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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s84 | supercontig | LSalAtl2s84:948400..1079594 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011971 >EMLSAP00000011971 ID=EMLSAP00000011971|Name=EMLSAP00000011971|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=427bp
SRIEKINYRQKEKQVLDSILGTGYDKRIRPSGKNDTDGPATINVNIYLRT ISRIDDVKMEYSVQVTFREQWNDERLRYYDDTHGHLKYLTLTDPTKVWMP DTFFRNEKEARKHEIIVPNVYVRIFPNGEILYSIRISLTLACPMDLRLYP LDKQVCVLQIASYGWAKDDLIYLWKEKDPVQVVPGLHLPRFTLEQYKSAY CDVTTNTGEYSCLKVELIFKREFSYYLITIYVPCCMLVIVSWVSFWLDQN AIPARVSLGVTTLLTMSTQTSGINAQLPPVSYTKAIDVWTGKKRNSEYRN NIRVDPXGDLVYKSTTSYPHQYNSMYPHHNILSGGPPNSYNSATPCEIHX PVEHLQAYANSRNGEIDEKNCNWYCCKTRGLLAKFPSRAKRIDVISRFIF PLIFAIFNLAYWLYYLFAKSKSPQLES back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s84:948400..1079594+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011971-707818 ID=EMLSAT00000011971-707818|Name=EMLSAT00000011971|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=131195bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s84:948400..1079594+ (Lepeophtheirus salmonis) TCCAGAATAGAGAAAATAAATTACCGTCAAAAAGAAAAACAAGTATTGGA
TTCTATCCTTGGAACTGGATATGATAAAAGGATTAGACCATCCGGAAAAA
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GACCTGGCACGAAGTTCTAACACCTGTTCCTGTCTATGACAAACGTTTTT
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ACGATTGTGATAAATAATTTCTCTTTTTTCATTTCCTCACTATTCTAACA
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AATGCGAAAAGGACCATTAAATCTTTCAACCTCCATTGGGCTCATTCGCA
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TTCAGCTATGATATAAATCACTTAGAAATAAGATACACCAGGTATTAGCT
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TTATTCATTTTAGTCAAGATAAAGTAAGTAAAACTACATTTTTCAAATTT
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AAAACATTTTTAACTATAATATAAGCTTTATTTTACCTAGTATGGATACA
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GGGGATTGTGTTATAATTTAAAAAGTCACTGACGTCTCCAGAAAAACTAT
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TTTCTCTTCTTTTCATCAAACGTCAATTTTCTGAGGAAGTACCACTTATA
ATGGTTATAAATATATTCCATGAAGTATACACGACTAATGAGGTATCATT
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TTACAAAGATTTTTTTTAAAGTATTAATTTACAATTAAAAGAAATAATTA
TAATCATGATTGGTATATTTACAGGGTGGACTATTAAAATCTGATAAGCT
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TGGATARTTTGCCTGAACCTACCTGCCGTCGGACGCTAAGACCCCCAGGA
TCGTTGTTTGAGCTAGATGTTTTGTATGGAAAACCCTCCTGAGCTCTTCT
GGTGATTCCCAAAGCCAACGGTCGTTCTGACGGTTGTATTTGTATACCTT
GTTCACGGTAAAAATCTTCTTGTAAGATAATTTTTTTACTGTGGATCCAT
TTGCCTTGATCCACGCACGAACTTTCTTGCACCTCTACAGTCTCCTTTCC
CTCAATAGTTGGTGTGGGGTATTTGTGTAAGAGGACAACCCCACGTTCTC
CTTCACAGCCCTCCTGATTGTCCCCTCGTCCACGTCAAACTCATTACAGA
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CTCAGAAACTCAGAATCCCTCTTCAAGTTGTATCCCTCACTTCCTTCTTT
CCTTGAGAGGTCTTTTCCATCCTTTTCATGTTGGTCTACCTTGAAAATGA
