EMLSAT00000006932, EMLSAT00000006932-702779 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006932
Unique NameEMLSAT00000006932-702779
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s393supercontigLSalAtl2s393:483852..511695 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006932 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006932EMLSAG00000006932-689698Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000030471EMLSAE00000030471-739399Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030472EMLSAE00000030472-739400Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030473EMLSAE00000030473-739401Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030474EMLSAE00000030474-739402Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030475EMLSAE00000030475-739403Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778156auto778156Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006932EMLSAP00000006932Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006932

>EMLSAP00000006932 ID=EMLSAP00000006932|Name=EMLSAP00000006932|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=380bp
MNYSSIITITEQNVNITIECPDYGSYDIYLLNQFSFWLEGIVKCVFAVAG
LIGNFVSARILKKEDMRNSFNLMLIALVCMDSTYLLSSIIESFRISFNMA
TELHIHLFPYLLYPVLSVAMTASVFMTVGIALERYIAVHYPIDYSQAINS
QEACKKRLLRYVIPVTLLSLIFNIPKIFEAEVYDEINIAQYNETHEQVEY
YKAIRTTELRKNPDYVIYYNNWVRLMVIGIVPFFLLIYFNYKIYQDVKDR
NITRQRRTSTHTSSANQQTRRKQEDNLAIVFMGIVLVFLVCHFPRLFLSM
YECIVIREAFICQKKGLHSFPVWLLLTSGFSHVLLVINSSNGSNTSGGDN
NQTQIYNMSPSLHGKITKHDDNKVSIESKV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s393:483852..511695+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006932-702779 ID=EMLSAT00000006932-702779|Name=EMLSAT00000006932|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27844bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s393:483852..511695+ (Lepeophtheirus salmonis)
ACTTTTTACCATATCTTAGCATTAGAGGGAGGAAACATAGGCGGAGATAT ATCACAGGTACTGTTTGTAAAATTATTCTATTATGATTTGATTTTTTTTA ATATATTTTTTTAATTGAATGGATGTCTGATAGTCTAACAAAATGTGAAT TTTATTTTTGTAAAATTTTCATTGTTTCATTCCTTATACTAAATAAATGT AATATGTCATAATTAATTATGAATTCAGAGCCTTTTTAATTTTTGTATCA GCTCCATATATTATCTATTTATTTAGAAATGTTTAGCTCATAAACCAATA TATTCGTTAGATGTTATTATTAGTGTCAGATATTCAACTTTAACTTAAGC GTTATACACACCTATTAAACTAATTTATTTTCCGGGTATTATATCATACA AAATATGGGGGTTTTTTTATAAATTTATTGAGGAATTAGAGGTAAAAACC GGCATTGTTATTAGGCGTCAAGGAAAAAAAGACTTTACTTAATAATATAG AAGATAATTCCTCAAGAAATCCTTTGTGTCACTCCTCGTTTCTCATGAGC