EMLSAT00000012120, EMLSAT00000012120-707967 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012120
Unique NameEMLSAT00000012120-707967
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s86supercontigLSalAtl2s86:692955..707462 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012120 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012120EMLSAG00000012120-694886Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000054306EMLSAE00000054306-763234Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054307EMLSAE00000054307-763235Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054308EMLSAE00000054308-763236Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054309EMLSAE00000054309-763237Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054310EMLSAE00000054310-763238Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054311EMLSAE00000054311-763239Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054312EMLSAE00000054312-763240Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054313EMLSAE00000054313-763241Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054314EMLSAE00000054314-763242Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054315EMLSAE00000054315-763243Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054316EMLSAE00000054316-763244Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054317EMLSAE00000054317-763245Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779380auto779380Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012120EMLSAP00000012120Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012120

>EMLSAP00000012120 ID=EMLSAP00000012120|Name=EMLSAP00000012120|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=810bp
MWTSEIHFWMAYALMSFNNLELVGCNFDFYIDSHQTKLLYGLDFREIYFI
RNGVINQNAITFLNEEIPTYVDRLIFHWHLSQSRTSTSYHMQVIHLPGPI
MRTPILNISSNGFLSFEDTVFSIELPCTGRVRDHVDIMIKMTFISKLLDE
YNQSIEPLSLNFKRRKLCAKSSNYMMDGSKANENDDLEYPEQRLSPVAST
CIAFGSVLTTIIFLFVLLGFLYVTRKKRHPNIPLNSLVHLDYIPHQNFPT
NGYKCYSTPDSFSRLSMEKLCSMKETGYQGSPLNSCSKSFSLHFRNNTEN
SRQLLQNXSSPSSTSNHDPIHSNTIYKYLPSKDESSSLSNISPSVPRSLV
IEDGVLRLSSSSGYPPPTANKIQNISSCSSSYSSSISLNPQLHDQQPKSI
VSSPLTASSNTDDFFPNGETLGIKTLSEKDEEQSGISKNEGTGSDSSYIP
HLYSHLMPKNIKKASGRLPNTETQNSLLDHQTTISKMIKKQLIYVLIVIC
LVVAVVSSSCKTKTGKTCKFPFKYNGVTYRDCTTIDNGSTKWCATSVSET
GVLKDYGDCAGDCSVVNKPDSIGGCPTTNGRRCVFPFKYNEVTYNECTKE
GFGDTFWCATTVSSNGDTIAYGICTANCPKPSTLSSEVCGTINGKACVFP
FVYGEVSYKACTSVDNNDVPWCATSTNPSNHQYISYGNCKQSCKVIIETA
SSLASTIDVISISQSSVSNSPIKPAIDITIKPSKIDTTIVQPSRVDTTTV
KPSKIDTTTVKPSRIDTTTMEPQTSAPAQSINLKKPKRVSLKGSNNVGGK
