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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s224 | supercontig | LSalAtl2s224:660406..681725 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004291 >EMLSAP00000004291 ID=EMLSAP00000004291|Name=EMLSAP00000004291|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=424bp
MRLEILEKPDANEDQLCFLCGTPSKNKCSYCDLVYYCGDPHFKLHRPEEL CFPFKISQRKNVGQVMVATRDIEPLGTLHFTIKKTSIKTELILYDTTQAF GPKNSSIVCIECLKIDPKGNCKSCKWPICDENSKCQGKHLLHSLRECEIL QTSKNKEVLENPSKLVDYVCAIXPLRLLLLRDTNPDEFERFQYLMDHNEE RRKDDGIWNGYKKYIIDFLRDDFKEEEIERASGIFWTNAFSCSXGGGQAV FPTFSFVSHSCTSNCDHTVFPQRHLVLQSKVHIAAGTELNINYISPIQGR LKRRSKLRCKWFFDCICDRCLDATELGSHLSSHLCEFCGEILLPSDPLIM DSNYVLNGICKMDSGYNRDRGMVLQYLCDAQKKLNRLLMSLGRISEEEFK SRVEVCMKNFNEANECLLMKIKKN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s224:660406..681725+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004291-700138 ID=EMLSAT00000004291-700138|Name=EMLSAT00000004291|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21320bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s224:660406..681725+ (Lepeophtheirus salmonis) CTTTCCTTCACCCTCCACACACTACTCAGTGCAAGTACCTCATGTTATAA
ACACGTTTAGTTTATCTATGGGGAGTAGATTACTAATTAGGTAGCACTAT
GCGTCTAGAAATCCTGGAAAAACCGGATGCCAATGAGGATCAGCTTTGTT
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TATTATTGTGGGGATCCTCATTTCAAACTTCATAGACCGGAGGAGGTAAT
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AATGATTATCAAAATTGATTTGGGATTATATTTGTATTCTTCAACGAATA
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AATAAGATTTAATTGCATTTTTTTTACATTTTCGACCTTTATTTGCATTT
TTAGACAGAAAATACGTATTAGTGCACTCGTTCCATTGTAATATCCCTGA
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TTTAGCTACATTCTTATTTATTTGGATATAACTAATTATTTTGACTAAAA
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TGTTCTTTTGATTTTTCAATTTCCCTTTTTCAATCTAAGGTATTCAAGTT
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TGAGCAGAATATGATGAAAATTTGTTTATGTACAATTTTTTTCTCTTGAT
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GCTCTCTGAATTATAAATMTAGCCGTAATTAGAGGCAATGATAGCTTCCA
GGTGGTGGCGGAAGGCCTGAAAAATGCTCCAGATGTATTTCTCTTAGCGT
CCCCTGTTGGCTGAATGTAACTTTGAGGGCCTCAGTGTTCGGGGGACGGC
CATTTGAGCTCCTCCCCTCAATATGCACCCAAAAGGTGTAGTTGAGAGAG
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GACTCATTCAAAGGAGTCTTGTTGTAGTGGAGATGGAGTTCTTTTATTGC
TGATGTCAAAAGTGACATCTCCACCCTCGCAAGACTTTTTCTTCCCGCAT
TTTGATAGCTCTCTGGACAATATGCTGTGAAACCCTTATATCTCTTGAAT
TGACCCTCTTGGACTTGAGAGGATTGCCCCTGGCTGTTTTATTTAATTCC
