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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s393 | supercontig | LSalAtl2s393:483852..511695 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006932 >EMLSAP00000006932 ID=EMLSAP00000006932|Name=EMLSAP00000006932|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=380bp
MNYSSIITITEQNVNITIECPDYGSYDIYLLNQFSFWLEGIVKCVFAVAG LIGNFVSARILKKEDMRNSFNLMLIALVCMDSTYLLSSIIESFRISFNMA TELHIHLFPYLLYPVLSVAMTASVFMTVGIALERYIAVHYPIDYSQAINS QEACKKRLLRYVIPVTLLSLIFNIPKIFEAEVYDEINIAQYNETHEQVEY YKAIRTTELRKNPDYVIYYNNWVRLMVIGIVPFFLLIYFNYKIYQDVKDR NITRQRRTSTHTSSANQQTRRKQEDNLAIVFMGIVLVFLVCHFPRLFLSM YECIVIREAFICQKKGLHSFPVWLLLTSGFSHVLLVINSSNGSNTSGGDN NQTQIYNMSPSLHGKITKHDDNKVSIESKV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s393:483852..511695+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006932-702779 ID=EMLSAT00000006932-702779|Name=EMLSAT00000006932|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27844bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s393:483852..511695+ (Lepeophtheirus salmonis) ACTTTTTACCATATCTTAGCATTAGAGGGAGGAAACATAGGCGGAGATAT
ATCACAGGTACTGTTTGTAAAATTATTCTATTATGATTTGATTTTTTTTA
ATATATTTTTTTAATTGAATGGATGTCTGATAGTCTAACAAAATGTGAAT
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TCTGGAACTTTGACGTAATTTTTTTGTTTCGTCAACTCCAAACAAAGAAT
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TTCCATACATTTTGTCTCACGATATCCACTGTTGATGTAGAATCTAAGAC
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TAGACTCAAAAAAACTGTTTGATAGATCAGAGCTGAGCATAATCAAAGAA
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CAGGAGTATCAATCCCCCACCAAAAGGCTTTCTGAGTCTTTTAAGAGCCG
GAATATAGGTCCTGCTAAAGAGGAACAAAAGCCATTTTCTAACCTCTGTG
ATTGCCAAATGTGTCAATAATTGTAGAGCTGATGCCTTATATAAAACTAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNGATATAATTACCATCTCAGAGCGTTGTAATAATA
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AAAACTTCCAACCGGAGTTTCATGAATCATACTCAACTCGGACAAGATAG
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ATTTATTCAGATAATTTTCTTATTCGCCTTTTGGCAGCTGGATCTTTTCT
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GAAAATATTGTATTAATTATTACAAACCCAGTTATAACAAATTTCTTAGA
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GAAGGTTCTCACAATTCTGGTATCAATGATACTAAAACAAAACTTACCAG
AATAGGCATCCGTCTTCTTAAAGATCAAGCCTACATACGTGTAAATGAAA
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AAAACTGGTCGACTTCGAACTGTCATGTCCATTAAAAATAATGAGGCTGA
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ACATTTTCCCCAACAATTTTTGAGTATTTAAGTGTTTGCAAGGCTTCTTA
GAGATAGATGAACTTAAAAAGTCTCAAGAAATCAATTTTATTATTATTAT
TATATTATATTTTTTGTCTGTTTCTTCAAGTATAGATTGATATATAAGTT
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AACCGTCAGATTCTTAAATCTTAATAGAGAAACACCTTATGAATATTTAT
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GAAGCCACAGAGTACCAGAGAGTGATGAAAGAAGTTGTGAATCCCTGGTA
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GCATAACAACTAAAGCTTGGTGCAAGGAAAACCTCAGCAAATTATGGGCT
