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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s791 | supercontig | LSalAtl2s791:25681..66356 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011472 >EMLSAP00000011472 ID=EMLSAP00000011472|Name=EMLSAP00000011472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=638bp
MSTNEIQLTMNVSSSLNENMSEIGSSVLHDEAAFATLSTLIPTGFGLYIF SFTTFVGNAMVLHAIRTEKRLQTVSNMFIMSLASADLTVGLIVMPISSAY ALTGDWKFGYVVCQFWLVIDYTASTASIFNLCILSLDRYWSISTPLQYLR KRTKKRALIMIGLAWLASAMWFIPVLGWHHILYNGKRQQPEGVCDTEFAT NITFKVVTSILNFYIPVIMMIVINVRIFLAIRRRSEDIERLGATTSGMAQ SSTPITTNIVAAMQDDMTCDSLTEHDHVESNYCQGPQNNLLSKKKKKKKR RHHTCSRLNKSSKKSDRPRNNFVNSSVVEFHKLSVMTVKSKNGQPLIQKP SSSHYRDSEVLTVFEGVTVNVEYVNNASSSNNQDAEDSSKKNKADKSTTA VKTCHNSANLSVHINHKLDHSNHRQCYRSSRKCLPTSSTNRINNKNNSKT SSTVVNSNNNLLINGVSATPSSSFSDEDEQDVSVRINTSVDQGNGWIRTL FCPNGGGSGKQRSDLFLQPQCSTSNLTPANPKTVLAKEKKAATQLGVIVG AFILCWLPYFTLFMVVAYCGEANQCVSSTVHTVTIWFGYFNSTLNPILYP LCNRNFKRAFKRMLRFSSPPTVSSQPQNQFSYLITNKI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s791:25681..66356- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011472-707319 ID=EMLSAT00000011472-707319|Name=EMLSAT00000011472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=40676bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s791:25681..66356- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTCAACAAATGAAATTCAATTGACCATGAATGTATCATCATCCTTGAA
TGAGAATATGAGTGAAATTGGTTCGTCTGTACTACATGATGAGGCGGCCT
TTGCAACACTATCAACACTCATTCCGACAGGTTTTGGTCTTTACATCTTT
AGCTTTACTACTTTTGTTGGAAACGCCATGGTGCTTCATGCCATTCGAAC
TGAGAAACGGTTACAAACGGTAATATTTATTAGTTTGCTAATACTAAGAC
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CAATGTAAAAAAAAAAGTGTACTGATTCGTATTTAATGGGTCTTTGTGTT
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AAAAAATGAATAACTCAATGTCACAACCCTTGCTAGCAATACAATTCTCG
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TGGAGTCCGGAATCCAAATTCGAGCATCTTTTCAGCTGGATGATGAAGGA
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TGGCATTGAAATAGGAAACAAATAGGATGATAATGTGATATTAAACCACA
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CCATCACAATGTAATATGAATCAATCATAAGGGTTTAAAGAAGAGTGTGG
TTTTTCATCATTTATCAGACTTAAAATGGAAATATATCGAGTTCAGAACA
AGATACATAATCAATTTAAAACACTAAAAAACAACTTTTACATAAGTGTT
GTTAGTACTACTTTTAATTTGGAGATCGTTTTAAGGGTAAAAAATGACTC
TGAATGATAGTAATCCTGAATTACTATAGTTCCGGATATTTCAGAATTTT
GATATCTGAGAGAAAAACTGAGATCAGTTTTGGATTTTGCGCTCATAGAT
AAAATTAAATTCTTGTCTTTAATTCAATTGTAAACAACCCTCCTTCCCCT
AATTGTTCCCCTCTGTTATTATTAAGTATAAATATGTTATATTTTGTTTT
TTTTGTTTTTTCAATTGTAACTTAACTATTAGCTTAATGAAAAATGATCA