CCACTTACACATACTTACTCAATACTTAGATGTTCTCCTTTAGAGATAAA AATAATAATAGTACCGACTTCATATTTTTTAATTTGACGTGATGAGCCAG AGACTATTAATTTAGTCAACAGATTAAAGTACTCCCTGGTTGAGCTTTGA CTCCACACCACACTCATTACTACCCTCATCTAGGGTAAAATTCTTTATTT TTATTAAATGGACTTCCCTTTTCTTTTTAATATGAATTTTATTAACGCAT ATTCGTTGTTAAAAATGAGTTTTCTACTCATATTTTATACATTATAGAGT TGTATAAAATATGACTCAACCTAAATGTCAATTTAGGGGATTTAATTCAT TTTGACGTACCATTTTTATACAAACTCTTTTTTTCTTTTTCATCTTATTT TATAGTCCCTTTGTTGACGCCTTATACATTTTTGATCTTATACAATATTT GGATAGTTATGTATTAAAAAAATATTTCATGAAAATTCATAACAATAAAT AATGGTCCTCCTAATTCGCACTAACATGAAAGATTTTAATGGGTTTTTTT TGTTTTGTTTTTTGTAATTTTTGATCTCTCTTCTCTTACCTCAAAGGTAT TATAGTTTCAAACACAGATTTTGAACTATTTATTGTGAAGTCGTGAATAT GTTTCTCCTATTAAATAAAGAATAAGCCAACATATGCTATTGCTAACCAT CATATAATTTGAAATCTTTTAGACTCAACCAACGAAGTTGAACAGAAGTT ATGTTTTCGCCTCTTTTTATTAATTTGCGTGTCTATAGGAATAATGAAAA AGTTCATGATCGATTTTGATTAAAGTCATATAAGACGAGCAAGGAATATA TTTTTATTATATTACATCTAAATTTATAAAATAGGTTGACAAAATTGATA TATTTATTTACATAGCCCTGAAATATATATTATTAATAAATTTATTATGA AGGAAAAAATACCATTTTCAACTTGAAACAAGGACAATTTGAGTTCTAAA CAGGACAAATACGTTTTAAAAATTGTAAAAAGTAGGCCTTGGGGTTAGCT TAAAAATTCCTTATAAAAAATACAATTTATCGTCTGAAATACAGAGGACA GATCAAATCATTTTTACCTGAAAATTCAATTTTGTTATAATGTCAGATTA AAGCCATTTTTCATCTTTCAAAATTCAATATCAATTATAGATTTTTTAAT CAACGCAATGAGATAAATTGTTTAGAGTCAAAGACTTCCTATATCAACAG TTATTATTTATACAAAAGTGCATATTACAATTTATGAAAATATTTTAAAA CGAAATAACTGAAATATTTTTAATAATTTCCTGTCAAAAGTACTTAAATA TTCATAAATACTCATTTCTAAACAAAGTATCAGTACTTGTGTTTAATGAG TACTTAAATATAAGTATAATCATTAAATTATATTACTTCAAGACACTTGA GTACAAGTACCAATGTATTCAAAAGTATAAAATGTAATTCTTAAAAGTAT TTAATTGTATATTGATGCTTTTAGTTTTATGTTGATAAAATATCCATTTT TGATGATGAAGTGGCAAAACACCCCAGATAATTACTTACGTTAGGGTTTA AAAGGCGTGATAGAGATTTTTTTTTAAACATTGAATAACAATTATGTACA TGAAGATTCAAAGTTGAATTTATAAACAATATTATCAATTTTAGCTTAAA ATTAGGCCTCCTAGCCAAGACCTACACCTAAAAACAATATATCATTCCAA CAATTACAAGACAATCACACACTAAACAATTCAAAACATAATAATCAATC CATTGTTCTCCCTCAATGGAAGTATTCATACCTTTTTTAAATAGTCATAC ATCTAGTTTAATCTGATAGTTTGTATGTGAAAATATCAATAGTAAGATCC CAGAAATCAACACCCATCCTAGCTTTTTTTTAATGAAAAATCACGATATT TAGCGTGAGATTGTTGTCAATTTTTCTCAAAGAATTGGTTCTCCATATTC CAATTTATTTCCAATAAGAGCTTTGGCCCTTAAAAGAGCCCGATTTTCAT AGCTTTTTCGTCTTTGCTTTGTCGACAAGACGAACAAAATAGTTGCTTTT AAGGTATTAACGCTTCTCCCCTCTACATTAAGAGAAACAAATTCAAGTAA AAAGAAACCAAAAGACACTCGACAAAAGTATACAAAATATTGTTGAAAAA CTTTTCATAATATTTATAGGGATCGTAGAAGATAATACAGTCTTTCAAAA TCTGGAACTTTGACGTAATTTTTTTGTTTCGTCAACTCCAAACAAAGAAT TCCCTATTTTGTTTGCCCAAAACTCCGACAGTTATAATTTTCTTATGAAC TGTTGATATATCTTGTTGTATACATCAGCACATTAAGGCTAAATTCTCAT