EMLSAT00000012636, EMLSAT00000012636-708483 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012636
Unique NameEMLSAT00000012636-708483
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s954supercontigLSalAtl2s954:24095..59128 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012636 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012636EMLSAG00000012636-695402Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000056733EMLSAE00000056733-765661Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056734EMLSAE00000056734-765662Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000056735EMLSAE00000056735-765663Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769652auto769652Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012636EMLSAP00000012636Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012636

>EMLSAP00000012636 ID=EMLSAP00000012636|Name=EMLSAP00000012636|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=863bp
MMKSNLPFDLIPEEDVPPKDSPPSSKSSPENRPSLALIKTQHLLHQQILD
KRFGRNFELLQQSQEKQLSQYIQQVELPRHRSNSTTSSPTNNATINASLG
AGSPRDIDQKERHRLRFIKQKSLNDQSAVASPEVKKHLQEFVLQKKRKEA
SMVNLKSEILCSNASQSSSSTHHPILRKTASESNLLKMKSKRADIRSSVT
PYARFGSHGPTQPVIPEGSVVHDSAPSSPQTTEDSTIGGSPSSCSYSMSP
HVPSNVVTXSTTPPTTSHHSHHSRYENSLRSTLVERNNLIIVGNEDSSIN
SKSLPNIPSAIGRAALINKAVGRRSPPTNMSNRLPHHPSMMVRRTKSSAI
LPLRKHLIEKQRXADEEQYFQQKLNERFVRPTIVEEDSSNIFMDIDDGRR
IHSLATSVRSSGISQLLLGDLNPPSTGLGFDSIMLNHTCKCGNNAAHIEN
PSRASHIWNRLIEQGLVAHCKRISRKATLEEIQSSHSENHTLLYGSDMIS
RKSTTSYGPKFSMLECGGIGVDSDTYWNENYTSEVLRTAVGTLIEISEMV
VNDELKNGFAIIRPPGHHAEYEEAMGFCYFNSVAITANRLLLSPNVTKVM
ILDWAIHHGNGTQKAFYDNPNVLYISLHRHDNGNFYPGTGSLTECGHGPG
LGFNVNIAWTGDLIPPMGDSEYLAAFRNIVMPIAREFNPDVVLVSAGFDA
AIGXNHPIGGYHVSTACFAYMTLQLQQIAGGKVVLALEGGYDLEVLSTAS
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ETAFLSHLEAWEKEREEADALSAMATLSMQQHRNSTSILAEHNHLHQSSS
HQPSSTPITISYY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s954:24095..59128+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012636-708483 ID=EMLSAT00000012636-708483|Name=EMLSAT00000012636|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=35034bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s954:24095..59128+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTATCATCTATCAATAAATATAGCTATGTTTTACACTTTAGTTTCACGGA CTCGTTGAATATTGCAATTTTACTCAGAGATTAAGACAAAGTATATGTAC AGGATATATATATCTATAAAGAGTGCGTTAAAATGAGTTAAAAGGGAGTT GGAAATCCGTAGTAGAACTCCAAAAAGGACCAAATGAGCAGTACAATTCC AGCAGATACAAGCACACCACCAAGAGCCTCAATTTCGCCAGTTTCCTCCA TCATATTATTTCAATAATATCCATGGATGCGTGTTAGTTAATATGTTATG TTATTTAAATGATTATGTGCGTGAAAGTTTGTGATCCATCAAATCAGTGT TTGTGAGTGATTCCTCCTGGTCTTTAGCATTGGTTTCGAAATGATGAAAT CCAATCTGCCTTTTGATTTGATTCCTGAAGAGGACGTACCTCCCAAGGAT TCCCCTCCATCCTCAAAAAGTTCTCCTGAAAACAGGCCCTCCTTAGCTTT AATCAAAACCCAACATCTCCTTCACCAACAAATCTTGGACAAAAGATTTG