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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s954 | supercontig | LSalAtl2s954:24095..59128 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012636 >EMLSAP00000012636 ID=EMLSAP00000012636|Name=EMLSAP00000012636|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=863bp
MMKSNLPFDLIPEEDVPPKDSPPSSKSSPENRPSLALIKTQHLLHQQILD KRFGRNFELLQQSQEKQLSQYIQQVELPRHRSNSTTSSPTNNATINASLG AGSPRDIDQKERHRLRFIKQKSLNDQSAVASPEVKKHLQEFVLQKKRKEA SMVNLKSEILCSNASQSSSSTHHPILRKTASESNLLKMKSKRADIRSSVT PYARFGSHGPTQPVIPEGSVVHDSAPSSPQTTEDSTIGGSPSSCSYSMSP HVPSNVVTXSTTPPTTSHHSHHSRYENSLRSTLVERNNLIIVGNEDSSIN SKSLPNIPSAIGRAALINKAVGRRSPPTNMSNRLPHHPSMMVRRTKSSAI LPLRKHLIEKQRXADEEQYFQQKLNERFVRPTIVEEDSSNIFMDIDDGRR IHSLATSVRSSGISQLLLGDLNPPSTGLGFDSIMLNHTCKCGNNAAHIEN PSRASHIWNRLIEQGLVAHCKRISRKATLEEIQSSHSENHTLLYGSDMIS RKSTTSYGPKFSMLECGGIGVDSDTYWNENYTSEVLRTAVGTLIEISEMV VNDELKNGFAIIRPPGHHAEYEEAMGFCYFNSVAITANRLLLSPNVTKVM ILDWAIHHGNGTQKAFYDNPNVLYISLHRHDNGNFYPGTGSLTECGHGPG LGFNVNIAWTGDLIPPMGDSEYLAAFRNIVMPIAREFNPDVVLVSAGFDA AIGXNHPIGGYHVSTACFAYMTLQLQQIAGGKVVLALEGGYDLEVLSTAS EQCVRALLKFPIEKISEAELARRPTAIAVETLQKTLAIQALYWNSLKGGC ETAFLSHLEAWEKEREEADALSAMATLSMQQHRNSTSILAEHNHLHQSSS HQPSSTPITISYY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s954:24095..59128+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012636-708483 ID=EMLSAT00000012636-708483|Name=EMLSAT00000012636|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=35034bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s954:24095..59128+ (Lepeophtheirus salmonis) TTATCATCTATCAATAAATATAGCTATGTTTTACACTTTAGTTTCACGGA
CTCGTTGAATATTGCAATTTTACTCAGAGATTAAGACAAAGTATATGTAC
AGGATATATATATCTATAAAGAGTGCGTTAAAATGAGTTAAAAGGGAGTT
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AAAAAAAGTTTCCTAACATACTTAAATGTTTCAACTATCATTTGACAAAA
TTTCATGAATCTGACATGAACCATATGTGTGATATTGTATGACGCAAAAT
CATAGTATGTTTATATAGAAATAAAGAAGGTGAGAGAAGGAAGGGAAAAG
TTCAGATTACTCTTTCGCCGTCGAATAAGTATATGAAATATTTACATCAC
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GATGACTGAGCAAAAGAAGGAGTTTATAGTTTTTGTAACGTCATCATCTA
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CTTATGGATACATAATCACACAACTTTTCATTGTATGATTAAAGCCATAT
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GTTTCAACTTTTCACTTTGTACAGAGCGTTACAATATTTCATAATTATCC
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ATATTGATATGGNATTAAAACCGATAACTATAAGGATTCTTAGAAAAGAG
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ACAGTACTTGGGATGAGGACAATGCAAAAATGAAATGTTCTTTGGATTAT
TATTGATATAATAATTAGTTTACTCTTACTCTAACAAGCATTTACACTTA
AGCCCAGTGTTGAAAATAATACTATCCGGGTGTATGTTAAAAAAAAAGAA
AACAAAAAATGAATGTGGTCACACTGACAGCTTGAAGCATGTTTTAGAAG
CAGGGGCGTCCACAAGGGGATGTCTGAAGACAAGATCCACCCAATTTTAG
GAATTTTGTTTTTTTATTAGATTATTTAATATTTGAATTTATTTTTTTTT
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CTTTCTTTTTAAACATATCGGCAGGKTATATTTTYTWCAGCTCTATGTCG
ATTTGTATATATTATTTGCCTACTCTTAGTTGGCAACGAGGATAAATAAG
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TGCATTTATTTAACTTTTTTTTGTATCAATCCACTTACTTATATAATAAT
ATACCTATATGGAGTATCAACAGAGTTAAATGAAGAATAGAAATGAACAT
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AGAAGGATCATCATCATCACACTTGTTTCAATCTTCCTCTTCATGATTAG
TAGTCCTATATGTGAATTTCATATATGCTTTAACGTCACATTAGTGTTGA
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TGTTTCTAATTCTTTCAAATTATGAGATATGCAAATTCAGTGACATCCTG
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GTTTTGAATTTTTTTTGTTATGAACAGTGATTGGTTTAACTTGAGTTAGC