GGCTCCTGGAGNATCTTCTTCTTCAGTTCCCTCAGAAACTCAGAATCCCT
CTTCAAGTTGTATCCCTCACTTCCTTCTTTCCTTGAGAGGTCTTTTCCAT
CCTTTTTCATGTTGGCTACCTTGAAAATGAGGCTCCRGGAGCATTTCATA
ATGTCCATAATCTTTACCTCCTCAATTTTGCAATACAGAAGGMCTGAGAT
CCTCTTCCTTTTTGCTTCTTGCTCACTCATTATGAAAGATTTGAGAATTG
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GAAAAATCACACAAACTCTCTATTTTAATTATATATTTAGTATTTGTTAG
TAGTCCACGTTTTGCTTCCGAACCCTGTATATTAAATTATAAATTGAAAA
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TTTTTAATTCTGATGCATCGGTATATACCAAGAATAAATTGTTGATATAC
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GTCATCGCATCGCTAAGAGCCTGGCCTTCCTGAGTGACAAATTTTTGGAC
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CTCACAAAACCTCTTGTTTAAGTTTAACTCTTGAAAAATTAAAGATAATA
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CGATAGAAGTTCAATTCTTTTTTGTTTGTTGTTGCTCATACTATTGTATT
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GCAGTTTTCCACGAAAAAACCATTCAAACCAGAAAAGTTTAATTAATTCT
ACAATGCCAAATTAAAACAAAGATTAAACACTAAGATAAAGGATTATGAA
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TGATCTGCATCTCATGATAAAGACATTGTATTAAAAAAATCTATGTTTAA
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CATCCAGTAACGTCTTACATCGTTCCAAAATGGAAGTAAAAAAGAGAACA
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ATTGATTTTTTCAAGAAAATCCAAATGCAATGTCCCCACAACGATTATGT
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TAAAAAGCATGCACGGTATTTTTGATATGATAAAATTAATGTTCTCTTAA
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CCGGTGTTTTTCCATATATATTTTACAAATTATGACATGCAATAATCCTG
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AATTAAATATTCTATTGTATTTAAACGGAAAAAATATTTTTTAAAGTTTC
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GAATTTCAGTTCACAAAGGAAAAAAACCATAATATTTCAAAATTCTGATT
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CACCATCTCCGATTATTTTTTGAAATTTTGCATATAATTTAACATTGAAT
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CAAGGTAAGTTATGAGTAAGTTAGTTTGTTGACATTAGATTGAACATGAT
TTAATTTACAATACATTATTAGACAAAGGTTATTATAATACATTGTTATA
AAATAACCTTTGTATTTGTAACTTTAAAAAAAGAAACATCAACAAAAAAT
AAATTTGGTTCAGGAATATACTGAGATTATTGTTACGAAGTAATCTGTTG
ATTATTTACTAATACTGACTATTTGATTTACTGAACTTAAGCAATCTTTA
TTGTTATATTTTCACTTTTAAAGTGGTTCACGTGTGGGTACAAATTTTTT
TTGTCCTCATCAAAGCAGGTGTATCTTTGGGAGTATTGCCGTACACAATA
CCGTTCATGAGTAATTCTGACGAACTTAAACTTCCTTTAAGAAACCCATG
AGGCCACCAGGCTAAATTTCTAATTTTGGTTTTGCTTATTTTCTTGGTTT
TATTTTGAAATATAATCAGGTTTTTGGGTTTTTTAATTATTGTTCCTGAA
TAAATGAGCTACTTTTACATTCAATTTAAATAGACAAACATAAAAATAAG
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CTATACATCACAAGCATTTTAAGTCCAAATGCGTCCCCCTCCCCATGCCT
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AATTAAAGCCATATCTCAAGGGATCAATATAATTTTTCCGCTATAACAGA
TATGTTTTTTTAAAAGATTCGTCTGTTCATTTCAACTTTTATGTATTATT
TTATATTAAAAACACAATAAGCTAAGGTTTTTTACTCTTCAAAATTACCA
ATTCTTATTTTGCTAAAATATTAATTTGGAGACAGCATCTACACTTTTTA
