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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1130 | supercontig | LSalAtl2s1130:7195..13371 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000792 >EMLSAP00000000792 ID=EMLSAP00000000792|Name=EMLSAP00000000792|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=192bp
MNQIFSIIYLCVIVSVLIPSVPAPVPRCSPFIIINKLAEFSNLVSDSNPY
FPVPPCEYGGPLEAIRAGDYEAXFVLARPELVPRHNFYELVWFLKFGAER
LGRILRGEEKFIADQNILREGYQHYTPYVRTRQIGHDTFRDPIIINDKRL
YNRIVGSRLRWLFADKGITRRHEGQKRISREDQTDITSHRLD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1130:7195..13371+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000792-696639 ID=EMLSAT00000000792-696639|Name=EMLSAT00000000792|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6177bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1130:7195..13371+ (Lepeophtheirus salmonis)
GGAACTTGATATGATCGAGTTGATGAAGATGTAAACATTCAAATTGATCA
CTATTGTGCAACGATTTTTTGTCCTTTTAGTATAAGAAAAAATATCCCAT
CAGTTGAATCAATTGAAGAAACAGGCAAAATACACTATTTTTTAAGGTAA
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GATAATTATTTATTCTGTGGCACATTATACAGTCATAATATCCACGAGTT
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AGTTAATTAAGGTGTTATGAGACGTAAACATTGTAACTTTTACAATTTAC
AGATACAAGTTACAAATTGTATAGAAATCGTAACTTGTATATACAGTCCA
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GAGGTCAAATATGTCACTAAAATGGATTTTTTCATTTATTACTCCCTTGT
AGTTGGTGTTGAGTCTGTCTTAATTTATTTGGTCTACTCCAGTCTTAGGA
GCGGTCCTATCAGTCCTCGGGACCATTTCTTTAGACAGTAGAACTGATTA
AAAAAAAAAAGGACTTTATAAGTTAAAGGACTGAACTGGACCAACACTGA
ACTGGACGGGACTTTAATCTTCATTCCTAAAAAAGGGCCGGCACAGCACT
ACATAAAACTACAAGTACTAGAACATATTTGAAAAAATAGAAATAAAGTT
AAGTAACGTCATCAAGGAACGAAGTTTATGAGTTTTAGGAATCAAATAAA
AGGCATCGAGACTGAAGTCTTCTGTCCTAAATATGAACCGACATAACACT
ACTTGTAGTAGTATTCAAGATCTTAGAAGGAATATTTACAAGAATTTAAC
CACTTGAATTATTATCACCATAAATGAGAACTATTTGCATTTTGGTCAAT
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GTATTACATTTGTCACGACCTTATTTCACCAACACAAAAAGTTGCACTCT
ATTTTGTTGTTAGCTGTGATTTCTTTGACTCATTTTTCATGTATATCGTG
TGAGTCCTTATTCAGGACTGAAGCCTGCAGTGCTGTCCAGTTCACTCTCG
GTCCGGTGTAATTCAGTTCTGCATATCAGTCCTAAAAACTTATTAAGTTT
GGTCCTTGATGACGTCACTCAACTAAATATCTTTTTTTAAATAAGTTCTC
GTACTGACTGCCTTAAGTGTCTGAAAGACCAGGTCCAAGGATTGATAAGG
CCGGTCCTAAGACTGGGCCAAATACATAAATGAGTAATGACTACTTATTA
GTGTTCTGAACGCTGATTGCTTGAAAATTAAATTAGCTCTTGTTAAATTG
TGAGCAGTTATGCACAATTATTATTCAACAATAATTACAAATAAAGGAAT
AATTCCTAAGAATAACCAACTGATTTGTGCACATTTTTGTGTTTCTCTTT
GCAGGAAAGGTTGCAATATATTTACAATCAAAGTAATATACACGTTTGTA
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ATGTAAAATTTTGTAGATATTTATGCAGGTTTCCAAAAGGAAATGAGATG
AGAATTTGAATAAATTGTATAAATGATTTATGCTAGATGATAGCATTTTG
TATATAGTTAACTATAGATATGTACATACAGATATATAAGGCTAAATTCT
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GTAGGTGTAGATGATACACATATGTCTTGTATTACAAATATATGGTTGTA
CGTCATTTTTTTTAAAAACAATTTTTTCTTATTTGAATGAATATGCAAGG