TCTTGGTCTAGTTTTGCCTTTTTGATAGCGACATTCTTCCTTTCCAACAT
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TGGAGTGCGTCAAAAGAAATTTGTTAATCACGTTCAGTGGCATTTTTTCG
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TATTGAATTAGTAATTGTTCAGATTTCAATTGACTACCTGCTACGAGTAT
GTTTATAATTTTATCTTTGTATGGCTGAAAAATAATGTCATTTACTCTCA
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GGAACATCTAGTTTGGTAGAATATATTGATTGATAAAAAAAATCAATTAC
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GGAATCACTGCCCTAAAGTATTTTTCATATATGATTCAAAAAACAACTCT
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ATTCAAGGAAACTGACTTCTAAACAAATACTTGATACTCGAATCGGATTT
GCAATATTAGGATTTTCCCCCAATTCTACGATTTAGCGTATTAATGATAT
GGCGTCCAAGTTTGATTAAAAGTAATACTTCATGAATCTAAATCTATTTT
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AAGTGGATGATAATTTGAAGAGGGATATAAAGTTCTTATTAAGTTTGGAG
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ATTAGTTTCTTACACAAGGATCCCACACCATCTTCTGATAGAGGGAATGA
AAGCCAGGAGACTCAAGAGGTGTAAGAAAATACTCACTTGGATCAAGGAT
TGGAACATTTTTACAGTTGATCAATTCCTCGKCAGCCGGAACGACTGCTG
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CGGCCCAAACAATATTCTTCAGCGTTGTGGCCTCTGATGGAAAGAATATA
CCTCCGTTCTTTTTCAAGACTGGAATGAAAATCTAAAAGTAGGCCTACTA
TTAATTGCTTTTGTACACCARCCTGCCATAGCTGAAGACCAACTACCCGG
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CGCCAAAAGCTCAATGCAGATTACTTTGGGTTGATTCTGGTCCAAAGAGA
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CTGGAGTCATCTATAGTGGTTGCATGGGACAACTTGTCAGAGGAGTTTGT
CTTCAACTCCTTTATGCCCTTCAGGCGACGTGCAAAGCCTGTGATTGATA
ATGGAGGTGGCCATATTGAGTGAAAAAAGTTATACAAAAACCTTCTCTAC
ATGATTTATTAACATTATTTCGTTGCCAATTATTGAAAATATAAAATTAT
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TGTATCTTTGTTAACTATTCTGAAGTCGATAAAATAATGCAAAACCCATT
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AACAGAACTCATTTTATACGATACAACTCAAGCTTTCGGACCGAAGAATT
CATCCATAGTTTGTATTGAGTGTCTCAAAATTGATCCAAAGGGTAATTGT
AAGTCTTGTAAATGGCCTATATGTGATGAAAACTCAAAATGTCAAGGCAA
ACATCTACTACACTCATTGAGAGAATGTGAAATCCTTCAAACCTCCAAAA
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AATTTATGAAGGAGGTATTAGAAAATCCATCCAAACTGGTGGACTATGTT
TGCGCCATTYCTCCTTTGAGACTTCTTTTACTTAGAGACACAAATCCTGA
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AAGATGATGGTATTTGGAATGGATACAAAAAATACATCATAGATTTTTTA
AGGTACATATGAWCAATTTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGATTTT
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GCCTCAGAACATTTTGGGTCAAGGAATTGTATATAAATAAATAAGATTTA