TATATTTTAAATTTGTTTTAACGATAATTTTTAGATGGAAAAGGTTTCAA
AGGTACAAAAAAACTCCTTCTCTATAGCGAAAATCAGTTTTGAACGGATA
CTTTAGACAAAAATGATAATTATATACTCTATCCAACAACTATTTCACAA
TAAACATATATCTGTCTATGTGTTGACGTCTTAACAACGATCTTCTGAAC
TATGTATTAAATATAGATTTTATAAAGGTGACTAATGTAGAAAATTTACT
GGCTTTAGTAAATCAATAAATTTACAACATAAGTATTAAAAATAAAGTAA
TTAACTCAATAAAGTAGCTGATAGAAAATGACTACAAGGCGTAGATAAAT
TCTGTTATTACGTGACTCACAACTAAATTAATTTCACAATAGGTAACTCA
TTGTACGTTAAAAAAGTGGTCATAAAAGTATAGTATAAATGATATATTTT
TTATGAATGGATTACAAATGTATATTCCATTCTGAGTATTTATTATATAA
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CGTTACTATGAAAAGGCCTAATTATTATTTTTTGATATTCTGTTTCTGCC
GTCCTTTTTATATAAACAAACTATACTAATCATTTAGTCATCTCATCATC
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TGGTGTTAATGTGATGAAGATTAAAGACATTGTTAAGTGTTGTAGGAGCC
TGATTTTATGTTGGCCAAGATGAATAAAAATAGAGAAGACCTCTCCAGAG
TGTCAAAAGTTGAGGGCATAATTTAGAGAGAAATACAAAGTTTTTTTTAG
TTTATTTCACAAGGACCCCATGCATCTTCTGACAGAGGTCAAGAAAGCCA
GGAGGGCCGAGAGGTCCAAGAAAATCCTCTTAGGGGTTAAGGGAAATGGT
CAATTGTGAAAATTTTCTAGGACAAGAAGAATTTCACAGTTGATCAATTC
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TGGCTTCTGATGGAAAGAATGTGCCTCCGTTCTTATTCAAGGCTGGAAAG
AAAATCGGTCAGAAGGCCTACTGTAAAGTGCTTAGGTACACTATCTTGTA
TGGCTGAATACCAACTAACCGGATGGTAACTAGTTGTGAACTCAGAGCAA
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TGGCTTGATCCTGGGCCAAGGAGATGTGACCCCCTTCCTCACCAGATTTG
AGCCCAATTGACTTTTCTATAAGGGGCACTTTGGAGAGGGATCCAACCGG
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GACAACTTGTCAGAAGAGMTTGTCATGAACTCCTGGATGGTCTTCAGGCC
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TCGCTGTCACGATGACGTTTTATTAGKCCAGCGGCAAGCAGCCGTGAGGG
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TATATAATCTAACTGCAGTCTTCCTTGGCCAGATGGATTAATTACAGTAC
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AAATATATACCCTAATCCTGACCGTTTGGATCCCAAATGAATATTTTCTT
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TTAAAAATGTACTAGCATCACAATATACCTATATTTTCTTACTTTATTTA
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TATTGTTGTTTTCCCAGTCACAATTTTTTTTAATATAAATAAGTAACATA
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TTATGTGAAAGAAAAAATAGATTTTAAAAATATGCTAAAAAAGAGAAGTA
AAACTCTATTTTGGATTGGACCACATTAAACATCTCTCCTGTTTTCCATC
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ATAAACTTGCTCACATGTCATACATATTTTGTCTTTCTATCTCAAAATTG
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CTTAAAAAATAACTTTACTAAGGAAGCAAAGAGTTTATTATTGGAGAAGG
AGAACGGGGATTTAAACTTTGTCGAGATATTCGGACAATTAACATTTTGG
TGGATCATGAAAGTAGATGGAAGGTAGAAGAGTTGTGAGTTTGTCTTTAA
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TGGAGATGACTTTTTCTTGTATCTCCTATAAGTCATTACAATATAATTAT
TTTTAGAAATACCTGGTACGGGAGTTTTAGTGTTCAAATCCGTCTCTTTC
CGTCGACTTTGGGAATTTTCACTCTTGAACAACGATAAACTTGAATAATG
TTGCTGTGTCGGGCATAATGATCTACTATGGCCTCATTCCTCTGTCCACC
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AAACTACTAGATTATGTAGAGAAACAAGTTTCCCTACATAATCTAGTAGT
