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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s219 | supercontig | LSalAtl2s219:309797..323182 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004146 >EMLSAP00000004146 ID=EMLSAP00000004146|Name=EMLSAP00000004146|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=798bp
MQFLIQTLSIILPFLILKSKSANVNVLWINDKSTGLIKDSVDIALDYVKK KNNVVVTSLESVMMNGNDIGNSTDKVCNKLKTMLDEGRSPDMILDTTSAG TLSEVVKSLSLSLGIPTLSTSYGDLRDVSLESMYFYYYVHIYSTSTFFQD SNTNFKCECNKLDLIYIKPSKPKSGAIINTISKDSNIEPKIDVGFYFEVA VRGLLGVSNAKDKSDWPELSIQKCSEFQDGAPKERSNLDLLSYFKSADIP DAYDPLSYGQNDDEIFMKFGVTIEKMKFLNSKLVKKEYIGDWTAQVSQDL IQYKTGMSLQGVGAKTIYKIVSVMQAPFISKEMINGKAVYSGYCIDLINE LKELIEFEYEIYESPDGQYGRMDDNEEWNGMIRELIDKKADIALGALSVM AERENVIDFTVPYYDLVGIIIMMKKPKLPTSLFKFLSVLEDEVWICILAA YFATSFLMWIFDKYSPYSYQNNVEKYEDDDEKRYFNFKECLWFCLTSLTP QGGGEAPKNLSGRLVAATWWLFGFIIIASYTANLAAFLTVSRLETPVESL EDLSKQYKIQYAPMNGSATMTYFERMAYIEDKFYEIWKDMSLNDSLSELE KSKLAVWDYPVSDKYTKMWQSMKEAKLPQTFEEALERVRQSPTSSEGFAF LGDATDIRYQVLTNCDLQMVGEEFSRKPYALAVQQGSPLKDQFNDAILKL LNQRKLETLKERWWNGNSNKKNCEEDDDSGGGISIYNIGGVFIVIFVGIG LAIITLIFEYWYYKYKVPQIQISDPNTKQLQIKQAHFRDKTDFSSTYK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s219:309797..323182+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004146-699993 ID=EMLSAT00000004146-699993|Name=EMLSAT00000004146|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13386bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s219:309797..323182+ (Lepeophtheirus salmonis) CCCTAGTAGACATTCACAAGGTGAGGAGCGGATGGAAATAGATTTAGTTC
ATCATTGGTTGTAGCATGGTTCAAGACTGAACAAAAAAAATAGTTATAAT
TTTTTTTAAATAATCAAACATCATGCAATTCCTAATCCAGACCCTTTCCA
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TGCTCTTTCTTCTTTTTTGTTCATTATTAAGTAAGTCGTCGTGGTGTTAA
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GGGGGGGCTACAGCCCRCCATCCRCACCCCTGCGGACACTCTTGTATAGG
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GTGGGCTTATTGTAAATTTCCTTCCTCTTATAATGGCTTMCTGCCTATCT
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AATATTCTTCCATAACCCATAATTAGTTTTTAAATTACCTTCTTTTTTTT
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TATTATGCACTCATATATCAACAAAATACTATTTGCCGATATGGGGGAAT
TATAAGTAAGGTTTTGAGCTATTTCCTGATGCTTATCATATAAAATTTAA
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GAATTTGGGTCACACGTAGTAAAGCAGCTAAAAACTGCGGCTTCCATGCA
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TCTGTTGTATCAGTGAAAAGACTCCATATATCATCATTTTTTTCTTATTC
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TGGGTACAGCCTCTCCAGCCCACCCCTGACCCTCATCCCAAGTATTGCAA
ATCCTTCATTTAAAATTATTCAATTTTTGGTTGCAACCTGTACACACAAA
TATATACATTTTATATGTCGGGAAACAAGCCACGATTTTGCTCAAGTTGA
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TAAGTTAGTTTATTGTGATAAGGATAATGCAGTAGTTGAATATTCCATGG
