EMLSAT00000004291, EMLSAT00000004291-700138 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004291
Unique NameEMLSAT00000004291-700138
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s224supercontigLSalAtl2s224:660406..681725 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004291 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004291EMLSAG00000004291-687057Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000018650EMLSAE00000018650-727578Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018651EMLSAE00000018651-727579Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018652EMLSAE00000018652-727580Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018653EMLSAE00000018653-727581Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018654EMLSAE00000018654-727582Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018655EMLSAE00000018655-727583Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018656EMLSAE00000018656-727584Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779178auto779178Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004291EMLSAP00000004291Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004291

>EMLSAP00000004291 ID=EMLSAP00000004291|Name=EMLSAP00000004291|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=424bp
MRLEILEKPDANEDQLCFLCGTPSKNKCSYCDLVYYCGDPHFKLHRPEEL
CFPFKISQRKNVGQVMVATRDIEPLGTLHFTIKKTSIKTELILYDTTQAF
GPKNSSIVCIECLKIDPKGNCKSCKWPICDENSKCQGKHLLHSLRECEIL
QTSKNKEVLENPSKLVDYVCAIXPLRLLLLRDTNPDEFERFQYLMDHNEE
RRKDDGIWNGYKKYIIDFLRDDFKEEEIERASGIFWTNAFSCSXGGGQAV
FPTFSFVSHSCTSNCDHTVFPQRHLVLQSKVHIAAGTELNINYISPIQGR
LKRRSKLRCKWFFDCICDRCLDATELGSHLSSHLCEFCGEILLPSDPLIM
DSNYVLNGICKMDSGYNRDRGMVLQYLCDAQKKLNRLLMSLGRISEEEFK
SRVEVCMKNFNEANECLLMKIKKN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s224:660406..681725+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004291-700138 ID=EMLSAT00000004291-700138|Name=EMLSAT00000004291|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21320bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s224:660406..681725+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTTTCCTTCACCCTCCACACACTACTCAGTGCAAGTACCTCATGTTATAA ACACGTTTAGTTTATCTATGGGGAGTAGATTACTAATTAGGTAGCACTAT GCGTCTAGAAATCCTGGAAAAACCGGATGCCAATGAGGATCAGCTTTGTT TTTTGTGCGGAACTCCATCAAAAAATAAATGTTCTTATTGTGATCTCGTT TATTATTGTGGGGATCCTCATTTCAAACTTCATAGACCGGAGGAGGTAAT TTAAGACTCTATTTTTAACCCCCCTCAACACAAAAAAAAAAAGCAAGAAT AATGATTATCAAAATTGATTTGGGATTATATTTGTATTCTTCAACGAATA ACTAGAGTCAAAATTTTTTTTCTCTTGGATTGAGATGATGTGTTTCTGAT TTCCTTTACCTCCATAGACATTAAAGTGTGTGTTTAAACCACCTACCTTA TGTTTTGTGGTCTACAGAGATAAAATTTTTATATTATGCTAATACATTAA AAAATATACAAAACATTATTATTTATTATAAAGTCGTATTTCTTCACTTT TCGACAAATTATAATTGTCATTATTAATTAAGTGATGTCCAAATTGTGTA