ACAAACTTGTGGCCCCCTCATCATGAGACTATGGAAGATAGGGTATGTGG
AGAACAAGACCCGCAAAGTCCTCTACAGCAATATTGATTCCCTGAAGGCC
TCTGTTGAGAAGAAGTGGGCTGATATATCCAATGTCTGCGTTAGGTGTCC
AAACCCTTTAGGACCAGGCTAGAAGTCATGGTTGCTGCAGAAGGAGATAT
ATTTATATGATATTATGAGGTATAATTTAATACTTCTGATAAAATTTACA
TGTTGTTCTTGATGAAGTTGATTTAAATCTCAAAATGAAAAACGATAGGA
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AATATGTTATTGTAAAATAATATTCCTTTTATATTGAAAATAATTGGAGA
GACTTTTAAATTTATGTATTTCTATAATAATTTATGCTCAGGACACAAGA
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GAGAATTAAATACAAACAAACTATGTAATTATATATCTGATAGTTTATCA
ACAGACAAATCGTAGATGAAGATAATAACGTGTAAGAGGAGGGAATTGAA
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CTTTATTTTAAATATAAAACTGACAGATTAAGAGAATACATTATTTTATC
ATTAGTCGAAATAATGTTTTTTTTACATGAATCTAGATGAAATATTTACT
TCTAACATATAATGAAAACATAGAGGAAAGGTTCATAGGGCATATCGATA
CATATATAAACTCATTTTTTGCTATATTTTCATTAAAGAAGGTTCCATGA
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GAACTTTCAAAATTAAATTTATCATTTGATTCTCACTTCTACAACAAGAC
ACCTTTTAAATGTCAAAACCTCTTTATGTTGAGAGGAAGATTTGTTAAAG
TTTGAATATTATAATATGCAAAGTTCTTAGAAATAAATTATATATTGGTC
AATGCTACTTGATTAATTAAATGGTATTATTAATTAAAAGTAGTAATGGA
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AAAATACTTTAACACGTAGTTTATTAAGAAAAAGTGTATGTATTTAGTTT
TTTTTGATGTACTTCTGAGTTGTGACTTGAAACTTTCGACATTTGATCGG
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TAAAAATTTTCGAGTGAGCTTATGTAATCTTTAAAAAAATGGTTGTTCTG
GTAAAGTCGAGTTTTTTTAAAGTTGCTGTAAACTACCAAATTCAAATCTA
ATTAAAGGTTTGTTTGTTTTTCTCAATAATTTTATCAATAATTAATTTAC
ATTTTAATTTTCAATTGTTTATGCCACAAAAGTGCATTTGAAGCAAGAAA
GAGAAAATACAGTTTCCATTTACAAAAGAGTATTTGGTTCTAAGAAGTCT
CGTTCCTAGTCTTTCGGTAATTTGAAATGTTCCCAATAGATATTCAATTA
ATAACCTTATTTTATAAAAGAACGATAGTATTTGTCAAATTTTGCGTGTA
CTCTTGTGAGTAATTGAATAAATAAAAAAAGTTCTGGAATTTTTCCCCGT
CTCCCCCTACAAAAACATGAATTGAATTTCAAATACATTGTAATTTTTAT
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ATTAATTTTCCTTATGAAAAAAAACACTTATGTGCTATTTTTGGTTGTAT
ATTTACGTATTTTTATTAATATTGTATGATTTTATTCCCATATAGAATCA
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ATATTACTTGAAAGCAACAACTAAAACATCAATTTAATTTATTTCTGGTT
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GCAATTTAGGTTTGACTATGTTACCATTAAAGCAGTCTTAATGATCGATG
CTGTAATCACGGTTTGGTTTTTAGGGGGAGTATTTTTTATTGAGATGCCT
GGTTGGAGAGACTATGAATGGCATACCATTGATTGACCCCCTTTTGTAAT
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TCTCACATTTAAAATATTTCACAAATGATTTTAAATATAATTATTTCAAA
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AAATAAAACACATAAAATATTATATTATGGTCAAAACTTTATCATGAACC
AAAAAACAATCCTTTACCATTATTTCTAGAAAATAATCCCCTTCATGTGT
TGGCCGCAACTGGCCTTTAAATGGTCCATTCTTTCGCGCCAATTTTCGAT
GACGCGTTCGAGCATTGTGAAAGGAATCTCACAAATAACTCGCTCAATAT
TTGCTTCCAATGCTTCAATCGTGACTGGTTTATCCACATAGACTTTTGCT
TTTATGTAGCCCCAAAGAAAAAAGTCCAAAGGTGTGATTCCCCGTGCCAA
AACGTGAAATCAATTGCTCACCAAAATGATGTCCCAATAAGTCCTTTACT
ACGCGGGCTGTGTCACCGTTTTGTTGGAACCAAATATCGTGGAAACCATG