GTCGTAACTTCGAATTACTTCAACAAAGCCAAGAAAAACAATTATCTCAA TATATTCAACAGGTAATAATAGTAAAACGTATAAATCAGCTCAGTATTTG GAGTTTTGTCGTCTTTTTATATATATTTATGTGTCTGTGTCTATTTCCCA ACGCATGAGTTATAGGCACTATTCCTTGCGTATAATTGTATGACCAAACT CTTAGTATAGCAATCATCTTTTTACCAATCTATAAGGCTCAAAAGTCAGG TAGGACTAACTAAGTATTTATTGAAAAATGAAGTCTGTTGTTTTGGCTAC ATTTTACATTTGGTAGATTTATGCTGACACATTGATTTCCAAACCTTGTT TCCAATAAAAAGCCAAAAACCAGAAAAATCATCCTTTTTTTCCTCTCCGT ACCTTTTTCTTTCCTGTACATATTATGTACCTCTTGAAAACAATGAAAAT AAAAATGGCCGTAAGGAAATGCCACCATTAATTCCCAATTTATATATTTT GAAGTCATACATTAACATAGCTCTCCTAAAAGTAGAAGCTATCTTACATT TTATAGTAACATAACCTAGATACAATTGGAGGTCAAAGATAAATAAATAT ATATGACTTTAATTATTCCATAACTTTTATACATATAACTTACATAACTA TGTTTTCTGAAGGTCACGGACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAATACGCT AAACTATTTTCGGAATTGCAACGAGCAATTGAACGATGATGATCTTCTTT CTGCATGATCAATATTCATTTATTTACATTATTTCAAATTATAAAGTCAT TTGTTACTCTTTTGATATCATTCATTTATGGGGGAGAGGTAGGGAGGGTT GTACCCTACTAAAAGATAACTAGTAAAAAGTTGAATATACATATATATAT ATATATATGTATATCTACAACTACGAAGCTTTTCATTCCTTTTTGCACTC CTAAATACGAATAAGAAAATTTATTAAAATATGGGCTCATCTATTTTTAG CTGGCGTATTTACGTCATGAATTAAAAGTACTTTAATGAATTTACATATA CATATATCTATATACTGCTGTTTATTTATAAATGCGATGATTTAAACACT TTTTTAAATTAAAAAACGAATTAGGAAGACTACTGAATATTATACATACT TATAAATCTATTAAACATTTGTACAACATCAATGTAATAACTACGTAGAT AGTTACTCAAACCTTTTATTTGTATTCATATAGAAATAGTGTATTTTTGT CAGTTAGTCCTTATTTAAGACCCGTCTAGTCCTAAAACTTATAAAGTTTG GTCCTTCTATGACTTCAGTAATGTTTATTTACTTTTTTTTATCAGTTCAA 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TTTGTGTAAATACTTATACAATCTTTCCTATAAATACTTGGATGACGTCA AATTTCCTTAATATTTTAAATACTTATGATTTTTATGTCAATATGAATGT TAAATAAAACAAAACAAAAAGATAAACTATTGATATCTTGCTTAATTTAT CCCATAAAATTATAGTAGATTTATACAGATATTTATATAATATCAGTAAT AGAACAGTTTTTAGTTCAACTTTTGTCTACAAGTAGTGAAGAAAAGTGGT GCGTTGTGGTAAGAAAAATATGAAATTTCATTGGCCAACGCTCAAAATTC ATTTACTAAATATTTTCCATTAAATAATAGGGATTTTTATAACCCATCAA ACATATTGATAAAGTTATTTTCTAAAGTGACTCTACGGAGTAAAAATGCT GGATTTGGAGCGTGTCTCTTGTTTATCTGAGAATATAAGAAAAAAGAGTG AAAATGCGCGTTATACATGATGTATGGCTTTAAGAAAAAAAAATACTTTT TTCATATTTATTTTATTTTAAGTTTAAAAAATGTCTATAGTAGTGGTTTT ATTCTTTATTGTAATTGTAGATCAATGAAATTTTGTGTTGTTGTTTTTAT TACAAGACAACTTTTTTGTACTAGTGGTAATCGAAATTCGATAAAAGTTA AATAACAATCCATCCTCATAAGTAGGTATGTATTATTGATGTGTTATCAA ATTGTTATCACTGTTTTTTTTTTTCTCTGTCTCGCCTTTTCTCTCTATTC CCCTTTTTCAATTACTTTCTAATTGAAAGTACATATAAAAAAATGCTCTT ACAAATTATTACCAAACTTTGTCAGTTTCCTAATGGATCACACTACATAC TATAATTTAATTCAGTCCATGAATCTTAAGTTTGATATGATGAACTATGT ATATATTATTGATTTAAATACATGTTTGAACTCACATTTGACCTTAATAA AAAATAAATTGATAAATAAGAGACATGAACATCATCGTCAATTCTTGGTG CAGAAACTTGAAGAAAAATTGTACATAATTTATGACTACAGTTTGAGGTT TGATAAACGTTGTTGAAATGTTATATATATTAGTGATAAGACGATTACAT AAAAAATAGCAATGCGGATTTCGATGCAATTCTAGTAAGAATTGCCCAAA CCGATTCTCATTCTTGAATATTTTAAATAATAGCTAAAAAAATACAATTT TGCTATCAAGAGCCTGCACAGGATTATACGATATACGGAAGGGAGGGCTT