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TGTTAATCAAAATATATAATATTTAATAGTATAAATGTTTATTGTTTGTT
TTCTGTTGGAATAATGAAATAATGATGTTCTTCCCTCATATTATGATTAT
TCTTCAATCCATGAGTATTTTCTAGCATTCATAATCCATCATGTCTAATG
GTAATTACTAACATAGAAGCGATTAGAAATTCTTCTATTCGATTCGTTGC
CCTGTTTATTTATTTTCGTTTTTACTATTTTTTCTGATTTTAATACCTAC
TTTTTCTCTGGTTTGAATTCATTACGTAGTAATATTTTTTTGGGGCTATT
TATTGAAATTTAGGGGCTTAATTCAATCTTTCTTCAAAGAGAAGAAACCT
TTTCATGCGTTTTATTGTAATACACATTACAACAGGTACTTCTAAAACAA
CCTATCCTGAGATATTTTTGTACTTTTTTTTACATTTTTTAAACAATACA
ACTCCAGTTCCAAAGGAAGAAAAAAACTATATATCCAGTGGTACGAATTT
TATTATTTTCAATTCTGAAAGGTATTGTTGCAATATCACGAAGGAGGACA
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CAAAGTCTTCCCTCCCMTTTTTKTGTAGAGGAAGGRGCGGCTCAATCCAG
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AATTTTGGCGACAACTTTGATTTCACTCAAAACGGAGCTCCATGTCATCG
CATTGCTAAGAACCAGCCCTTCCTGAATGACTATTTTACTAACTTTTGGG
ACCTCAAGGTGTGTTTACTTCTCACAGGAGTGTCCAGTCTTTAGAGGCTT
CCATCAACCCAAGCTCAATTCTTWCTACATAGTTAAGGTCTGCATGGGGT
TAGGCCTTTTATTAAGGCAATAATTAGATCTCAGAGCTCACATAGATAAT
AAAAGTTGTGCCGAGCAGTATTTTCAGATGATTTTGTAAAATAAATGTTC
TCACAAAAGCTCTTCTTTAAATTTTACTCTTGAAAAATTGAAAATGATAT
ATTTTGTATCACTGGATAAGATCCACCCTATATATAAAAGCAAATTGAAC
AACTAACAGAACATTAAGAATAAAAACCACACAATCTGTCAAGATCAAAA
CGATATATCGAAAGAAAAAAAAATATTACCTAATATCCAATTCCAAACAA
AAAGTAAATAAAAGTGACATTATTTTATACATAAATAAGTTTTAATTCTA
TATTAGACAAATTTTTCGAGAATTGTGCTTTTATAAAAAGGGAGTTTTCA
AATCACATCGCGCTATAAGCGTAACAGAGTCTATATAGTTATTATCCTTT
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CATTTGACTTCATTGTGTTTTATTACAAAATCACTTTATAACTAAAATAG
TTAATTTCACGTTGAAAATACAAAACAAAAAGTCTTAATAAAATTTGTAT
TTCTAAATATGTATTATTCAACTTTAAAGAATATTTATTGATAATGCAGC
TCCATACTTTTAAAATATGTAAACATTCCTCGAATTAAGTAAAATTAGAC
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TACATTATCTACTTGTATTAATAACAACTATGTGGGAAAGCTGTGCTTTT
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TGATAGGCCACAAATTTTTTTGGAGTTGTGTAGTCTTTTTGTAGAGAAAT
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AAGTTGGCAACCAGATATTCAAATTTGTAGAATAAATTCAGATATACAAG
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GGTGCTGATATGACCTTTACAAAAAAAAAAAAAAGAAAGATATATATATA
TATCCATTTTTCTATTTTTGTATTGTGACAATCAATTTTAGTTATTTTAA
ATACACTTTGCAACACACATTTAAGATACTCGGGGCCTGATATAAAAATC
TATCAATTATTCGTGATTTAATTGTGACCATAAATTTAGGCTATTTGAAG
TGTAATTTGCAGGCACTCTGAAGGGTTAATAAACATAATTTGTAGAATAA
TACAAATGTGACCTACACTTAATTTTAAGAAAAATGCTTGTAAATTGATT
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CTTTGGGTTCCTTTTCCCTCAATCTAGACTTGATTGTAATCTAAGAGATG
