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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000001032 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000001032 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1171:136981:147083:-1 gene:EMLSAG00000001032 transcript:EMLSAT00000001032 description:"augustus_masked-LSalAtl2s1171-processed-gene-1.4") HSP 1 Score: 260.381 bits (664), Expect = 3.504e-90 Identity = 128/128 (100.00%), Postives = 128/128 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MDILSGYALTNFEIESYSTSEETAEEEEDPDEEGLSSFSKSESRQKKVAFEKEKSKVDLRNTKTFIRVEKDIKDMHRRRKRAEDLKGDILKHRGNLIKSNRSVECEAAELQIILDQAHHEIRRGDPWV 128
MDILSGYALTNFEIESYSTSEETAEEEEDPDEEGLSSFSKSESRQKKVAFEKEKSKVDLRNTKTFIRVEKDIKDMHRRRKRAEDLKGDILKHRGNLIKSNRSVECEAAELQIILDQAHHEIRRGDPWV
Sbjct: 1 MDILSGYALTNFEIESYSTSEETAEEEEDPDEEGLSSFSKSESRQKKVAFEKEKSKVDLRNTKTFIRVEKDIKDMHRRRKRAEDLKGDILKHRGNLIKSNRSVECEAAELQIILDQAHHEIRRGDPWV 128
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000001032 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000001032 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000001032 | 3.504e-90 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1171:1369... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1171 | supercontig | LSalAtl2s1171:136981..147083 - |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | augustus_masked-LSalAtl2s1171-processed-gene-1.4 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s1171:136981..147083- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000001032-683798 ID=EMLSAG00000001032-683798|Name=EMLSAG00000001032|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=10103bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1171:136981..147083- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGACATACTGTCGGGATATGCATTGACCAACTTTGAAATAGAATCCTA
TTCTACCTCTGAAGAGACTGCGGAGGAGGAAGAAGATCCAGATGAAGAGG
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CATATTTTGTTCAAACTTCATGATGAATAATAACACATTATAAATTCACT
TTATATTATTCATGACAAATATCTAAACATATTTGTTTGTTGCATCCCCA
AGGGAGTACCTTCAAGTGTGAGTAATATTATTGCAATTTTTTAAAATTCA
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AAGTACACCGCACAAAAAAAATTGTTTGGAACTATTTTTTGATATTAGAG
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AATCTTTTTATTCCCCCCACCCTCCTCCTCCTCCTCCTATTTTCCATAAT
AATACACACACTTGAACATACTCCCTTAGGGGATAGAAAAAAAATATGTT
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ACGGATTATTTCCCCTCCAACGTCCTTACAATAATGATAAAAGGTAATTA
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TGCATTTGCAATATTTCAAAATTGGATCTAAATTTAATGACATAAATTTG
ATGGAACTCTAATTCTGGACCACTCTGTAATTGATTTATGGGCCTATTTT
TTTAATTGGTCGAAACTCCTTGGTTTTTTAGTCATATGGAAACACATATA
ATATTCTTAGGTATACACATTTATTTAGGGCCATCTCTCATAACTTACGA
ACTTTTCTCCAGCATTAGTCCCTTCTAAAAATCCTTTAGATATTTACATA
TATTTGGAAAATTACCAATCTATGCAAAAGGGAAGGAACTTTGAGCTATT
TATATCAAAACAGTCTCTTAGTCTTAAACGGATGACTGAATTATAAATAT
TTTTAAGGAGCTGAGGATTTGAAGGGTGACATATTAAAGCATCGAGGAAA
TTTGATCAAATCCAATCGAAGTGTAGAATGTGAAGCAGCAGAGCTACAAA
TCATTCTGGATCAAGCACATCATGAAATTCGTCGAGGGGATCCTTGGGTT
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