AATTTTTGGATTTTTTTTTTTTTAATGTNTTAAATTTCAAATATTAAAAG AAAATTTAAATATACAATTTGATGATAATAATTTTTTTCACGAATTAAGT TTTTTGAGAAAAAAAAAAAAATCCACATTTGTTCRTTAAAAATTAATTTT TTGGAAAAAGATTTCAAAAATATTCAACTATTGACAAAAATTTTCAACTA TTGACAAAAATTTAACTTTTTGGAGAAAAAATGCAAGAAAATAAAAGTTT TTAAAAAAATATTTCAAAAATTAAATTTTTTGGGAAAAAAAATGAAAAAT CTACAGCTGTTATCGAAATAATATTTTATTTTTTTTGAATAATACATAAT TATAGCTCGGAAAATTAAATTGTATGGAATAAAATTTGAAAAATTTAATT TCAAAAATTAAATTTTCTAGTAAAAGCAAAAATTCCTTAATTTGAAGGGG GAGGGGTTATTTTTTATAACTTAGAAAAGTAATAAATATTGAAATATGAG TAATAAATAATAAGTGGAATCACAAATAAAACATTATTTTCCCGATCCCG ATTCCAGAAAAACACCCAATTTTTAGATTCTGATTAATTGTTCCATCACT AATATTTATGTTGTGTACAAGTTACGATTTTATACAAGCTACTGCTTGTA 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TTCTCCATTATTAAATAGCTCGAAGGGATGTTAACATCTCCCTCCAAAAG AAGAATTCTCGCCAATCTTTGGTGTAAATTGATTTAAAAATACATTTCCC TCGTACTAATGCTATTTTAATGTAGAATATAGCAGTAATTCATTTTGTCT CCTCAAAATAATATAATAGGCAGCTGAAATTAACAATGGTCTTAATTCAG CATTAGCATTTGCATTACTCCCCCTTCTCCTCACACTCTTACAAACAACC AATCTATACTTATAACTAGGTATGTTAAAGAAGTTGTAGGGGGCGCTCAT TTCGTTCTGTGTAGCATAGAGAAGGGAATTTATAAGTAATACTCAAGTAA TATGTATATTGTTATGTATAAATTTTTGTCGTTTTTTAAAATATTTAAAA AAAAAAAGTTTCCTAACATACTTAAATGTTTCAACTATCATTTGACAAAA TTTCATGAATCTGACATGAACCATATGTGTGATATTGTATGACGCAAAAT CATAGTATGTTTATATAGAAATAAAGAAGGTGAGAGAAGGAAGGGAAAAG TTCAGATTACTCTTTCGCCGTCGAATAAGTATATGAAATATTTACATCAC TGAAATCAGAAGAAAAGGCTTCCTCAAATAACGTTTCTTATTGCCTTCAA ATCTGATTTTTTTTTTTTAATCCTTTAACATACCTACTTATAACAATAGT GATGACTGAGCAAAAGAAGGAGTTTATAGTTTTTGTAACGTCATCATCTA CCTTGAAAATTCATACGATTACGTTAGATTAATCAAAGTGACGTCATATA CTTATGGATACATAATCACACAACTTTTCATTGTATGATTAAAGCCATAT TATGATACAAATTACACGAACCCCATCCCTAGTACATATGAATGTTCAAT ATTATACATTAAATTAATACGCTTTAGGTAAACAGGTACATATGTGTGCC TTGTCTGTTCTTTATTAACATGTTGTATGTTTCAAATAGAAAACATTTTA ATTTATACAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAACTGTTTTTGTAGGTATGTTA TAATTTTCTATGGTCATGCCAGATTTAAAAAAAAATCACTATTGTCTTAT AGTTACTACCTATATAAATATTTTGTCCTGCCAAATCACTGTTTATTTTA TTTCAAGTCATTTATCGTATCTTTAAAATAAACACAAACCGGATTGACCA TCTTTTTTACTCATGATTTAAATGGGAGATTGAATAAAAGAACTATGAAA AGGTAGAAGAAACTACTTACGTATTGTACATTGTCATGGATGAAAATAAT AGGAAAAAAAGAAACCTAAAAGTAACGTAGTCACGATTAAGACAAATACA AGGTTAGACTATCCTGTTATTGGGCTTGCTAGAATTTTCAATTTGATGTA CCGTACCGAATGGTGGGCAAGACAGACAGATTGGGAAATCAATGAGTATA AGAACGATATATTAACCGTATATAATACTAGAAATTATATGATAAATAGT AACAGTATGTAAGTCAAACATTAGTTGAAAAAATGTTATGGCATAACCTT GTACTTCTATTAACCTTGGTCCCCATGCCAATTTGAAGAATGTTTGGGAA CAGCATTGCTGAAGAAACGTTTCATTACATTAGCTACACAAATATCACTG CATATCTAGAAATGATATAGGCTCSAATTAAAACGATGTCTAAAATCATC AGTTTCCCTCTTTTTTTTCCCACGTACTATTGAATATTTTTGTTCTCTCC TCAAAAATAAAAGAATATTGATGAGACATTTGCTAAATATAAATTATGTT CAGGTAGCAATTACTAAGTGTAAACTATACAAGGGAAATTGCAAACACTA GTTTCAACTTTTCACTTTGTACAGAGCGTTACAATATTTCATAATTATCC 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