CTTTAAGTGCCAAGGCCCTTTATGTAAATGATGTATTGCAAATTTTGTAA AGAAAAACAGGTAGATTGTGGTGGGCTCAGGTCATGAAAAGTAATTAAAT TTCTTCCATTACAAATCCGTAGGATTCTTTATCCTATTGAAAAATATCTT TTCCATACATTTTGTCTCACGATATCCACTGTTGATGTAGAATCTAAGAC AAGATCCCCGTGCCATATAATTCTTTCTATAGCTTGTCAAGTCTGAAATA TAGACTCAAAAAAACTGTTTGATAGATCAGAGCTGAGCATAATCAAAGAA TATAAACTATAATTACAAACAGTCAATCTCCATTCAAGGTCTGGTTTATT AGACATAGCAATTAAAATTTATAAATTTTTATATTGGGTAAAACTCTGTT CAGGAGTATCAATCCCCCACCAAAAGGCTTTCTGAGTCTTTTAAGAGCCG GAATATAGGTCCTGCTAAAGAGGAACAAAAGCCATTTTCTAACCTCTGTG ATTGCCAAATGTGTCAATAATTGTAGAGCTGATGCCTTATATAAAACTAA AGGATTGATAAATGGTTTATACGGGTCAAAACGTTCCTGGAGATTCAAAA CTCAACAAAAATATATTTTTTTATATATTAAAGCCTAAGTGTAGCCCTGT TTTAATATTATACACGAACTCAAGAAAATCTATGGATAGAGGAAGGGACA TCTTTTTTTACTCAAGACCAATGGAAGTGAAAAAGAGAAGTTCAACTGTT GATTTTTATACCTTTTTACTTCTAAAAATCACTTCATCCTAGTATTTTCA TAATTTTTACTCAGATCTCAGAGGTATCATGACTTGAGCTCATATCGGAC TCGGAGCACTGGGAATTGGACTCTAAAAAYGTATGTGCTATACCCGTGCC ATGGCATGGATGATGTATTGTGTGCATGGCAAGAGGTCGATTCGTGGGTA AATAGATCTTTGTATGTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNGATATAATTACCATCTCAGAGCGTTGTAATAATA ATGAAGKGATATTTTTTGTGTGCAGAGTGATAGATATCGTCTCCATGACT TTTATCAAGTTGGATACCACCCGGGCTGTCATATTTGTCTCATTTTATTC AAAACTTCCAACCGGAGTTTCATGAATCATACTCAACTCGGACAAGATAG CGAAAAGGACTTAAGAGGAATCACGGAATCGTAAGACGAACTAAAGTTAT TATATTTGTATGAAGGAGTGTTTTGATAAATGTGCTTTGATCTCCTAAGG ATTTTTGTGTATTCAGTAAAGAAATACACTGTTATCCCTCTACTCTGTGT ATTTTAAAAGAGACTTAAGTAGGCATGTTAATGAATAAATCAAGCCTGAG TCAGAAATGTGAGATCATTAGACTTATGTTTCACGAAATAACCATAATGG AACTGAAAGTATCAATCAAAAAACTACATATACTGAAATATTTATTGATC ATATATTTAAACAATAAAAATTTAATATTTCAAAATTTAAGACACTAATT ATTTATTCAGATAATTTTCTTATTCGCCTTTTGGCAGCTGGATCTTTTCT GCTCCGTATTTCCTTTTCTCATGTACATTCTCATTCAAAGAAGATGCAAA GTTTTTGGCCATGTATTTAAAAGTTTTCTAGGCGATTTCTTCAATAAATT TAAAACGGTTAATGCAAGTGATCCTCTTTTAATAATGCATGAGACATTTT TAAATTGGCTGAAGAATCATGGTTTAGGAAGTAAATCTACATTTAGTTTA GTAACAGATGGTTCTTTTGATATGGGTAGATTTCTCTATCTCCAAACCCG TCACTCTTCCATTACTTTTCCAAAATATGCCTCCTAATGGGTCAACCTCA GAAAATATTGTATTAATTATTACAAACCCAGTTATAACAAATTTCTTAGA CATCAACTCCAGGACTTTAAGCCATCCTCACCAGTTTAGGTATGGAATAT GAAGGTTCTCACAATTCTGGTATCAATGATACTAAAACAAAACTTACCAG AATAGGCATCCGTCTTCTTAAAGATCAAGCCTACATACGTGTAAATGAAA TAAGAGTATTGGTTGAGGAGTCAAGCACTTATGAGAATCGTTCTCCTGTC AAAACTGGTCGACTTCGAACTGTCATGTCCATTAAAAATAATGAGGCTGA ACAATGGCAAAAAAATAAATGAAAATAAATTATATGCAATGTCTAAAACG ACATTTTCCCCAACAATTTTTGAGTATTTAAGTGTTTGCAAGGCTTCTTA GAGATAGATGAACTTAAAAAGTCTCAAGAAATCAATTTTATTATTATTAT