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GCTGAGGATTTAAAAAAAATTTAATATTGATATTAGAAATTTGCTTCCAA
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AAGTTGTAATTTTTTGATTTTTTTTTAAATTCCAAAAACCAAGACCCTCA
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TAGGTAGAATAATAAAGATAACATCGTGATTTTTCATATAAAAATATCTT
ATGACATACATTATTTATGTATCTGTGTATGGTCATATAAGTAGTGTATT
ATGACACTTCCTGGATATTTTTCAAAAATCATATAAAATAAATTTATGAA
TGAAATGATCATAATCTTTTCGTGTTTCATAATCATTTAATTGTTTCCCC
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TCCATAATAATAATTTAATTGGATATGATTCTCAAGTGTCCCTTCCTTTT
TGTACGACATCATTTGTGTAAATTGTTGCTAATTCTAACATCTGGGAATA
CAATATATACGCATATAATGCATGACTCTAACTCACCTCAAACGAGTCTG
ATCCCTATTTTTTTAATGTTATTTTTATTGGTCCAAGGGAGTTGGAGTGA
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AAAAAGAAACTGAAAATTAACATGGTAACCATGACAGTTTCAAGAATTTT
TTGAAGGAGAGAAAGACTAATGCTGTTGACGTTTCATTAAATCAGCTACA
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GATGAGAAAAACGCTTTTTATTATTTTTCGTTCATTATTTAATCCATTGT
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TATTTAATTTTTTGGAAATGAATTTAAAAAATCCACAGCTTTTCTCATAA
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AGTGGGAAATGAACTGCTCACAAAAAATAAAGAATAGATTTGTTGATGTT
TCAAAGAGGCCATTCTACGGTTGTATATTGAATAAAAATCGCCAATGTAG
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AATTCCCTTTCACTTCATTTTCATTGTCAGTCATTAATTATTATATTGAT
ACAATTATTAATTCAATATATGTAATAATAATTAATAAATATAAAAAACA
GTTAGCAACAAGAGAAATTATTCGGAAGGCTAGCTGCTACCATACTATTT
TTTTCTACAAATGTTTCCTTTCCCTCTTGACAGCAGAAGTTTTGTGTGGA
TTAAAAAACTCAATACAGTCGTCAATACAATACATATTACTAATGGTGTG
TCGGTCCTTATTTAGAACCGCTGTCCAGTCCTATTTGTCTTTTGTTTAAT
TTTTCAATTATATAAAGGAATAAATTATATAACTAAATAAATATATAATA
CGTTCGTATTATATGAAAAAAAAAAATATTTTTTCCAAGATATTTGCAAT
AATCTTAATATATATTTGGCTTAATAAATAGTCGATATTTGTATGAAAAA
TTCCAAGGRCCGATCCGTTRGGTATGGGGGGGGGGGGATGTAAATCAAGG
ATTTTTAATTTGTACTATAATTTTTTTTCTCAGGATAAAAAAAATATTTA
AGGATTTATTTTCTTAAAAGATGGCCATTCGACCAAATCATTCAGGAGAG
AAAAAACTTGAATTTTGAAATTTTTGAAAAAAAGCCCCTCCCNATAATAT
ATATATATATAAATGTGACGGTCAATTTGAAAAATCGGGCATTTTGAAAA
ATGCCCGTTAGAGCAGGCAATTTGCAAAATGCCCGGGCAATCTATAAAAT
TCCGAGTAGAGTTGTCACGTTACGTTCATTTACATTGTCAGTTGAAATGA
TTGTGGGTAATTTGATGATGAAAACAATTCATTCCTATGCAATTTGATCA
TTAAGGATTTGATATAGTAGAATTTCATAGTAAGCAATTTGATAATCTAG
TGGAGGGATGTCCAKCCAGGGGATCACAGGCCATATTGTGTTTAGGCGGA
ACCCACTACCCATTTTCACTTCAAGTAGTATTTTTTTAGCAAAATTGTCA
CAGTACCATCAGAACGCTCATAATACCTACAAACATCGAAAAATATTTGA
AATAGTTTAATAGTTTTGTTTTATATAGCCATTTTTCAAGAAATTCAAAT
TAATATGTTATGGGCCCCGTTCAAATATTTCACTTGGCACAATGCGGCTC
ATTTTATGAAAAGGTTTGACTTCCCTGATCTAGTGCATTTTCATTGAAAT
TTATATTGTATTCAGACAATCAAACTATAGTATGATAAGAAATTATCACC
AGAGACTCAATTTTATTTAGCAAAATATATCTCGGCCAACAGGTTGTGCA
GGTGAACAGCTGGTCTCTAAGGGGGATCAAAACCTATCTCCACCACTATC
CTGAGTATCAAGGATTCCTTTCTAATATATACACCCTAGTCCACGGGTTG
GTCAAGTGGGGCACTGGTCCAAAAGGTGGACCCCTCCCATAGGGTATGCA
AATTAATCGCAGGTTCAAAAATTGGATCATTATCCKCCGCCACTGTTTCT
CGAGCATCAAGGACTCCTTTCAATATTCCATAATACACAGTTTATAATAC
CTTTGATTGTGCAAGTGAACCGTTGGTGGAAAATGTTGATCATTAGCGAC
TGCCACTGCTTTATTGAATATTAAGGTTTCTAATAGGGCGTGATCCCCCT
TAAGGACCAGTGGTTCGCCTACACAACCTGTTGCCGATATATATTTTGCA
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GTTTGCAAAGAAATTGTATCATACTCAAATCCTGAATGATGAAACTACTT
ATGAATTAATTGTATAATAATCATATTACCCACAATCATTTCACCCGACA
ATGTAAATGTAGTCAAAATGATAATTGACTACTCTAATGGAAATTTTATG
GATGTCCCGGGNATTTTGCACATTGCCCGGGACACATATAATTCTATAGA
CGACCCACTATACTTATATTTTGATACATTATTCTGTTCTCACACAACGT
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CCCATTAAGACCGAAGTTTTAACATTTTTCCGAATTTGAACAGCTTTTTC
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