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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s86 | supercontig | LSalAtl2s86:692955..707462 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012120 >EMLSAP00000012120 ID=EMLSAP00000012120|Name=EMLSAP00000012120|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=810bp
MWTSEIHFWMAYALMSFNNLELVGCNFDFYIDSHQTKLLYGLDFREIYFI RNGVINQNAITFLNEEIPTYVDRLIFHWHLSQSRTSTSYHMQVIHLPGPI MRTPILNISSNGFLSFEDTVFSIELPCTGRVRDHVDIMIKMTFISKLLDE YNQSIEPLSLNFKRRKLCAKSSNYMMDGSKANENDDLEYPEQRLSPVAST CIAFGSVLTTIIFLFVLLGFLYVTRKKRHPNIPLNSLVHLDYIPHQNFPT NGYKCYSTPDSFSRLSMEKLCSMKETGYQGSPLNSCSKSFSLHFRNNTEN SRQLLQNXSSPSSTSNHDPIHSNTIYKYLPSKDESSSLSNISPSVPRSLV IEDGVLRLSSSSGYPPPTANKIQNISSCSSSYSSSISLNPQLHDQQPKSI VSSPLTASSNTDDFFPNGETLGIKTLSEKDEEQSGISKNEGTGSDSSYIP HLYSHLMPKNIKKASGRLPNTETQNSLLDHQTTISKMIKKQLIYVLIVIC LVVAVVSSSCKTKTGKTCKFPFKYNGVTYRDCTTIDNGSTKWCATSVSET GVLKDYGDCAGDCSVVNKPDSIGGCPTTNGRRCVFPFKYNEVTYNECTKE GFGDTFWCATTVSSNGDTIAYGICTANCPKPSTLSSEVCGTINGKACVFP FVYGEVSYKACTSVDNNDVPWCATSTNPSNHQYISYGNCKQSCKVIIETA SSLASTIDVISISQSSVSNSPIKPAIDITIKPSKIDTTIVQPSRVDTTTV KPSKIDTTTVKPSRIDTTTMEPQTSAPAQSINLKKPKRVSLKGSNNVGGK RRGKGRNNGR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s86:692955..707462+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012120-707967 ID=EMLSAT00000012120-707967|Name=EMLSAT00000012120|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14508bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s86:692955..707462+ (Lepeophtheirus salmonis) GTCTCATTCCCCCCTTCTCTTTGCACTCGTACACAAATCCCATCTCTAAT
TATAAATATAATAACAGAGGCAGAGAAATAAAAGAGGGCAAATAAGAGAA
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TGGATTAACGAAAAATTAAGGGGTGCTCACCTCTGCTGGTTCGATTAATT
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GAGTCTTAAGACTCTCATCCTCAAGTGGATATCCACCTCCCACAGCAAAT
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AATACATCTTCTTCACGAATTACAATTGTGTCTCCATCTTCTTCTTTGGA
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AATGTCGTATAAGGACTCATACCACCAAATGGAGGTAATCCGTCAGTTCC
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ATACTCCCTTTCTCAGTATCAGTGTTAGCTCCATAATTTCTTTTAATATT
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CATTATTTCGTATAAATTCGTCTGTTATATTTTTAAACATATAAAGAGAT
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TGTAAACGTATTTGTGGGTATAATATGTCTGTATATATATGGTATTTGAC
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TTTTCCCCAAACGTCAACTTTCCACTTTATAAAAAAAAAAACCTAAAAAT
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GTTATCGAGGGTTATTTTTTCGACATCATTATTTTTCGTAACTTTTTTTA