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GCTTTTTCTTGTTCCAAKGGAGGAGGGCAAGCCGTTTTTCCGACCTTCAG
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AGCGCCATCTTGTTCTACAATCAAAGGTTCATATTGCTGCTGGAACTGAG
CTTAACATCAATTATATATCACCCATTCAGGTATGTAACTTTTTGTATGG
AAATTTTAGATCAAATATTATTTATTGATTTATATTGTATTTTCATTTGA
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TACCCTAATTAATATAAAAGTAATTAGGGAACTATTGGATGGCAAAAGGT
GACCAACAATTAAATATATTTATACCTTGCTGTCTATCAAAAATATATCC
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TATTACATCGTTAATACAATCTCATATAGTGTAGATGAAAATTAACTATA
CCAATGAAAATAACAAGATATTTTTCTCATATTATCCTACTTTTCTCGAC
ACTAATCGATCTATAAATATAAGTAATTGTAAAAATCTATTCATTTTTAA
GGGATTTTCAGAAGATATAACTTTGTTTATATTTAAATATCACTGTTTAT
CATTGATATAAAGAAGTATTCAATGCAGGTGGGAAGTTTTTTAAAAATCT
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ATGAACTCCCAAAGATAAAGTCTCCTTCAACTATGATGCAATTTATGATA
CCAGTCATGAAAGCTCTATAGATATTTTACTCGTGACGTCACAATGTTGA
TGTCTTCTATTTTGGTGGCCTAAGCAGGCAAGTTATATAACAATGAAAAC
TCTTTTTTAATCAATAATTGAGTAGGTTTGTCTGGAGTTGCTAAGACATT
ATGAAATTAAAGTTAATTCTGAACTCTTTTGCATTATATAGAACTAAAAG
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ACTTATTTTTAAGGGATATTAATACTATAAGGTATTTATCCTTGAGTGCT
AAATCCAAAACTAATCTCAATGTTTCTCTCCGTCATCTGAATTCTGAAAT
ATCTGGAATTATAGTAATTTGGGATTATTATCGTTTCAAGTCATTTTTTC
TCTTAAAACAATCCCAAAATTATAATTAAAGTTAAGAAAACTTATGTAAA
AAGTCTATTTAATGATTGTATTGTCTTTTTATTGATTATGTATCTTGTTC
TGAACTCGATATATTTCCATTTTTAGGCTGACAAATGTTTAAAAACGACA
TTCTTCTTTAGACACTTATAACTTATTCATAATACGTATTGATGAGGAAT
ATCATAGCTTTATATTATAGAAAAATATTCAATAAAAAGAAAAAAAAGAT
CTATATAAAAAATATGCCTCTCCAAGGATTTTTCGAATATTGTCATTAAT
TCAAAGTTTAAAAAAATATCATCTACCGGTATGCTAAAAAAGCTTTAGAC
AGTGGTTTTGGGGGGCAATCGCTATCGTTGAAAATATGCTAAAAAAGGAA
CCAGATATTAACGTGGTCACTCTAATAATTTGATGGATGTTTGGAAGGAG
AACAAGTTATCTGTAGTGACGCTTCATTAAATTAGCTGCATGTAGATATG
AGATATAAAAAAAAAGCAAAGAATTTACACGTTTCTATGTCATATTATCT
ACAACTCTTTGGATGAACCATCTGGAAATTAACATTTTAGACATATAATG
AATATAATTGTAAATTCTAAATATTTCAAGCGTGCATTTTTTTTGTTATA
TTTTTTTGTTATCCACCTGTGTATTTAAGAAAAAGAAACTAAAAAATAAC
GTGGTCACTATGACAATTTGAAGAATGTTGGAGAGAAAAACAGCTTAGCT
GTCATGACGTTGCACTAAATTAGATGTAAGTAGATATGAGATSAAGGAAA
TAAATGAAGACCCTACTCCGTATCTATCTAGTAGTGATATAACAGGAGTT
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TTATAACTGAGGAACAAATCCTTAGTGTTACTCTTCGTCTTTTACGCACT
AGGGATTACTTTATATTTCTATTTTCTATTTTCAAGAGTAAAATACTAAT
GATAACAGATATGGAACAAAATAACAACACCTTTTCTGGTTGGAACTACA
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ATTCTAATTGTTAATGMCCTGACAGCCTCTATATCTAATATAAAAATATT
