTGGAAGAGGACCTTGGA
CAATATTTGTTTCCATATATTAGTCTAAGGTGCATTTTATGAAGGCTATC
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TAAACTTACTTTTACAATGATATGTGGAAAGTTTTGTGAAGTATATAAGT
TTATAACTTTATAAACTTATTTTAGGGTACATTTTGTCGAACTAGGTTAA
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GAATTCAAAATTATAGCTATTTTATGAAGATAAATGTGAATAATATTTAT
TTGTCGTAAACGGAATTTACAAATATTTTTGTAAAAGGAATGTATATTAT
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GAAAGAAAGCGTCATAAGTATGATTTTTGACAATAAAAAAATATATGTTA
TTCTTACAATTTACGTAATGAGATCAAAGAAAAAAAAATGTGACAAAAGG
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GTAGTTCATTTGAATATGATAGTAACAATTATGTTGACAACATGGATTGT
TCGTTGTTTTTGTAAATTTATTTATTTCTGCATAAAGTATATAACTAATT
GTAAATTCTAAGGATGTATTCCTTTGGGGAAAAAATTAGTTGCAGATCTA
AAATGTGTTTTTTATTTATTTTCAATAGCTGTCATAATTATTATTTCATT
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GTCGTTTTTAGACACACAGTAAAATGGAGTATTGTAATCGGAGCCATTCT
TTCATATATCCTTACTTGTTAAGGTATTTTGTGTTTTTTTTTACTATTTT
TTATAACTGTCAATTAACTGTTATTTGTAAATAAGTATATTTATAAACTG
GAGGCTGTATAAGATCCCAGATTAAATAAGTTTGGTTGACAACTTATTAT
TTCACTATTTTTCTATCATCTACCATAATTGGTTTCCTTAACATACATAT
GTACCTTTATTTTTAAATTAAATCGAATATTACATGAAATACAATTACAT
ATATTTTTCTAAAATTAAAATATAAAGGATATGTAAATCGAATGAAAAGA
AAAAAATTTATATAAATAGTCTGTTCATAACTATAAAAATATATTAGATT
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CCTTTTAACACATAAAACCTGAAATAAAAATCTAAGTAATCCTATTCGAA
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TTATATTTCTTGGCGATACCCCTGAGTGCGAAGATAAGTTCATGTCGCAT
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AGATTTGGATATTTAGATTAGAATTCAAATTGACTTGGAAGAAGAACGAA
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GTCAATGTATCTCAGGCCTCCAATTCTCTTGTGAAAGATATCAGTCAAAT
GAAATTGTTAATTGAATATTCGTCAATTAATAGACATATTTATAAATCCG
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CGACTTGCTTTCTTCGATGATAGAGTAAGTTTACCTTCAAAAAGAAAAAT
AGCTGTGCTCTCTCAAATTTTAGCACAAATCGTTTTTATGCATAAAATAT
CATTTCTTATTAAGAAGTTTAAAAAAAAAATCAGGAAATTTTTAAGCAGC
CTCATAGTTTTTTAGTTTGACCCATTACTTTGGAATTGTAGGGAAGACTA
CATAGAGGCATCATAAAATTTGTTTTGCTTCAAGTCTACAATTATTTTGA
TAAAAGAGGAATGCCGTTCATCACAAAATATAGTGGGTTAATAACAAATG
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CCTGTGCTCATTGAAGGAGGCCTTTANNNNNNNNNATCTTGAGGTAGCAG
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GCAGGAAAAAAACATAAACTCAGTAGTTCTAAAGCTGTTTGAAGCTTTTA
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GGCAATTATTATTTTTTCATCAGGTACATAAAGTGCATTGAAGTATGTGA
GCAAATGCATCACTCAATGGTTTCTTTATAAAGTAATTCCTCATTAGTGG
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GCATGTTGTGTCTGCTTCAACTCTAAATTCCGTATGGTTTACTCAAGTTA
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TCTCAATCTTACTAGGAATGGTTGTAAGTCTAGGAATTATTTCTGCAATG
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