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TTGAAAATTATAAGCAAATATTGACTCTGTTATTTCTTTCCAATTAAGCT
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TGAGGAACGTTCGTTTGACGTCGAAAATAAATATTGCCCTAAAACAGTAT
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TATTTGTGGAATTTATCCATTTAAAAAAATTTGTTAATTTTTCAATTTTT
AATATATTAAAAAAAAAAAATTTAAACCTTTTCATAATTTGAAATTTTCA
AAAATTTTTCAACACATATTTTTCCACGAATAATTATGCTAAGAGGTCAA
ATTAGTGTTTTTCGATTATGTATTATGCAATACTTTTAAATTAGCTCAGT
TTGTTCAAATCACGTAAATAAAACCTGTTGTATTTTGAAAAAAAAATAAC
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ATTTACATTTAAGTAAACATAATAGAGAGTGAAAAGATAATTTTTCATCA
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TCAGAAGTATATTTAATATTTAATCTAAGCAATTTAAAATAATTCTCCTC
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TGCTCATAAAAGACAGAGAGTAACCTTGATGATTTGTTGCAGAGTTAGGA
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AAACCTAGCAAATGTCCTTCATCCCCTCCTCCTTTGTCGCAGCTGATTAT
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TTCTTTTTAATTGGCAAGGTTACAATGTTAATTTTAGGTGTTCTTCTTTA
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TACAAATATTTATTTTGAAATTACGTCATATCTAAAAATTAGAAATCATC
TAGATCTTCAAGAGCATCGTTATCAAAAACCATGAAATTCTAGTTACATG
TCTTGAATTCCCTTAGCAAAAGCAAAAGTTCAAATTAATTAAATATTCAG
TGACATATTGAATATTTCAAGTGGCTTAAATACTTATATATAAAACTCTA
CCCTTTGGTCTGATGGGGCATGCCCCAGAGTTTTTATTATTTAGTCCTTT
CCATCAAAACATTCCATAATTGTACCATTAGTATAACAAAATCTAAATAA
TATTAAATAATTATTACATTATCATACTCACAAGTGCACTTAATTCTTCA
TCTTTTTTATGGTTCAAACATGTACATTTTACATATACAAGTGATAAATT
GTACCAAACCCAACTTGCACCACCTTATTCATTTTATTTTGTTTGTCTAA
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CATTTTCAATTGCAGGTGTCCAATATGTTTATAATGAGCCTAGCCTCTGC
CGATTTGACTGTGGGTCTTATTGTCATGCCCATAAGTTCCGCTTATGCAT
TAACTGGTAGGATTTTTTTAAATTAATTGTTAAAAATACATTACGTATCA
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TGAGTTTCAAAAAGTCATAAAAATCACACGGGTTTTGAAAGAGGCATTGT
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GACTTTGAAAAAAAAAATATATATACATATGAGTGTGGGTATATCAGCTT
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TTTATTGAGTCTTATATTTTTTTTAGATACTTAGTAGTGTTGACTGGTAT
ATCCGTACTAATTTTACTGGACTATTGACACATTTAAAAGGGTACTACAT
TGAATTAGTATGGGAAATATTATAGCGTCATTACGTTATAAAATAGTAAT
CAGTCGATGACTTAATCCCTCAAATTTATACTTCCCTTCTAATCCCTAAC
TAAATTCTTGTAGATACAACTTTATTTACAAGAAAATGGGGCTTTACTAG
GTGTTACATCTGTTAAATATGTTTATTGAAATGCCAATTTTGGTAGTGGA
GCTTTCAAGAAAATATTCATATAGTTAGAACACTATCACAAAGTCTACAA
CAATCATTGTATTAGTTGTACATAATTATATGATGATAGCAAAATGAGAC
AAAAATACTATTAATATCCATTTCACTTTTAATTTAAATTCATAAGTACA
TGCAWTGTATCCATTAATAATATCTACATAAAGGGACATTGACGTCAATT
AATAATTTTAGTTGAAATTGATGATTGTCAATCAACTTTAATCATTAATT
TTGATGTGTATAATAAAATAACAAACATTGGCGTATCAATTCATCATTTT