RRGKGRNNGR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s86:692955..707462+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012120-707967 ID=EMLSAT00000012120-707967|Name=EMLSAT00000012120|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14508bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s86:692955..707462+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTCTCATTCCCCCCTTCTCTTTGCACTCGTACACAAATCCCATCTCTAAT TATAAATATAATAACAGAGGCAGAGAAATAAAAGAGGGCAAATAAGAGAA GTAGCTTGAAGAAAAGCAGAGGAGAAGAAAAAAAGGAATGAAATGTTGTA ATGTAAGAATGCCATCCATACCAAAAAGAGAGAAATTTTATACATGGACT ATAAAGAAACCGTACAACTTTAGAAAGAAGATAACCATCATGACGTCGGC ATTACATATTGATTGCTTATAACTTTATTCTATACCAAATACTTCATATT ATATTGAATGGTATCCTTGAGATACAAACATAGGATGATGGATCCCTGGC ATCCTCTTTAAAATCAAAGTGGTGAGAATAAGCTTTTTCCTTTCTTTTTG TATTTATTTTGTTTGTAGGAGGAAGAAGGTCTATGAGCATTTTTGGATAC AAATATGTATGTGGTATGCACTACGTACAAAGCATGCTTATACCATGTAT TTACAATTATATATTCTGTATGTGTTACATGGGTGTCCGAACGGGGAGAA GGCTGTGGGCTTTAGGTCATAGGCATAGTTTGAAATACAAATACTAGGGA TGGAGGAAGCCAAATCACATTATATAATAAATACACCATGAGGATCAGGG GGCTGGCTCCCCCACAAACTGGGTTCTCATCAATGAAATGTATTATCATA TGAGCATGTATATTTGATTTAATTACTCATTAGTATGTAAATAAAAAACA ATTTGGCTCTACTTTCTTATACAAATTTTAAACTCTTCCCTTTCCTAGTA TAAATTTCAAAATCTCTCTATGATTTTATAAACCATCTGCCTCCTCCAAA ATACCTTTCATATATATATATATATATGAAAGTTGAAATTGAMCCAGCCC CATCCCCTTAAAAATTACCCGCAGACACCCCAGATGTATTTTAACATAGA CTGACTTTGCAAGAGGATTGGGACCAGACATAAACATTTATAGTGCTATA AATCATGCAAGTTTTTTAGGTTGTCTGGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTT TAATTTGGTAATCTGACCGCTGAATTCTCTTTTCCTTAGCATTTGTCCTT ATTATTTAATTCCTGAGTAGTGAATTCTATCTCCTATATAGATTCAATTA TATTTAAAAACTGATTGAATATTCGTGTGTGCTCATAAAAGACGGAGAAC CCCCTTTAGGATTTCTGCGGAGTTATAATTGTAAGTCTTAGTTGGACTCA GAGATAATTAGGGATCACATTCGGAGTAATTTTAGCAAATATCCTTTTTT TTTTTTTCATTCTCCCCCTCCCCTTGTCACAGCTGATTAGTGCGGATCTC CTCCAAAACATTTCTCAAATTGTCAGGGTTACCATGATGATTTTCAATTC CTTAATTTTTACAACATGCCCATAATACACACAATCTTCATCACTAAGTA TGTATGTTTTATACCATTCAAAAGTGTTTCCCCCAGCACAAATATCTTTT CTGATGGGAAAAATAAAAAAAATGACTTTTTAGATTAATACAAACATTTA AATGAGAAAAAATATTGTAGGCCCCTTGGGCAGTCTCAAATAAGTTGTTA TGAGTCAATAATTGTACTTTATATATATTGGACCTTGTTTTTAATCATTT AAGAAGTCCAGTATGTACTCTCTGTTCAGACATTAAGTGTACCTACATTG TAAAAACGTCTATTTTGATTTTCAATATAGCAAGTGCCTACATATATATT TAAAAGTATATCCTCCTTATGATTTTTAAAGTTTCTTTAATCTTATTTTT TAGGCATAGTTAGGTATGTATTTCATTTCTACAAGAAAAAGCTACAGCTA TTGAAAAAAGTTTAACATATTATATAATTATGTTTTATTTTCTCATTTCT CATGTAGATTCAAAAATGCTTCTTCTTTTACATTGTGGAGGGCCCAAAAA ATTAAACAGATTTAAATATTAAGATTTCTACAAAACTTTGTGCATGTAAA ATGAGATTATTTTTTTAAAGCCATAGAGAAAGTACAGTAAGAATTTAAAC ACCACTTTGAAGGCTGTGAGCTGTTGTTAACAGTACCTTATTGGATAATG TAAGTATCATATTAACGAATAGGAGTCGTTATTGTGAATATGAGTTGTCT