TGCTTCAATTTGAGGTACAAAAAAGTATGTTACCATGGCGCGATAACGTT
TGCCGTTGACGGTAACGTGTTGGCTACMCTCTCTGCTMCGGCCACAATAA
TTTCTACACTGCGAGCTGTACGTGCCCTACCAGACGACTGGACATCCCAT
CAAGTTGCTGCCCCTTCAAATTTTTCGATTATTCTGCGAATTGTGGATTC
TGAAGGTCGATTATGTGGACGTAATTTGCAAAAAACTACTTTCACAGAAC
GCTGATTTTCACAGTACAATTGAACAATTTGTACATTTTGTTATGGCGTA
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AATTTAACAGAACTCGCATGCACCTGTTAAATAATCCCTACTGGAAAAAA
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TTTGAACTAATAAATAATTATCTTTACCATTGTTAAAATATTATCGTGCC
TGTTATATAATATTTGATGGAGAATAATGAATCATACATATATATAGGCA
GCATAAAGCATTGAAACAATATTAGCAAAACGCACCTGATAGCTGGAGGA
GATATTTGGTCGTAGCTATAAATATATTTTTAACACACAAGATCTCGCTT
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GGCTGGAAGGGATTGTTAAATGTGTTTTTGCCGTTGCTGGACTCATTGGA
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TATGTTACGGGCAATGTGAAAAATCGGACATTTTGCAAAATGTCTGGCAA
TGTGGAGAACGCCCGGGTAGTGTGAAAAATGTCCGGGCAATCTAATAGTG
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ATGTCCAACCTGTGGATCGCAGGTAACATTGCATCCCGCCGAATGTTTAG
GTGTGGCCCACCACTTAAAGTAGTATTTTATTAGCAAAATAGTTGCAATA
TCATCAAAAGCCGTAGAATGCAATGTACAAAAATAAAAATAAAATTTGGA
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TATTTTCTTTGCGCTAATGCAATTCTCCTCTTTATAGCAGTAATTCATTT
TATCTCACAAAATCATATAACCAGCAGCTGATATTAACAAGGGGCTTAAT
TCCGTTGTACCCTTTCCTCTTCTTCTAGTAAAATTTCACTGTCAGCACTG
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CTCTTAAAAAAATTAATTAATTAACTTTTTGTATTAGCTCATGTATCTAT
TTGAGTATAATTTACTAAAATTATAAATCCTAAGAATTTCTATCAGGCGA
GTTTGGTAATTGACAATCTGAATATTGTTTTTTTTCTTTTCTGTTTTTCC
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ATTACAAAAACTATAACACAGTTAGATCCCAAGGGTAAGTMCCTCTCCGC
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TTATATAATTTTCTTGAAATCAAATTGAAAATTTGATATTTTAATTAAAT
TAAATCCAATTAGAGTAGTCTTCCTTAAAAAATACAATTACTCAGAGAAA
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TTACATGAAAAATATATGCTATAAATCATAAATAAATAAAAGATAATCAG
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TCTACATTAACATAAATAACATTGGATTCAAATGCTGTACATCATTCTGA
TTGTTTTNNNNNTTAAAAAACATAAAATTGGATTTTATAATTTTAAAAAA
TTCTGCTATTGTGATCAAAAATTATAAATTTATTAGATTTCTAAAGAAAA
GCTCAATTTTTCCTGAATTTTTTCATTGTACTTACCTTGAAATGAATAAA
ATGTCTTATATAATCCAAAATGGCTTCAATTGTCATCCACAGAGTATAAA
ATGTCAACTACTGTCAAAAAGCTCAGGCAACAAGTTTCAAGCAACTAATA
AAATATTAACTTTTTTTAAATGTCTTTTTCCTTAGATGACATTGCATGCA
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TTATTTCAAATCTATTATAAAGAATATTTAAAGGTTTATACTTGTTACTA
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TAAATGTCTTCCTTTTTTTACTGGATATACATATTTATGCTAATGAATAA
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TGGGTATATTTATTGAAATTTATTTCGGGGTATATATATCACAAATCTAT
TTTTATATATACTACTTAATTTTTATACTTCATCATATGTTATTGTGACA
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CCTTTTTGAAATTTAAGATAAATTTATCGCTGTAAAAATCAAAATGACGA
TGATATTTTTATATGAAAAACCCTTACTCAATTTTCTCATACTTATGATC
CTTTTTTTCTTTTTTCTTTTGGTCTCTCCAAATTGTATAAAATTATCAAT