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ATTTTGTAATACAGTAAAACTCTATGATATCATTACCTCTACATACGAGT
TTTTTTAGATGCGAGCTAGATTCTGATCAGAACAAAGTCAATGAAATACG
AGTTTTTATTTTTATTTTTTGGAAATGAGTTTTTCGAGAGTTGGTGACAG
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AATTTGTTTTGAATGAAAAGCTCCGTCCAGGAAGAAATGAAACTTGTCTG
TCAAGAAATTTCTGACTATGTTTTGAAATTAGGCAATATTTTATTTCATT
GTTTTTTGTACTTTTGAGTACAATATTAGAATAAGGTCATTTTAAAGTAC
TTAACGACTGCTACACTAATGGACAATCAGAATTGTNNNNNNNNNNNNNN
AAAATTAGAATCTCGTGAATTTCTAAGAACATAAATATGTGGGTTTTTAA
ATTGATCAAAATTGTAAATTCTCGATTTTTTTTTTAAACAAAGAGAAAGT
TGTTGGTGAGAAGTTAGGATTTTTTGAAAAGCAAGTGTTCCTGCATTTGA
AAAAATATTAAAATGATTTTCTCCAATTAGCACTTATAAAAGTAATGGTA
GTACTTTTACGATTAAGCGCAACTGGGTGGCCGTAAATAAGAAATTTGCA
TTCGTTTCTGTTTAATACTCCATTGATGAATTTTCAAATTGCATCCATGA
TGTATTTGAGTCAACAAATTATTCAATAGTTTAAATCTATTATTCAAAAG
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AATATTGTAACAAGTTTTTTTCAGAAATGAGTTAACACCGAGGATTAAAA
AAATTGATCACAAAGGATATTTCCAAAATTTCACTTATTACCGAATATTC
AAAAACAATTCTGCTCAAGGCACTGCGTCATTCCAATTCTATATAAATAT
GAACTCTATTTTTTTTGCCTGCTTTCTTTCTCATATTAGTGTTTTCATTA
ATGATTCATTGAACTCTAATTAGCTTTTGTTAAACTGTGATTTTTTATAG
TCTTCATAAGTATTCTTAAACTGTAAACTGATTTAAGGCATTTTTGTTCT
TTTATTTTTGGTGTTTAGGTGGGACACAATAAAGATGTGTCGTGTTGCAC
TCATCTAACAAAACTTAAAGAAAATTAACTCTTACTCAATACCATCTACA
TATATAGAATCCTACCATCCAAATGAAATATATATTGCATAATTGGATTA
GATGTCCCCTAAGAACATTAAAAATATGTTAAGTGTTTCGTTTTGTTCTT
GTTAATTAAATAAATATAATTTTGATCAATAGTGAAAAATAGTTAATTTT
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TTTCCTATTTTTTTGTTATTACGTGAAATATATTAAAATCCTTTCTGTCC
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ATATTTGTGTAAAGCACAGATTTCAACCTACATACTTCTTTATTATAGAC
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TCTTCTCATCATTTTATTGTGCATTGGAGATTAGCTCAAANTGAAGAATC
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TGACTTAACAAATGTATTGAAATAATTTTCTTAAAATAACATTGGTTATA
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AATTCCCCAAAATTGGACTCTTCCTATGTTGATATAAAACACAATACATT
TCCATGATCTATTTCTTATCGTTTTTCAGAGGTATTTTATTTTTGATTCG
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GGGGATCAAATTGTCGCCAAAATATTTTTCTACAAGTAACAACACAAAAT
ATACATTTTTAACTTTTTTATTGAAAATCAAAACTATGACGAGCATATAG
GTATAGAMTAGCCATTCATTCGATATAATCACCGTTGGCNNNNNNNNNNN
NNNNGGTGGTATGTCTCTCGACATAGTCTCAGATAAAATAGTCCAAAGGA
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TTTGATAATGTCGTCTTCAAGTTATCAAGGTTTAAAGTAGGCGAAAATTT
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AACACAATAGTATTCCAGGAGCCAACTACCAGGCGTTCGAAAAGACTTGG
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CATCCTGTTCATATTTTTTAGTGCGGTAGTTTTAGAAGGGATGTCATCTA