TATATTATATTTTTTGTCTGTTTCTTCAAGTATAGATTGATATATAAGTT AATAAAAAAAGACTGACCTTCTTTTCAAAATTTGGAAAGTAAACATTGTA AACCGTCAGATTCTTAAATCTTAATAGAGAAACACCTTATGAATATTTAT TGTGGATTTTTTTCAAACTCGAAGAATTGACGAATGTAAGCATTGAAATT GAAGCCACAGAGTACCAGAGAGTGATGAAAGAAGTTGTGAATCCCTGGTA CCCCAAAGGGAACTACTGTTGGCAACAAGACTCAGCACCTTGGCATAAGG GCATAACAACTAAAGCTTGGTGCAAGGAAAACCTCAGCAAATTATGGGCT ACAAACTTGTGGCCCCCTCATCATGAGACTATGGAAGATAGGGTATGTGG AGAACAAGACCCGCAAAGTCCTCTACAGCAATATTGATTCCCTGAAGGCC TCTGTTGAGAAGAAGTGGGCTGATATATCCAATGTCTGCGTTAGGTGTCC AAACCCTTTAGGACCAGGCTAGAAGTCATGGTTGCTGCAGAAGGAGATAT ATTTATATGATATTATGAGGTATAATTTAATACTTCTGATAAAATTTACA TGTTGTTCTTGATGAAGTTGATTTAAATCTCAAAATGAAAAACGATAGGA CTGTTCTTCAAGAAATAAATTATAATAATATTATAGAAAAAAATTTACTT AATATGTTATTGTAAAATAATATTCCTTTTATATTGAAAATAATTGGAGA GACTTTTAAATTTATGTATTTCTATAATAATTTATGCTCAGGACACAAGA AGGGAGGAAAATCAAAAAGACGAAATAGAGTGAACTGATTTATGTATGTT GAGAATTAAATACAAACAAACTATGTAATTATATATCTGATAGTTTATCA ACAGACAAATCGTAGATGAAGATAATAACGTGTAAGAGGAGGGAATTGAA CACAATACAAATGTGATGGCAACACAAATTAATGATGTTGTACAACAATT CTTTATTTTAAATATAAAACTGACAGATTAAGAGAATACATTATTTTATC ATTAGTCGAAATAATGTTTTTTTTACATGAATCTAGATGAAATATTTACT TCTAACATATAATGAAAACATAGAGGAAAGGTTCATAGGGCATATCGATA CATATATAAACTCATTTTTTGCTATATTTTCATTAAAGAAGGTTCCATGA TTTAAAATATTTCTTGTTTGGGAAGAGAAAATACCACGTTAGTCATTTTC GAACTTTCAAAATTAAATTTATCATTTGATTCTCACTTCTACAACAAGAC ACCTTTTAAATGTCAAAACCTCTTTATGTTGAGAGGAAGATTTGTTAAAG 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ATTTACGTATTTTTATTAATATTGTATGATTTTATTCCCATATAGAATCA TATTTGACTAAACAATAAGATTATAGCAAAATTGCTAATAGTCGTAGGAA AAAGGACCAAAAGGGATGTTAGGAAGATCCAGTAGACAGATTTAACTCAA ATATTACTTGAAAGCAACAACTAAAACATCAATTTAATTTATTTCTGGTT CCGGAACTCCACTGATCTTATGCAAATCTAATATTTTGTTGGTGGCTATT TGAAGTAGCTATTTATCAGACTCTCCCATGAAAAAGAGACATCTTTAATT GCAATTTAGGTTTGACTATGTTACCATTAAAGCAGTCTTAATGATCGATG CTGTAATCACGGTTTGGTTTTTAGGGGGAGTATTTTTTATTGAGATGCCT GGTTGGAGAGACTATGAATGGCATACCATTGATTGACCCCCTTTTGTAAT AATTTGGAATGAGTGTAATAGATAATAATGAAAATAATATCCTCAAATTT TCTCACATTTAAAATATTTCACAAATGATTTTAAATATAATTATTTCAAA ATATCTTAAATATAAAAGGTGATTCAAAACGAGCGGTTTTGGGATTGTAG AAATAAAACACATAAAATATTATATTATGGTCAAAACTTTATCATGAACC AAAAAACAATCCTTTACCATTATTTCTAGAAAATAATCCCCTTCATGTGT TGGCCGCAACTGGCCTTTAAATGGTCCATTCTTTCGCGCCAATTTTCGAT GACGCGTTCGAGCATTGTGAAAGGAATCTCACAAATAACTCGCTCAATAT TTGCTTCCAATGCTTCAATCGTGACTGGTTTATCCACATAGACTTTTGCT TTTATGTAGCCCCAAAGAAAAAAGTCCAAAGGTGTGATTCCCCGTGCCAA AACGTGAAATCAATTGCTCACCAAAATGATGTCCCAATAAGTCCTTTACT 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