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CTGATTTGGATAAAATATGTGCCGTCTTGTTTTACAACTCGTTGCCATTT
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CAAAAAACTGGGAGTTTAGATTTTCACAAGCTTCTTTTGAGGCGAATTTT
AACCAACTAAATCATTTGCCATAGAGAGGAACAAGTGGTAATCACTTGGT
GCCAGGTCCGGACTATAAAGTGTACGCATAAGGGCCTACCAACCAAGCTC
CCAGAGTTTCCAGTGAGTCAATATCGATGTGGGGGACCTGGCGTTGTCCT
GATGGAATACAATTCCTTGCTTATTGGCCAAAGATGACCACTTTTGGGCA
ATGGCTTCCTTCAGACGGTCCAATTAATGACAGTACAACTCTGTATTAAG
AGTTTGGCCAATAGGGAGAAGCTCATAGTAGATGATATCCTACTAAYCCC
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ATTTCCCCTTCTCACCGCGATTGGACGACGACTGTTTTTCCTTGATTTTG
TTGTAAGTGATCCATTTTTATTCACTGGTAACCATCTACTAGAGAAATTG
ATGGATTTTGTTGTGATTAAGTAGGCATTCGAAGAGGGAAAGTCGGTTTT
ATGATTTTTTTTCGTTAACTCGTGTGCCACCTATACATCGAGTTTATTTC
TTAATCCAGTTTTATTTAAGTGGTTCCAAACGATTTTTTGTTCAATGTTT
GGTTCTTGGACAATTGAAACATTTCTTATATGACGGTTGGATTCGACTAT
TTCTATAATTTTATCGATGTTTTCGATCATTGGTCTTCCAGAGCGTGGTG
TATTCTTGACATCAAAATTACCGGTATAGAATCGGCGAAACAAAAATTGC
ACATGATTGGCTGTCTTTGATGCTTGATTAAACAATATTGAGTCAAGCAA
TAATACAATTGGGTAAAAAGTCATTTTAATACGGAATCTTATCTTTGTAA
TGCTAATTCTAGTTTAACCCGATCGGACTTATACAACGCTATATTCACAT
TCCTAAAGCTATATATCGGAAAAATAATGAATTTTTTTACTAAACCTATT
ATTAAATACAAACTACTAATTATAATTCAATTATATAAAATTTATTTTTC
TAGAATACTCATACTTGTTAACTATTTTTTTTTTACACATTATATCTTTC
TTTTTAATTCTTATTTATATGACAGAGGTGTTCAAGAGCTTAAATATCAA
GTTTTTGATCTCAAGTTGAATCACCAGTTTTTTACTCTGAGTTAAGTCTA
AGATTGCATTATTGACAAATTAAAGTCAAATCTGTGGCTAAAACTAAAGA
AACTAAAAAGGAAAGATGAGACAAGATGGTTGAAATAAAAAGTAAAGTAA
AACTATGTATATGAATTCTGTTCAGGATTCACGTGACTTCAATAAAAAAA
TAAAGAAAATAAATACCCTTCGTTGATAATTATGTATTTATTATTTTTAA
AATAACTTTTATAATTTTTTAGACCATAATTATGGTTCAGATACTATGAA
CTACGGTTTTAATTTATAGCTTATGTTTCTGGTTTATTCCAAAGGAAATT
ACATAACCCTGTCTAAAACGTTGACTTTTAATAAAATTACATTAGATGCA
TCTTAATGAAAAAACGTGGTAGTAATGAACTGCGAAAGAGATGAAAATAG
CACTAATACTGAATTTTAGCCTTTTTCTCTTATAGTCTCTTTAACTATAA
GTATCAAAGTTGTCCAATATGTAATATTTTGTGTAAAAAACAGGGGTGGC
TAAGAAAATATCTCATATTTATATCAGATTTTTTTTTGTGTCAAAATAAT
AATTGAATTATCTTTTATTTAAAAAAGAATCATAACAACCCAATGTTATC
GAACAAAATGGGGCAACTTATGTTTTTTTTTTCCATGAACGGGTCAATAT
TTTGATAGTCTCTGAATAATGGTTTGGACGAATATTATCTCTTCTAAGGG
ATTTTTTTCAGTTTTAGTTTTAAAGTTATTTATCGATGAACCAGAAGATA
GTTTACCTATTAATCATAGGACTTGAACTTGGTTGATAACATCTGGATTA
TTGAAGTCATTGTAATTCAAGAAAAAAGGTAGAGTATTATTTAATAAGAA
AATATCTTCCCGAGGCATTAAGACATTTATTGCAAATGACTTCAACTTTT
CTGAAGTTATTAAAACTTTCATGTACTAGGATTAATTTGTAAACTGTTTT
CTGGTCCATCGAATTGATCAATGAATATTTTGACTTCTTATCAAAATTAA
CTATTGTTTTTTCAATTATTTCTTTTTATATATTTCAATCAAAGTTAGAA
TTATTATTAATAATATTTACATTGAACATATTTTTTACTTTTTTTGTTTT
ATTAATAATGAAAGGGTGGTAATTAGTGATTTATTGAAGAAATTACATAA
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CCTGTTCCTCGATGTTCTCCATTTATCATAATCAACAAATTAGCAGAGTT
TTCAAATTTAGTTTCGGATTCAAATCCTTATTTCCCTGTTCCACCTTGTG
AGTATGGTGGCCCACTAGAGGCAATCAGAGCTGGTGACTATGAGGCGGKA
TTCGTACTTGCTCGTCCTGAGTTAGTTCCTCGTCACAATTTCTATGAATT
GGTTTGGTTCCTCAAGTTTGGAGCTGAGAGACTGGTAAGTCACGTTATAA
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