TTCATGTCAAATTAAATACTCATGAATGGAAAACGAATATCAAAATAAAG
AAATTTGCCTTTCTAGTCTGTGCTAGTTTGGTGAAACCAAACCCAAACTC
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TACTGTGCTGCAGATGAATTATTTTTTTTTTTTTTTTGACCTGACAAAGA
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TTTTCACTCTTAGATTGACTTCAAAGGTCTTTTGGGCAGATTCTGCTATT
ATTTTATTGATTGACTACTTCCAGTTTTATCTTCAATGTTATATTCAGCT
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TTCATAATGTTGATATTAGTGTGACCGTCACTGAATATAAAGGTAAACAT
GATTTTTGTGCTTCCGTTCTCCATTTAAGAGTATTTAATTTGATCTAAAC
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TAAAATTACTTGTCAAATCACATAAAAACTTTTTTTAGACGAATTAAATT
AAATTATTAAATTAGTTTTTTTTATTTTTCTATGCACCGAGCAAAAAGTT
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TTAAGCGGAACCATTGGTTGAAATTTCTTATATATCGTATTTTTTTTATT
TATTTATTTTTTGTAGAAAGGAATACTTATTTTGGGAAAAGATTGCAGCA
TAACTTTAAACTTGAAATCTACAATTTCTTGTTCAATAAATTTGATATTA
AATTATATCAACTTATAAGGGAATTGGGAGTGTGAACAGTAGAGATATCT
GATAATAAATAATTCTTCAATGTCAATTCAGGTAATTTTTTAAACAATAT
TATATTTGGATTGTTCATAATGAAATACAGTCAAAACAAAAATCATGATG
ATTAAGCACATTGAAAAATTAATGTATTAATATTTTATACATTTTATTAC
ATAAAAGTCATGAATCTTTTTTTTAATAAAGATATTTTTATTATAAACTT
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ATTGACCGTAGAACTCATCACTAAACTATATATAATTTCAAAGACATTTT
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ATAAAAACATAATTTCAACTAAAATTTTATATGAAAATTATTATACAATA
ATAAATACCCTACCGAGTGGTCCATTAAAATCTGGGTAATATGAATTTTA
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TACCCGCTCTGGTTGTAATCTTCTGTGATGGCATCCCATTGCTGGCTGAC
ATTAGTTTTGAGGGCCTTGGTGTTTAGATGACCGACACTGCAGGTCTTCC
CTACGATATCCCTCAAAAGTTGCAATTAAAGGGGTTGGCAACAGGAGGCC
CAAAAGAACTCAAAAACTCATTTAAAACAGTCTTGAATCGGTGGATAAGG
GGTTCTTTGATTGTTGGTGTCAAAAGGGCCCTGTCTGCCCTCACAAGGCT
CTTTCCACCAACTTTTTGGATACCTCTAGGGACAGTCTGTTGTGAACCCC
CGATATCTCTTGAATGGTTCCTTATGGACTTGAGGGGATTGGATTGGACT
GTTTTCTATAACTCTTCCGGATCCAGTTTGGCCTTTTTGACAGAGCCCTT
GTTATTCTCCATGTTTCGGACTTTTTGACAGAGTAGACAGTGGTTCTGGG
GACGCCCAACTAATAGAGCGCTCAAATTGAAATTCGTTAATTACGTTCAA
GAGTCTATTTTCTCGTTTTGTACGTATGCCAAGAGAGTTCAGGTTTGTTT
TGTTTCTAATTAATTGTTTAAGCTTTAATTTATCGAAATATGCATTCATT
GCTCAATACTAAACCTTAATTAATTATTAAATTAGTAAGTGTTCATATTT
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GATACAAAATTATGTCATATTGTATAATGGTCTTTCAAACACTAATTAAC
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TTATTTGTAATTTAATATATAACATCAAGTAAACATATATTTGTAGTTTT
AATCCCTAATAGTTTGGTATTGTGGTCTTAAAATCCTTTAAATTACATTG
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ATTCTAAATGTTTGGATTTTTTAGGGCATAAATAGATATGATTTAAACAA
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GTCAAATATTTTATGAGGCAATGACTGTAAGTACCGATTCTAATACCAAT
ATAATACTGGTCTACAGAACAATATCACTCCTTATAGGCTAAGTGGTATT