CAAAATTAATTCTGGATTGCATTTATATTATTTTACTAATTTTTGGTTAT TTTTACCTAACACATTATTCTGATTCATCCTTTGGAGGCACCGCAAACAG TACTTACAGCTTCAAAAGTGTATTGTCACAATTCAAGAATTATACATTGA TAAATTATATTTGAAAGATCATATTGGGGCTAAATTAAGTGTCATAAATC AATTGAAGGCTTAAAATCATAACTATCCTTCTTGAGTATTTAAACTCATC CCAGAAAATTATAATATAAAGCCCATTATTGACAAAAATAACCCATAAAA TACTTGGTTGTATATGAAGTAAAAAAAAGGATTGGGAACTTATCCTTACT TGATTTTATTCAGTAACGCTATGAGTTTTTTGAGTGCTCAGGACTTTGAA TCCCCCCACCCCCACACTTCCCAAAACTCAAACTTTTAATTACTTAACTG ACTATAATGAACATCCAATAAATACATCATAATGAAGACTAAAAAAATCA ACTTGGTGGGCGTGGATGAGGGCTGGTTCTGGCCGTTTAAGAAGTTTAAT AGGGGGGGGGGGATGCTAGTTGTCTTAAGAGATTTGTAGGTCAAGAATAA AACTCATTTTTTCCCCTTCTGAATATTCGTAATTCCTCCATTTTTGGGGA CCTCTGAACTAAACAGATTCCTTGGTAATAGGTCATTTGACAGACCATTG GATTAAAATATTTTAATTTGTGGATTAGTGTTTAACAGATTAGCGTTTTA TGGATTAACGAAAAATTAAGGGGTGCTCACCTCTGCTGGTTCGATTAATT AATTAATTATATTTGCATAATGTTCTAAAATTGTATGATGGTACCACTAT ATTACTATGATATCATCAATATTTCAGTCATCATATTTTTTTTTTTTTCG GTGAAACATGTAAATCATATATCATTATTTAATTTTTGATTGAACTTATA TTATTAAAATTAGTGATGGATAGACAGTATTATGTAAACTCAATAGGATA TTTCTAGCTTTTATAATAACATTAACTGCTGTGTTGTAATGGTGTAGATA AAAATATTTATGTGTTGGTATTTAGTAATGAATTCTGTGAGAGTAAACAA AAATAAAGTGATCAGAGAAAAATACTTTTTATTTATTTCTTTACACTAAT GGAATATTATTGACTACGAATGCAAAAATTGTGTGTGTGTTGTTTTTTTT TTTTTTTGTAGATTCATCAATAATAATAAAAAAATTATTTATATTTCAGC ATAATAATGTGGACTTCAGAAATCCATTTTTGGATGGCTTATGCTTTAAT GTCGTTCAATAATTTGGAACTTGTTGGATGTAACTTTGACTTTTATATTG ATTCACATCAAACTAAACTTCTCTATGGATTGGATTTCAGAGAAATATAC TTCATACGGAACGGAGTCATCAATCAAAATGCTATCACTTTTCTGAATGA GGTGATCAGAAAAATTGTTGTATGATTATCAAAGGATAATTATTTATCCT TTAAATTATAATTGAGGTGTTTTATTAACTGCATAATTTTATTTGCAATT ATATTTTATAGAAATTAAGATCAATGATAAAATTTAACGACAACAATTTC AAATCACACGATTAAGGAAAATACAGTTAACAAATGAAATAATTACTGAC 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TCCTACAAAATTMCTCCTCTCCATCCTCCACTTCGAATCATGATCCTATT CATTCTAATACAATTTATAAATATTTACCAAGTAAAGATGAGAGTTCGAG TCTAAGCAATATTTCACCTAGTGTACCACGCTCACTTGTTATAGAAGATG GAGTCTTAAGACTCTCATCCTCAAGTGGATATCCACCTCCCACAGCAAAT AAAATCCAAAATATATCATCTTGCTCTTCTTCCTATTCATCCTCAATTTC ACTAAACCCTCAATTACATGATCAACAACCTAAATCCATCGTATCCTCTC CCTTGACAGCAAGTTCAAACACGGATGATTTTTTCCCAAATGGAGAGACA CTTGGCATTAAAACACTTTCTGAAAAGGACGAGGAACAATCAGGAATTAG TAAAAATGAAGGTACAGGAAGTGATTCATCCTATATACCTCATCTGTATT CTCATTTAATGCCAAAAAACATTAAAAAAGCTAGCGGAAGACTTCCTAAT ACTGAAACCCAAAAGTCTGTTGTCATTTGATTTTAAAATTACAAATATAT CGTATATAACATATTATTTTCGGACTCTAAAGTATATAAATAAAAAGAAT ATAAAATTATACTGTACTGATATACATAGACTAATAATTATTTATTTGTA GGTATTATATTGTAAATATTTTATTTTGAACTTCAAATGAAATATTTGAG ACTTGTTACTCAAATATAAAAATTTAAATGAAGGTCAACCATCTATACAA TTATGAAGATATTAAGCTAATTATGATCAAATCTTGGTATAACTTTCAAA