TTTCACACGTTTCATCTACTCTAATGATTCTCCAAAGTCGATTGTAATGT
GAGCACATTAGACCTCACTTGTGAAATGATTACACAATGATTTAATTTTA
TATTCTACAAGTAAGTGGTCAAATGCCATACTGGGCTATATATTTGGAAA
GACGACATATATTGGTTCGGTAGGGACGGMTTATGGTAGTGGGYACATTC
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GAAAATTATTGTTTAGAGCAGGACTTCTCAAAAATTACTTTGCTACCGTA
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TTAAAAATAAGTAAGGACACAAATGTAGGAAGGCTATGTGAAATCTAATG
GCTGAGMAAGCAATAATTTAGAGTCCTTTGGATGATTCCGAAATAAAAAT
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TATGTGCAATGTACTTACGCATTATATATATACGAAGTCCGAACAGGAGA
GAAAGTTAGTTGTGCAAATATGCCAAAAACTTGCATACATACATTGTATA
TGGGCCCCAGCATAGCTGGTTTTTGTTAACTTGTAGATAAAAGGTAATAA
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ATTGAATGGTTCACAGAGTAGATAGATTTGAAATAAATGGATCTTTGAGT
GAAAGAAAAAATAAAAAGGCTTGAATCTCTAATAGAATAATAATGATTAT
GGTTTTTTTGGTTTCTTTCACACAAACTTTCTTTGTACGTATAGACAAGT
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TAAATTAACTTCATTCTATATTGTACACATAGTTTTGTAACCAATCCCTT
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TATGCAAAGGGATCGGAATCGAGAGCGCATGGAAAGAGCTCGTCGGCAAT
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GGGGCATAATGACGGAAGTTTTACTCTGGTAAGTTGTCAGAATATTTTTA
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TATTGTTTCGATCCTGGTATCTTACTCCCAATGAAGGAGTCAAATCTACT
CCCTTATGAGGTGTGGTAGTTTTCCTCGGATGAACTTTNNNNNNNNNNNN
NNNNNCTAGATTCGAACATCTCTTGAGATGGATGATCAAGTTAGAAGCAT
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TTAGCATTGAAATTTGAAAAAAATATTCTGATAATGTTGATTATTTGCTT
ACACACTCTCATATAAATTGTTTCACTTCAAAATGAACACAAATCCTTCA
AGATGCATATTTGATAAATATATCTTTTTTTAAATTATACGGAACTTATA
TTATGGAAAAATATTCAATAATATTCCTCATCACTATATATTATGGATAA
ATTATAAGGGTCTATAAAAAAAAGGTCATTTTTTTATCATTTTTTTAGCC
TAAAAATAGAAATTTATTGATGTCATAACAGGATACAGAATCAATTAAAG
TACTTTTTAATTATAAAAAACAATTTTACATAAGTTTAATTTATCCCACT
TTTAATTTGGGATTATTTTAAGGGTAAAATAAGACTTTGAGTGATAATAG
TCCCGCCTTACTATAATCCCAGATATTTCAGAATTTAGATGACTGACTCA
AAAACTGAGATCCATTTTTGATTTTGCGCTTATAAATTAATTTGAGTATT
GTATTCAATTCATTTTCACAAAATGTGTAATCAATTTTAATTTAATTTTG
ACTTGAAAAATGTAAATGCAATTTGCTTAACATTCAAAAGGTTAATTGGA
ATAACTTGTTCTTGTATTGACGGGCCGAATGCGCCAATGGTTTAATACTC
TCCATATCTTTTCAGAAAAAGCGCAACTCCGAGTATCGTAACAACATTCG
TGTTGATCCCCMCGGGGATTTGGTCTACAAATCAACAACATCCTATCCTC
ATCAATACAACAGCATGTATCCTCATCACAACATCCTCAGTGGAGGTCCT
CCCAATAGCTATAATTCCGCAACGCCTTGCGAAATCCATATRCCCGTAGA
GCATCTCCAAGCCTATGCCAACTCTCGTAATGGAGAAATAGATGAAAAGA
ACTGCAATTGGTACTGTTGCAAAACGCGAGGCCTCTTAGCAAAATTCCCT
TCGCGTGCCAAGAGGATTGACGTCATTTCTCGTTTCATTTTCCCTCTAAT
TTTTGCCATTTTTAATCTTGCATACTGGCTTTACTATCTCTTTGCAAAGA
GTAAGAGTCCACAACTTGAGTCATAATAAATAAATTCATACATGACGTCA
TGAGATCATTTCTTTTTCTTTTTATCTGGTTCACTTTAAATGATTCTAAC
ATGAATTAAACATAAACTAGCAAAATGCAAAACTATTTACTACACAATTA
GCATAAATTAATTATATTTATAATGATTAGATATCGTACACAAAA back to top
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