TTTTTGTAAGTACGAAAAAAATAATGGTAGGTTTGTAATTTATAATTCCA
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NNNNNNNATATGGTAATTAATAATTATAAAGTATTATAGAAGTATTTTCT
GAATATTTTTTTAATTTTCACCCTTTTCAATGTGATTTCCCTCTCCCTCC
CTGGCCCGAGAAACGCCGAGTAAACCTTTGCTAGTAAGTTTACATAAGTA
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ATTTGTAATTTTATAATAGCTAAAATCATTGAAGTAAAACTTTTTTTGTC
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AATATGATAATAAAAAGTAAAACAAGGTTTCATAAMCAAATTTTATTAAC
AATAAACCAAAATCATCCTATCAGAATGGGTTATGGTTGTGGCCTTTCAT
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GTTGAAATAACAATAGGTTCCATGCCATACGCGTTCTTATCTTCAATCGG
TATTTTAACCCTTTCGATATCAAGAGGCACTTTTGAAGCGTCTGCTGATG
TAGCTCTATTAAGTTTCAATTTGTGATCCAACAAAGGTGCTTCAATTGTA
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TGATATTAATGGAATAATAGCAATCATCATTATCAAAACTCCAAACATTA
TATATCCTGCTATGTTCATGGGGAATAGTACCTCAAAAGTTTGAGGTATT
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GTGTATGAAAGCAAAAAGATTTACGAAGACCATTTTGCTTCTATCCACCA
TGAAAAGACCCATATCGAAAAAACACAATCAAATTATAATCTTAACCAAA
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ATTGAAAAGATAAGCTAAACATCTATTGAGTATTTGCATTATGTACATTC
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GTGCAACTTCTGTTTCAGAAACTGGAGTCCTGAAAGACTATGGTGACTGC
GCTGGAGATTGTTCTGGTAATTTAAAGAAAAATGATCTATTTTGCCATTC
ATATATTTAATTATAGTTTTTTTTTATTAAACTATAGTTGTCAATAAACC
AGATTCGATTGGAGGTAAGTCAAATCACAACCATTGAATTTCGTCCTGTT
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GTTTCCATTCAAATATAATGAAGTAACTTATAATGAGTGTACTAAGGAAG
GATTTGGTGACACATTTTGGTGTGCTACAACTGTTTCATCAAATGGTGAT
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TGAATGTTTTATCTTACTATTAATAAATTTTCATTTCATTTAAATTTTAT
CAACCAAATTAAGAACCATCCACATTGTCTTCTGAAGGTAATAGTTTCAT
AATTTCCCATTATATGTACATATTATATGAACCGTCTGTTTAATATTTTT
ATTAGTTTGTGGAACCATAAATGGTAAAGCCTGTGTTTTTCCTTTTGTAT
ATGGTGAGGTAAGTTATAAAGCATGCACTTCTGTTGACAATAATGATGTT
CCATGGTGTGCCACTTCCACTAATCCTTCTAATCATCAATATATTTCATA
TGGTAATTGCAAACAATCTTGCAAAGGTTCGTTTAATCAAATTAATTAAC
TTAACGCAGTTAATTTGTAAATATTTTTTAGTTATAATTGAAACAGCGTC
TTCCTTAGCTTCGACAATTGACGTTATTTCTATTTCTCAATCATCAGTGT
CCAATTCTCCTATTAAACCAGCTATAGATATTACAATTAAACCCTCAAAG
ATCGATACTACTATAGTTCAGCCCTCAAGGGTCGATACTACCACAGTTAA
ACCATCAAAGATAGATACTACCACAGTTAAACCCTCAAGGATAGATACTA
CTACAATGGAACCACAAACATCAGCTCCAGCTCAGTCTATTAATTTAAAA
AAACCAAAAAGAGTATCACTTAAAGGTTCAAATAATGTAGGCGGAAAAAG
AAGAGGAAAGGGCAGGAATAATGGTCGTTAAGTATTCTTTGATTGATACT
AATGAATATATGCATTTTGATTGTATTAAATTTTTCTATCACAAAAAAAG
TTTGAAAAGTATTTATAAAATGTACAAATGTGATTGTCCCTTTGTACCTT
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