CAATATTTGAAAAATAGGTAAATATAAATTTATCTTATTTCCAATATCAA TCCRTTTAATCATAATATAAGAAAAAGTATCATGTCTTAACATTTGAGTC CAAGTCAAGTCTCCAGTTTTAGCTTGCAAAGTAAAATTTATGGATACTTT TTCAGCTCCAAATGATGTCATTGCATAGTATTTAAAAAGATGAAGAATGT ACATATTGAAGAAAATGAAACAATTTTTTACTTNGGGTGGTAATTGTTTC TATTGACTTTTGAAAGATATTGAATACATGATTAACTTTATAAATTAATT GTATGAGATTAATATTTAACTAGTGATTTTTTAAGTAATGATCATGTCAA GCTAATATATCAAAAGAAGTCTTTTTAATGGGCAAAAGCGTATTGTTACT TAACCGATATAATAAAAATAGTTTTTTAAATAATTGATAACAAATGAAGG AATGTCTATAACATATATTAAATGTTTGGTGAGGAATGCCATAATTTAGT AAGAAAGAGACAACTCATCATCTTCTGTAGCACTATCAGTAACAATGTAT AATACATCTTCTTCACGAATTACAATTGTGTCTCCATCTTCTTCTTTGGA ATCCATAGGATCCCTTGAAGATATTAATTCCTCGGGAGATCTTCTTGATA TTAATGAAATATCTCCCACAGGCATTGGTTCAGCACATGGTCCGGATTTA AATGTCGTATAAGGACTCATACCACCAAATGGAGGTAATCCGTCAGTTCC AGCAACTATTGCTGCTTCACGAGACAAAATTTCAGGAACATGTTGTTTAT CTTTATCCTTAGGTTTGTCTACGACTACGTCAAATGAAGATTGTTCCAAT ATACTCCCTTTCTCAGTATCAGTGTTAGCTCCATAATTTCTTTTAATATT ATCGACCCTCAAATCTTCTTCACCTTGAACTAAGCGTGATACCAAAGCAT CATTATTTCGTATAAATTCGTCTGTTATATTTTTAAACATATAAAGAGAT ATCAAGGGTACTAAGCACATAAACAGAAGAATCATTCCAATTAAAACCAA TGTAAACGTATTTGTGGGTATAATATGTCTGTATATATATGGTATTTGAC GGAAGAAAAAAGGTGTGATCAGAGTTAAGATAGATGCAGTAAAAATAAGT AAAAATGCAAATCCATTAACCATAATCATTTTGCCTTTATTAGGGGCCAA AAGTCCACCCATGATTCCAAAATAATTCTTTACTTAATTTTCATTAATAT TTCCAATCTTCCTTAATCAAACTATCTTCCAATAATTTAATTTACATTAT TAATTTAAAAAATATTTTTAGCAATTTATAATTAAAATTTGTGTTAGTGT TAAAATACACCTTCTTATTGTCTATAAACTAATAATTTCTTTAAAAATTT AGTGAGTCATATTTCCACCTTTTTTGATCACGTATTATTAAATGGGGTTT TACTAAAATGTTTTCAATTGAAATTGATACTTATTTATTTCTTATATAGC ATTCATTTATCCGATTTTTGGCTCSTGAAATACTTTTTTGAAATGATGAT GAAAGCTTTCCAAAAATATTATTGCAATATTATCATCGATCGTTATGAGT AAAAAATTTACTGTACTATCGAATTTGGATATAACTGTCGTAAAATATCA AGTAAAGTTGATTTTAATAGCATGAAAATGGAATAACTAACATTTTGTAC ACCTGGCTTTATAGTATCGGCTAACTAACAATGCACAAAAAATGAACTAA ATTCATATAAGTAAATCAATTTTGGTAATTATATTCAAATAAACTGAAAA ATTATTTCTCATTTTCATAATATTTATTTCTCCTAAATTAGCAATAATTT AGCACTTTAAAAGAGAATAACTTAACAATATTTTTCATTTTTATAAACAA TCATCTCTTCATGAATCACGAGTACATCATTATCATCTTCTAAAATATCC TGAAGGCAAAAATTTCCAATTTCAAATACATTAGACGCACTATCCGTACA CATAACTTGTCTTTTTCGAATGGTTGACAATGATCTACAAGGAGATTCTG 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ATAAAATGATTTTGCACTTTTTATGAAAACAGTTCGTGTGATAAACTATA ATTAGTCAGAATATTGATATACATATGTGACAAACCCGTATTTAAAAAAG ATTGTTTCAGTATTCATAGACACTTAAGGATTGATTAATCCCTTTGAAAA TTCTGAAGCATATTAATATGACATTAACACTTTAAATTATTTTCTTATTT ATCAATTGTAAATAATGGTGTAATGCACCTACATAAATATGAGCTTTATT GATTAAGTTTATTTTTTTTATTTTGTCTTAATTGTTTAGCCTTATAGTAT ATTTGATAATTGATTAATTTACACTTAAAGCAATTATATACTTCTAAAGA TCTCGGTATGTACATATGTATTTGTTAAAAACATAAGATTTTGTTGACTA CTGGTCTTAGGTTTATACATCATAATTCATAAGTGCCTTGCATTGAAATC