TTTAAATAAGAACATACTATCTAAATATTTAAGCTATACTTTTTCTTTTT
TTATATTAACGGCTTYAAAAAAATTTATTYGAGAAGACATCACAGAAATA
ACAAACAAAAATTCAGACAAGTCCTAAAATGTTTTACTATATAATCTAAC
TCCATTGCAAAAAATATGGAGGGKAAAATTCCTCAATAGCTTTTGTAAAT
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TTGAAAGGAAAATAACATGAATGATGAACTACTCAAAGTTTTGTATTACA
TCACAGTGGAAAAAACATTTATTGAATATTGAGTAGTGTGTACAATTATC
GACTCAACTTGATTCCATGATTTTATGACACAGTTCTAAAGTTTAACTGA
CTATATTATGTTTTCGACACCTTGCAAAGGTATTTCGCAAAAAAAAATCA
ACAAGCGTTTGAGTAGTCCTATGCGATCAATATATTGAATCAACTTGTCA
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GAATAATTTTTTTTTGCTTTAGAATAGTAGTCAAAGAGCTTCATCATATG
TGAAAGCTTTTAATTTTGAAGATTCTTAATTCTAAGGCACTAATGGCCAG
TGAAATCACAGATTATTATCCCATCAACCCATTTCTCCCAAAACACTGCT
CAATATTTCTAGCTGCTGTTGCTAGATATGCTACTCTGTAGTTCAAGACC
CTCTCTCTAGGGAAAGGTATTTGTATGGAAGCGATAAACAAAATGATATA
TTCACCATCCAAATCAATATATCCAAAGAAAACTGCGATAATAACTTTTT
AAATATTTCAGCAATTTAGTTTGTAAATGTGACTGTTTAACTCCTTTGCT
GTTCTGTCTGATGTTTAATCATTAAAATAAACAGAAAATGTTATATCTTG
TTGATGTCATGTAGTATCAAATTTTAATTGAGAACAAAGGAAAAAAATAA
AAAGTATACTGTTATTTTTGCTAACCATACAACATAATCAAAATCAATCT
AAAAATTGAATATCATTCTCTATTTACCTATCTCACCTACAAATGTGTTT
CAAGCTGAAGTAGGCACTTATAATGTTTACAGTATACTAGAAGAAGAAAA
AACATTGTGATGTTTATATTAAAATAATTAATGAGATTAAATAAATAACC
AAAGGGTGTACGGAAAAGTTTTTAAACATAAATAAAACCTAATAATGTAT
TTCTAGAAAACAAATAACAAATTCTTAACCCTTCCAACCCATAGAGTATT
TACAGGTATTTCTGTTGAATTGTGATTTTTTAAGAGGTATCTTGATTCAT
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AAAAATTATGAGACATGGATGTTAAAATTAATGTAAATAAAATATACCCA
TCCCTCCAATACACTTCCGTTGGAGAGGCATTAGATAAATTTAAAATTTA
ATAACCTGTAAAAATAAAAGAAACCAAAAATTAATATAGTCAACCCTGAC
ATTTTGAAAATGTTTAGAAGAAAAAAGATTAGCTGCTATTATATTTTATT
AGATTAGCTGGAATCAGGCGTCAGACGAAGGAAAGCAACAAAAATCCAAC
TCTGTATCTTGCAAAGATATCGGGCGGAATTCCTCCGATATCGATCCTAA
TTCTACCCTTGGTTAGTCCAACAATGACTTACTTTTACAACTAAATAAAA
AAATCCTCAATTATCCATGGAACTTAATACGTATAATTTCCCTCCTCAAA
AATTAAATAATAATTATAACAGCTTTGGATAATTAAAAAAAACCACTTCA
GGTTGCGACTACAACAAGTCTTGTACTCGTAACTTTACGTTACTACATAT
TTCGGATCATGAATACTTTGAGTACCTTCCAACTTTGTATCTTTTTTTAT
TTTCCTCCTAATTTTTTTTTTTCTTTTAAGTATATAATGCTTAAAAAATG
ACCATCATTAATACAATGACTTGGGATTAAATATTGTTATAAATTTGTAA
AAAAAATAATAGGTATCATTCTAGCCAGATTTCTTAACTTTTATAGAGAA
AAAAATGACAAAACCTAAAAGAAATTAAAAATTAGTTAAGAAATTTTGTT
TAAATCATCTTCTTTATGTTTATTCTTTTCAAAAGAACCTAGAAAATTAT
AGGAGGTTAAAAACAATCGAATTTGTTAAAATTTAAATTGAATGAATTTA
TTTTTTATTTCAAAAATAAGTGTACGTTTAATAATCTCACTCAATCAACA
AACAAATATTTTTTCGTTGATTGTTGTCTCTTGGTGCTCTTTTTATGACT
GATCGGTTAAGGTCCTGGATAATTTTGATCTTCCTCAATAGCTTTCTCGA
GTCTTTTTTTTTTCTTTTCGTAAATTTGAAACCTCCATTATGAGTATGAC
AACTCTTATGTCTTTTACTATAAACTCAATTTCCTCATATAGCAGGGACT
TAATAGTATTTATTTACATCAAAGCATTTTTTTTTACCGGATATTATAAC
GCTGGTCGATCCAGGAGTGCAGAATATAAACAAAAAGACAAGTCCTTTTC
TATTCAAAGGCTAATAGAAATCAACACACCTTTCAAGAGGAGTAATAACC
TTAATACATGAAAATTTAAATCCTAATGAAAAAGCCACAGATACTGATAC
CAATCACGTTATCGTCGATTTGGATTTCCTTGAAAACCAAACAACATTTT
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