TTAAAATTACTCGGTCGAAATTCTTAGAAATGGTGATTGGATTGATGAAC
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CATAAATACAACATAGACAAATTATACTTTTACTGAAGCACATTCAATAA
TTCTGTCAATACCTAGTACCAAAAAATGAAGTACTACGTCTTATTTTAGT
TTTAGGTTATCACATCATGCTTTATGTAAAAGTAATTATAAGTTTTGTAA
TAAAATTAAATAACATCTTTGGAGATGAAATGNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GGGAGGGGTTGATGAAAACAACCACGTGCGTCTATATTGAGGGGGGGGGG
GGTATAGTTWTGMGAAAAAYAACCACGMGATATAWAGATGTCCCTTTAGA
CTGGCGCTTAAATTGGTATATTTCGAAATGTTGGGTAGACATATTCCAAA
AATATTCTGCATGATAAAAAAATGAAGAAATATAAAGTTTGAACGTTATT
TAACAATGTTTAGAGCTTGGATAAGGACCTTAAAGTTCTGAATTTCACCA
TTTTATGAAGAAATGAAATAGTCAATATAATCCAAAATAGAGCAAACATA
AAAAAATATTATTTTAAAATACTAAACAATATTTCAGAAAGCATAATAAA
GTTTTCCCTTAATTAACATATTTAAGAGAGAAAAAAAAAGAATTTTTTAT
TATTTTTCATGTATACCTTGAGCTTACGTTAATGTCTGGAAAGAGGAGAA
GACAGTACTACAAAATTAAGACCCTTGTTAATTACAGCTGCCTATTAGAT
GATTTTGTGAGGAGAAAATAAATTAAGTTCCTATACAGAAGAAAAAATTA
ATACATTTAGATAATAAAATTTACACTATACATAAATTGATATATATTTA
TTTTAATATGTATTTTGTAACAATTTACATCAAAGATAGGCGAGAATTCT
TTTCTCAGACGAAGATGTAAACACTACGATGATCTATTAAGGAATGAACA
AAAAATAAAATAGACCGCATGCAACAAATGTTTCTTACAAAAATGTCCAC
TCTATGTACAAGGGTCGTTTGAAAAGTTAGCGGAAAGTCCGAGAGATGGT
ACTACTGGCGCTTATCGAGGTTATGTTTATTTAGTAGCTATCTTTTGGAA
GAATAAACACTAACTTTCAGCCAGATCGGTCCATTTCTTTCTGTTTGGCA
TTCGTTGGAATCGAACAAGTGTAGTGATTTTCTAAAAATGGACAAAAAAG
AATTTTGTGTGTTGATTAAACATTACTTTATGAAAGTAAAACACCTCAAT
AGACTATAAAGAAGCTTGAGGAGCATTATGGGGACTCTGCACCTTCGATT
AGAATAGTTAATAAGTATTTTCAATTTTTTTGGATCGGTCATATTGCAAA
GTGACGTTGAACGTTCTGGACGCCCTGTTGAGGTTATTACTCAAGAAACC
ATTAATAAAATACATGACGCGGTAATAAATGACTGAAAAGTAACATTGCT
AGTGCTATGGACATCTCCAGTTGGAACCCTATTTTCATTAATTTAGAGAC
TACAACCACTGAGGCGTGAGCTGGTGCATTGTCATGATGGAAAATAACTT
TTTTGTGGGCCAATCGTGGGCGTTTTTCTTACATCTCGGTTTTCAAACGG
TCCAATAACGATAAATAAAACTTGTAATAGTTTTACTCTTTTCCAGATAG
TCTATCAGGATTATTACTTGTGAATCCTAAGGACAGTTGGCATAATCTTT
CCAACTGATTCCTCGATTCCAACAAACGCCAAACAGAAAGAAATAGACAG
ATCTGGCTGAAAGTTGGTATGTGTTCTTCCAAAAGATGCTACTAACTAAA
CATAACCTTGATGCGCGCCAGTAGTGCTATCTCCCGTACATGTACTGTTC
AAACGACCCTCGTAGAACATAAGATCAAAACATTTTATTAAATCTCAATA
TGCATTTTTTGGACCTAATCTTCCTTAAAGAGACTAAATTAAGGAAAACG
TAGATGGGGTGAAACAAATAAAATATATCTAAAATTATATTCACTCATTC
ACACACCCTTGAACAAAAAATGATTGGGTATGGGACTTTTGTAAAACGCG
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AACGGAGTCAGTAGATGTAGAAAGCGCACTTATACAATTTTAAATCTATT
CTTGCACCAGGTGATAATTATTATTGAATGATATGTTTGTCACCTGCTTC
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