AATAAGATTTAATTGCATTTTTTTTACATTTTCGACCTTTATTTGCATTT TTAGACAGAAAATACGTATTAGTGCACTCGTTCCATTGTAATATCCCTGA TTACACACTCTCTAAGTTCCCCCCTTAAAAAAAGAGAACTACGTCTGTTA AGTTCTTCTATAAATATTAAGTGCATCCACTTTTCTTTTCATTACCAAAA TATATTATCTACTGGAAAACACTTGGCTTTTATCGATATTTATTTGGATA TTTAGCTACATTCTTATTTATTTGGATATAACTAATTATTTTGACTAAAA ATGAGAAATTGACTAGATTTTCTCAGTTAAGTCCGACCTTATTTATTCGG TCGTGTCCGGTCTTAGGTCCAGTCCTTCGGAACTGGAACGGATTAAAAAA ATTGTGAATAAATTTGAGTCATATCATCAAGAGCCMAATTTTAAAAGTTT TAGGACTGATATACAGGACTGAACTGCACCGAAAAGAGACTGAAATGACA GTCTTCAGTCCTAAGTACGGACCGACACAAAACTACCTACAAGGCATTTT CTCCAATACAGAAATAATAATTACATTTTTGAATCTGGAAACATGTACCT ACTAACTATATTTTATGCATTTTTCTTATATTTAGATCTTTCGAGACAAA AAATAAGTTATTTAGATGTTGAAAAAAAAGAAAAGGATATCTAAAAAAAC ACTCTAAAATATAAATTTTGGGGTTTAAAGTTCATTTTCTTATGTTTCCG GGTATAAATAATCAGAAATACACCATTTGAATCAAAAGGAGAAAATGGTA GAAATTTTGTAGGCTAGTGTTGCGGTTAAGCCTTTGTTCGTGAACTGAGA TTTTTTGCAGCCCAAACTCGATGAAACTGTTTTAAATGTGTTTAACATAG ATTTTAATGCTGGAAACAGCATTAATATGCTCCTGAAATATCTTTCAGAA TGAAATCAGCTTTTGTTGTTGTAAAAATTTATTTTCTTGAGACTATTTTT AATTGTTAATCCAGGTTTGTAGAATTTAAGTAATTTGTTCTCTTTTTAGC TGTTCTTTTGATTTTTCAATTTCCCTTTTTCAATCTAAGGTATTCAAGTT TCTACAAGCGTAATATCATCTGTTATCCCATATACCACACCCAATCTCAT CAAAGTTCATGACTACATTTTTATTAACAAAATTTCGTCAAAAGTAATTA ATATTTTATTTGAGTGTTAATCGAAAAGGAACTTATAATATTTCAATTGT AATAGTCTTAAAAAAAAAACCTGTTGATGCCCAAATTAAATTTTGCTAAG 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AATGTCAAAACAAAGTATCTATAGAATGAATAGTTAAGTGTATAGGMAGG MTTCATATTACACAGGGCCCATGCCACCCTAACTTTCTGAAGTAGTGATT ACCAACCTTTTCATTACTGTGGAGTCCCTCGTTGTATTTAAACTTTCTAG GGAACATCTAGTTTGGTAGAATATATTGATTGATAAAAAAAATCAATTAC ACTATAATTTTTGATGACTTTTTTCTTAGGAAAAAAAATACTTGATCATC TTTTTTTATTATAAAACATATTAGTTGGTAATATCGCAAAGCTTCGGTTG GGAATCACTGCCCTAAAGTATTTTTCATATATGATTCAAAAAACAACTCT ATACGAGTCAGATTTATGGACTCGTTGTAGGTACTTACAAATTCAAAAAT ATTCAAGGAAACTGACTTCTAAACAAATACTTGATACTCGAATCGGATTT GCAATATTAGGATTTTCCCCCAATTCTACGATTTAGCGTATTAATGATAT GGCGTCCAAGTTTGATTAAAAGTAATACTTCATGAATCTAAATCTATTTT TGAACTTTTCCTTCAATGTACAGGGTAGGGCAGCAAAAGTGCGGACTGTT AAGTAATGTTTATTTTCTCATTAATATGAAAAGMTTTATTCTGTRCCAGC CGTTCTTTTTACATACACAAACTATACTAATCATTTAGTCATTTCATCAT TATAAGCGATCAACAAGCAAAAAGGCAGCACATCTTAGATCTCCTACATG CTTGAGTTTATGGGATGAAAATTACGGACAATGTTATCCAGGATGTCAGG AAGTGGATGATAATTTGAAGAGGGATATAAAGTTCTTATTAAGTTTGGAG AACAATATCAAGAGGATCCAACTAAGTGGATGACTCGCCTCGCCAACACC TTCTCTGTAGCTCCTAGAACCAACAGGAGGGATATAAAGCACAACTTGGT ATTAGTTTCTTACACAAGGATCCCACACCATCTTCTGATAGAGGGAATGA AAGCCAGGAGACTCAAGAGGTGTAAGAAAATACTCACTTGGATCAAGGAT TGGAACATTTTTACAGTTGATCAATTCCTCGKCAGCCGGAACGACTGCTG ACATTCGTAAACAAAAGAAGAGGTACAAGGGGTTTACCACACTAAATATC CGGCCCAAACAATATTCTTCAGCGTTGTGGCCTCTGATGGAAAGAATATA CCTCCGTTCTTTTTCAAGACTGGAATGAAAATCTAAAAGTAGGCCTACTA TTAATTGCTTTTGTACACCARCCTGCCATAGCTGAAGACCAACTACCCGG