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CTGCCCTTTGGAGTCACAAATTGCATTTAGAGTAGACAAACCCGAGCTTC
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GAGCCAATATAAAACTCTTAAATCGAATAAAGATCGCTAACTGAAGCTAA
AATTATTGGATTATGTTTACTTATCCCATTAATTTGCATAGAAAGCCTAT
AATAGACTCAAATGTCTGGAATATTGGGGTTCTTGTAAAAAATGGGATTT
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ATTTGTATTATTATACCCTCATAGCTTAGATCAATATGCTTAATAAAATA
TTTAGTATATATTACGTAGGATATCAGGAGTCTTAAGAAAATAATTAATT
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TTAAAAAAAAGTTGAAAATTGTTAAGATTGAATGTCATTCATTTATATTT
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TAAAGTGAAGCTCAAGAGCCTCAAACCAAGATGAGCCCATTTCTCTATCT
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TTTTTAATAGAATATGGAAAGACATGTCTCTAAATGATTCTCTAAGTGAG
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TGGCGGTTCAACAGGGATCTCCACTTAAAGATCAATTTAATGATGCGTAA
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CTCAAATTGCTCAACCAACGAAAACTAGAGACTCTCAAGGAACGCTGGTG
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GAGGTATCTCTATATACAATATCGGTAAGGCAATTTCTAAAGTTAAGCTT
ATTGGAGATTACAAATAATATCATTTCTAAAACCTAAGGTGGTGTATTCA
TCGTCATTTTCGTTGGAATTGGACTGGCTATTATCACACTCATCTTCGAG
TACTGGTACTACAAATACAAGGTTCCTCAAATTCAAATTTCTGACCCAAA
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TCTCATCTACCTACAAATAAAAAATCAATAGTCAGTCATATATACATTCC
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TAAAATTTAAATCAACATTAATCTAAATAAAAATAATTAACAATACACTA
ATTGCGCATACGACTAAAATAAAACGATTCAAATAATTGTCTATGGAAAA
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AGTCCTCGAATGCGAAAATCTCCTTGGGAATTTGAAATTGCCTCAGAATT
GTCACAATTGTTACTTTCACCAGAAGCAACAACTACTATACCTGACTCTG
GATCTCCAATGAGAGATGATATCTTACCATAGCAAGAAAATGCAACACGA
AGTGCCTTAATATGCATTCTTTGAGTATCACCCTCCTCAATTTTAAATAA
GTGATTCTTGGGTTCAAATTCGTATTCACTAAGAATGGGCTTGACAAAAT
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GAACGGTTTCTATAGTTTTCTCGCCCTGATATGGATACAAGGACAGAAGA
AAGCGGAACATCCCCATCTGAGACAAACACTTCGATAGAAGCCAACTTTT
TGGCATTGAAGTCCCCATGCTTATCTCCAGAAGTAAAAGCATAACCATCT
TTATAAGCTATGATTGATTGTCCCTTCTTGATATCGTCAGCAAGTGGCCC
AATTTGGTAGACACCAGATTTATCAGAGAATCCATACAATTCATCACTAA
GCGAAACTTTCACTCCTTCCAAGGGAGGTGATATTTTTCCACGTACAAAA
ACMCCTTCTCGAGCCTCAAAAATTACAGAATCAAGCATACAATCATTTTC
AACACTTAAATGAAGCCTTTCGGGTTCAAATAGATGCTCTTTAGCTTTTG
GGGTTACAGTAAACTCTTCTTTAGATTCTGCAAAGAATTCAAAGTGGCTA
TTGCTTCCTTTATTCTCAAAGGGAATTTTTGATGCACTGTTCTTAGCCCT
AGATGATAGTTGTATTTCCAAATCAGATATCAAAGCTTTAGATCTAATAT
ATCCAGATATTTTATGACTTTTCGCTTCTATTGTTMCTCTTTTGGTATCC
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CCTTTTTCAATTCAATGTTTTTCTTCTTTCCTAAATATACTTTGAGATTA
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TAATATCTCCCTCTTCTTTAGCAATGGAGGCTGTATATGTACCAGGAAGG
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ACATTACTAATAGGTTCATCTTTGACATTAATCGCATGATTAACTGGTGC
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