TAAAATACCTTATCTTAGATCCATAATTATTTATAAAATATGTAAGTTTA
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TAACTGAGGAAAATTGGAACAGAGACTTTTTTTAACGTCGAAAATGATGA
CCATAAATCATACATAATAATATGTATAATAGGATGTCTTTATAAAATAA
ATCAAATAATTGAAAGCTTTTCTTTGAAATATAAGATAAAAATGATTTTA
TGGGGGAAAAAGTAAAATATATATTTTTCTAGTATTGTAATCCTTTTTTT
TTATGTTGTTCCAAATTTATATATAATTTGATTTTTTTATTATTTTGCTA
ATTTATCAAAATTAAGAATTCTCTCATTAAAGATAAAAATGAAATTTTAC
ATAGTTAACTACAGAAAGTGGTGCCCTTTCCATTATTCCTCTATATTATT
TTGCATGGAAGCTTAATCCAAATAATAAATGTGACGTCAGTATTGCTGAT
GTCGGCAACTTTGATAGCCTAATTATCCAAATTTTGTAACAATAAAACCT
TTTTTTATTAATATTAAGAAAAATAGGGAATTAATTGATGTCAAAATGGA
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GGGTATCATATTTGATATCCAATCATTTCAAATAATGTCTACAATTGTGT
ATGAAATGGCTCAAGCAGGCTCAGTCATAAATGGATAGCTTTAGGAAGAA
ATTATGTACCTTTCTTATATAAATATTATCATAGATTTTGCTGAACAAAC
AATTCTAATTCAATTTATTATTGTGCAAGGATATCCAAGAAATAAGACAT
TATCTTGTGTCTACATCGTACTCCAATTCTGAAAGTGATTATTTCAAATT
GGAACAAGATAAATAATATGTCCAACCACCTCCATCAAGTTCTTCTGMTT
ACTATTCTGAAGTTTTTGACAAGCCTGTCGATGATACATTTTGTTAAATG
CCATTATTAGTTTTGCAAGATGCTAAATGTATATATATTGACAACTAATT
AGCATATTTAACATGTCAAGATGCAATCAAGAGAGTCAATGAATGTCAGC
AAAGATAACAAAATCTAGCACAAATAAGAGTTAGAGGGAATTCGGCCGCT
TTAGACAAAAAAATATTTTGAAGGAAGTTTAAATATTAAAAAATAAATGG
GTATCATTTTTGGTATCCACCATCGTTTAAGGGGGTCGTTACGCCTTACT
CTCAATTAATAATTTATCAATATATTTCCAAGTTTTATTATATATTATTA
TACTCTAAAATGTGGGAAAAATATGTTAATACATCATTATACAATCTTAT
TTCCACATTATAGAGAAAAATTAACTATCACAATGGAAATAATAAAATAT
TTTTCTCCAACTATCCTATTTTTCTTGTTCCTAATCGATAAAACAATAGT
ATTTTTTACTTTGATTTGATTAAAATATCACTACTTATTATTGACATCAA
GTATTACTAAATTATATGTTTTTTTACATAAACCATTTGATGGAATTTAT
GTTAGATTTATTAGAGATTTGAATATTTACGTTGTAAAAATATCAGTTTA
AGCTGCCAGGATCGTGTTTCCTTTAAATATGATGCAGTTTATGGCGTTGG
TGAAAATGTTTTATATAGTATGTCCAAAGTAAACCCTGGATTGATAGTGC
CCGTGGGCGTCCATGCTCAATTTAAGTTGAAAAAGGGGCCAAAAATCATC
AAGAATAAAAATAGAAATAGATATGGAATATATAAAATCTTAATATTCTA
GCCATTAAATACATTGACAGTAAATATTCTACAACTTGAAAATTCTACCT
ATTTAATTAAAACTCAAGATTTATTTATCTTAATTTCTAGCTCAAACATC
CTACATAGTACTAAAATAGTTTATGTGTACTTGTGTTTGATGTACAAGGA
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CAGAAAAAGGGAGAACGTATATTAAATACGAATTAAAAAATAGAATTAAG
AAGAGGATGAGCGAGTTAATCTAAGTATGCATTTTTAATCTTCATTATGG
TTGAAGAAGAAACACTTCAAGTTAGCACTGTCAACGACAATGGCAGTAAA
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TTGATTATATATACATCAAATGGATAGAAACAATACAAAATATTTGTATA
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CCCAATCTATAATTTAATTGGTGAATGCTTCTACGAGCAGCCATTTTTAT
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GTACTGATAGAAAAAAAACACACACAGAAAGAATGAAAAAGCAGCTGTCC
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