AGGGTAACTATGCGTGGACTCAGGATGGTGCCTCCTCTCACCCCGCTAAG CGCCAAAAGCTCAATGCAGATTACTTTGGGTTGATTCTGGTCCAAAGAGA TATGCCCCCTTTCTCACCAGATTTGAACCCACTGGACTTTTTCGTATGGG ACACTTTGATGAGGGAAACCAACAGCACCTCACACCCAAATGTGGACTGT CTGGAGTCATCTATAGTGGTTGCATGGGACAACTTGTCAGAGGAGTTTGT CTTCAACTCCTTTATGCCCTTCAGGCGACGTGCAAAGCCTGTGATTGATA ATGGAGGTGGCCATATTGAGTGAAAAAAGTTATACAAAAACCTTCTCTAC ATGATTTATTAACATTATTTCGTTGCCAATTATTGAAAATATAAAATTAT TAATGTATTTGTAAGTACGTCTGTCGAGTCCACGTTTTGCTACCCTACCT TGTATCTTTGTTAACTATTCTGAAGTCGATAAAATAATGCAAAACCCATT TATTTATCATGATAAAGTTTACATTTTACAATAAAAAAAACATCTATCAA AACAGAACTCATTTTATACGATACAACTCAAGCTTTCGGACCGAAGAATT 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CCTGTTTATTTATTTTCGTTTTTACTATTTTTTCTGATTTTAATACCTAC TTTTTCTCTGGTTTGAATTCATTACGTAGTAATATTTTTTTGGGGCTATT TATTGAAATTTAGGGGCTTAATTCAATCTTTCTTCAAAGAGAAGAAACCT TTTCATGCGTTTTATTGTAATACACATTACAACAGGTACTTCTAAAACAA CCTATCCTGAGATATTTTTGTACTTTTTTTTACATTTTTTAAACAATACA ACTCCAGTTCCAAAGGAAGAAAAAAACTATATATCCAGTGGTACGAATTT TATTATTTTCAATTCTGAAAGGTATTGTTGCAATATCACGAAGGAGGACA ACATGAAATCCAACCTCTCAACAGAACAAGCTGAAATGATAGGAAAGAGC AAAGAAGATTCTATATTTTCTTTAGACCACTAAACAATTCGGGTGTAGTT AGGGTTGTTTGTTCTGATGTAAAAAAAAATCACCTTGGATGTCACTGTGA ATAAGCAGAMCAGCCGCTAGATCACAACTGAAAATCCAGACAATGTCTCA GCTTCAGTGATACATGTCCTCAGAACAAAAAATCCAGTGGCTARCACAGG CAAAGTCTTCCCTCCCMTTTTTKTGTAGAGGAAGGRGCGGCTCAATCCAG ATGCTTAAATTGAACTTTTGGATAAGAAAGTTCTACTTTGGGCTAGTGAA AATTTTGGCGACAACTTTGATTTCACTCAAAACGGAGCTCCATGTCATCG CATTGCTAAGAACCAGCCCTTCCTGAATGACTATTTTACTAACTTTTGGG ACCTCAAGGTGTGTTTACTTCTCACAGGAGTGTCCAGTCTTTAGAGGCTT CCATCAACCCAAGCTCAATTCTTWCTACATAGTTAAGGTCTGCATGGGGT TAGGCCTTTTATTAAGGCAATAATTAGATCTCAGAGCTCACATAGATAAT 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TGGTACAGCCATATCCCGCATATTTAAAGTAAATGAATTAAAAAACTTTA CAGCATTCATCAGTCTAGAAATGATTAATTTCAATGTCGTTTTCACCTAT CCATGGACATAGCAGTATTTTTTTAAAGTGGTCTTACAAAGGGGCCATTC TTAATGAAAAAGTCCTTTGTATGTACATAGAGAACTTCTGGGTTTTTTTT TTGCATTAATTTCAAGGCTAGAGCATAGAGAGTATGTTTTCAACATTTTC GTCTCTTTTAGAAAAAAATTTAAAGTTTGAAGTGGAGTACCAGTAAAAAT TAAAGTCAAGTCATATGTATAATATAAGTATTTTATATAAAAGTTGAAGA ACTAAGAAAGGTCTCCCTNCATATGTATAATATAAGTATTTTTATATAAA AGTTAGAAGAACTAAGAAAGGTCTCCCTAGTTCACACCTCTTTCGTTGTA AAACAAGCATTTTTAAAACTATATTTAACCTATTAGCAAGAACGTAGGAG AAGATTTTATATATTGTATTTTACATTTTTAAAGGACAGAGGTTATCTAA ATATCTAGGATCTTTCTCGGGGTTGGGAGTTAAAACAATATATATTTCAG ATGCATAACTAGGAAAATATCTAGTTGACGTAACTTCTTCATTTATAGAA AGAGGAATTGGTGAAAATTGGTTTGAATATTTTTTATAGAATTCAAAAGT AAATCCAGAGGAGCCAGGTACCTTATTTAACTTAGCGTTATTGGTAATAG CTGTTTTTATTTGTTCAACACCCATTTGACATTCAATGACATTGTTGTCT TCTACAGACACATTGAGAGAGCTATGAATTTCCTTATATAGTCATGACCT AATTCTATATTGTGAATTTCACATCTAGAGCATTTACACAATTTTCCACA ATCAAAACAACCATACAGTTTCGAATAAAAACTTTCAATTTCATCACATG 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