CATCGATATATTGAATAATTTTTTTCCTTCCAGAATGCCATTTAGTTCCA TGGGATCACAGTCTAAGCAAAGTTACTGTTGATCTTACTTTTCTCAGTGT GTACGCTTCGTTATACAATATTTTCATAAATTAAAAACAACATGTCCATG TTCTTTTAAAAATGTCCAAACAAATATTTTCACTAATGATAATATTTTAA AACTAATAACAGAAGACCTATACTTCCTGGAAATTCTTGATATTGAATTT GATGAATAGCATTATTATGACCGTGATGTAATTTTTTAGTGCATTGGCAA AACAATTATTTTCTGAAGAATATAATAATATTCAAAAATATATCAAAATA ACTTCAATTAAAATGAAAACTAAAGCATAAAAAAATGATTCAATAGTTGA GTGGTGGGGATTAAAATGATTATTTATTTCATTAGGAATATTGATAATGT TCTTTAACCTTTATAAGAGTTTTCCTTGTATAATATTATAATTAATATTA AATGAACTCATAAACTGACAACAATCTACTCATCAATGAAGTAAAAACAT AAGAATACCTGATATTGTATCTCTTTTCGGAAGCCTTCTCTTCCTTATAT TTTAAGTATTCATTTATAAATCTTACCTTGGATTTGTTACCTAATTTAAA CTTTGTTTAGCCTCTTTTAAAGAAGCACACAACTATTCATACCAGAGGCA TTCATTCAATCATCTAAGTGTGATTACTCTGTGTATTAATTTGAATTATT CACTGGTTACAATAATTAAACCACATATTTTTCTTTAATCATACTTTTTT TCTGATTGTATCATATAAAATATCGGAGCAAATATAAACATTTCTCAAAT ACGGTACATATACTGTATATTTTCCCCCATTCATTAGTTTTACAATTTTA ATCCGATACATCAACTCACGTCTATTACAAATTAAAAATTTCAATCAAGA ATGTTTAAAGAATTATGAACGTTTTTTAGATATATGTACACTATACAATG GAATTCTAGAGATTCCATAGCTATACACAATAAATATTGTTGTGTACATT TTGATATGAGTACTTTCCTAATTTTTAAAAATAAAATATAATATAATACT CAACAGAAAATAGAATTATATCCTATTATGCAGGCTTAATATAACTATTT TAATTATATATCACAAATAATTATCCTCCTTCCTAATAATCATACCCAAG ATCACTTTGAAAAGATTAGAGGTTATGTTAGTATTAAAAAATGTTCCGTG ACTATTTATAATTAGTTATCCAGCAGTAATCTGTATATTCATACATATAT ACTATGTCCATGTATAAAAGAGAGATTGTGTATGTGTCCTTTATGCTTGT ACACACTGTTGAACCTAGGAGGCTGAATTTTCAGGCTAGAACGGGGGTCT CGTAGTTTTTTTTTTMGGGGGGGGGGGAGTAGGTTTATATAAGGTGGCGT 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AGTATTGAATAAGTATAAATAATTAATCAATGATCATAAATGTATATAAT ATTTGTAATTTTATAATAGCTAAAATCATTGAAGTAAAACTTTTTTTGTC TTGTTACAAAAGTAATAATTATCCAAAATTTACTTTTGTAAAAAATACAA GTACGAATTGAAATATTATTAATATAATATGTATATGAATTTAAATAATA ATTCAAGAACTACTATTTACATMTTCAATTCTAATTTATTTCATTCAAAA AATATGATAATAAAAAGTAAAACAAGGTTTCATAAMCAAATTTTATTAAC AATAAACCAAAATCATCCTATCAGAATGGGTTATGGTTGTGGCCTTTCAT ATCAACTCTCCCTTCCAAATGTTTATTTAACGTTGGATCTTAGTTATAAG AATGGATTTTACAAGTGTTAGTGTATCTTATGGTTATCAATAATATAGAG CAAATCTTCTTCTTGAATAATGATTGTATCTCCATTTTCTTCTAAGGCAT AATCATATAAATATTTATTTCGTTCAACATCTGTGACTATCGAATGTTGC TTTGAATGAACCAAAGAAAACTTAGACGGAGATTCTCGTCGGTCTAATGA TTTTTTACAAGAAACTCTCGAATAGTTTGGCGCATTAATGAAAGAATTCA AGTCAGAGTGTGAAATACTTTTTCTTGTAGCAGATTTATGTGATACGTCT GTTGAAATAACAATAGGTTCCATGCCATACGCGTTCTTATCTTCAATCGG TATTTTAACCCTTTCGATATCAAGAGGCACTTTTGAAGCGTCTGCTGATG TAGCTCTATTAAGTTTCAATTTGTGATCCAACAAAGGTGCTTCAATTGTA TCAAAAGAATGAAGTGAGAGGTCTTTCATTATGTATTTATACCAATAAAT TGATATTAATGGAATAATAGCAATCATCATTATCAAAACTCCAAACATTA 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