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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s42 | supercontig | LSalAtl2s42:550356..655654 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007482 >EMLSAP00000007482 ID=EMLSAP00000007482|Name=EMLSAP00000007482|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1985bp
MSLVVKLIGFNGSGTGGDRIAKATFRGVSHISKTFEDRDDWIDIDEQLDW PIASPLQRDENISIHIMAFNRFLNNRLLGNTTFSLHRLLDQPTVQLAASL LDMNGIPLKASIKLEMSYYSPFSYEDDSVDELEAEDDDNIRSYISDDLSD NKALVSIERNIANIERNFNRRQDEVRLSRSSSLDHGSFXEQKRKKPFSII KKRSNPLKTVRNVIRTMGVVKGSHGDEESLMNRDSDSVGVPSDIEASFSE EAPLLEKPSFSNEIIQKTNKNESVKQRSQSKRNKQSSNAVSTSLRAQDFQ LCITVIEARQLAGLNMDPVVCVQVGDQKKYTSVKESTNCPYYNEYFVFDF HMAPVMLYDKIITLSVLQRHFLRTGKILGSFKLDVATVMSQEDHQFYHKW ALLTDPDDITGGPKGYLKCDINVITKGDAVKIPPKSERDEDDIEANLLLP DGVPAERQRAKYIVRIYRADGLPRMNSSIMANLKHAFGGPPKDLVDPYVQ VSFAGLCGRTSVKKNSYSPVWNEQIVFTEMFPPLCQRIKIQLRESDTVGD TVIGTHFLDLSTISHDGDKGFLPTFGPAFVHLYGSTRDYSIIDEHSTLND GLGEGVSYRGKILIALKADISDTIDTAPSEVEVEPTQTINESSYGKLDEF FLFGCIMEATMIDKKLADKPIQFEISMGNAGNSIDGHIKSSKSRSDIDSD SISLHEETAGSMESLNVSWQSTTPSLKPQTHDRLYYYLPYWDDKPTTYIR SVFPDHRKRMYNSNAISKIADKLEENLREVHNMIEMEDPCTEEKLKKILE QLQQVMKLKSCSTQESIGTLARQYKIVKKSTIKEKYKMTYGLLDRLRQLI DDLPGRKGTGSGGWMIQAKLQIYLWLGSTKHKKAFPSGIPSGFQITNELL NAEKLGLSPPLSIHYTEKYCFQLRAHMYQARSLIGSDASGLSDPFARVII GEYCRTTQVIDETLSPTWDELLIFDQIVVYGRREDIKLNPPTIIIEIYDQ DKVGKAEFLGRSVGKPWVCLIGSSDYQTPSLEWFQIYRGNEEAGELLAAF EMFELAEVAGHDPYSNLSEPKDNGPYIDSGPVLPVPKGIRPTLAKYRFEV LFWGLRDVKRVHWLTVDKPRVDIECAGNIIQSSVITNAKKNPNFSTTVKF LDIELPEQEIYCPPLTIRVVDCRSFGRYTLVGTHVINSIHKFLYHPVTRK SRDDADKRKKESLLRSQYQDLSSSLLPSNPNSVSSLELTPLVPKAKDSLI TLDYGTYAIPNGCGLDISSSTDNNKNKGSHGFNNQSGHQTDDLIDDDEES LDWWSKYFASVDAMIEEGRVKRGGDQEKGEEPHQNSTKDSNLYGLLEEEP KKRKYGGIMNVTNVAKSAANKFSPNRASQIQQQRKKSKSSIALFKLFPNE LESQVGLDGFTEWLXTFXLYRGKKSEEEFEDETRIVGKFKGSIKIYKLPL LKDLDDHTVMGFDPQFGFFQGLPSNDPLHVLVRVYVVKANDLHPMDINGK ADPYLVLQLGSKRTSDKENYISKQLNPIFGKCFEFEATFPQDSVLTVQVY DWDLLGSDDLIGETKIDLENRFFSRHRATCGLTSRYDTCGXXQWRDPMKP VQLLTKLCKEGKVDGPHFSNMKVRVGQKTFTLQSKEGGPLQNWQTKVSEE HLALAVLHHWNEIPRVGTYLVPEHIETRALFNPDKPGIEQGKLEIWVDMF PMDMPLPGLPVDISPRKPSSYELRVIIWNTDEVVLEDDAFFSGDKMSDIY VKGWLKGPDDAQQTDVHYRSLTGEGNFNWRFLFPFEYLAAEEKVVISKKE SMFSWDETTSKVPARLTLQVWDADHFSKDDFLGAITMDLNRFPRGAKTAK KCTSDMLKTDGTVPTINLFKQKRTKGWWPLYIKTENEGLLLQGKVEAELS LHTAEEAEKMPAGLGRDDPNGLEKPTRPDSSFMWFVNPIKSIRYIIWHNY KWTIVKLICWIGLLLFLILFFYALPGYSIKKMLGA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s42:550356..655654- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007482-703329 ID=EMLSAT00000007482-703329|Name=EMLSAT00000007482|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=105299bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s42:550356..655654- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTCTCTAGTTGTGAAGCTCATTGGATTTAATGGCTCTGGTACAGGAGG
AGATCGCATTGCAAAGGCAACCTTCCGAGGTAATAATGGTTCTTTTTTTT
AATTGGGTATTTATTAGATCATTATATATTGAATCTATTTTTACGTGAAA
TTTTAAATAAAGTTTTATCCAATCTAAGATTTATCTATAAAGGTCATAGA
GTAAAAATATTTAAATGATAATTTATTTTAAGAATAAATGTATTTGACTT
CACTCAAAAATTTAATTATTTATCTTTTTGATATAAAAAATTTGTTAAAG
ATAGCCTTTAATTTGGGAACTATATTATGGATGGAAAATGCTAAAAATTA
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GGCCAAATTGGGAACCCTGTACAACCTGTGTCTCTTTTTTTTTATAAGAT
ACAAAAACCTGTTTGTTTTTTTCTGACAAAATTTGTCTTCAAATTGATAT
GAGTCTTGATTACGCTTACAAAATTTCATTAGAAACTTATTTTCTTTAAC
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TTTCTTGTGTATATCATTTTTTGAACAAAATACGGGCAATCTTCCACGGG
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TTGGCCAAATTCATATTTTACTTTCCGTATACGACTTTTTGGAGGGTGAA
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TCAATGTGTGTTCTTTATGCGTTCTTATTATTTTTGAGTCCAACGATGAA
TATTAGAAAGGTAGAAAGTAGAGAATTAAAATTGTTTTACTTTGTATCGA
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TCTAAAGTCTAAAAAATTTAATATTAATTTATCTACTGGCTTAGAATATG
AAATACTAGTGGAAGTGCCCTGCATTGCCCGGAGTAATTAGGCGTCGACT
AAAAGACACTTTTTTAGTAATATTAAAGAAAGTAACTCCACAAAAAATCC
TCAGTATTACTCTCCGTTTTTCGTGAGCACACTCACACGTTACTACTCAA
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GTCTTAAGAGCGCTCACTTATAAAAAAACAAACAAAAATTAAAGCATTTT
AACATACCAGTGTTTATATTCAATTACAATCTTAACTTATATTGAAAATG
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GAATAACTTTAACATCTAATTATGAGACTTGTATAAGAGATAGAAAGATA
ATTTAAAAAAAAATTTGAAAGCCACATTAAATTTAAAATGATTATTTATA
ATAAAAGCCTTCGTTCTACATCACAATCTGTACACTAGTCAATCCTGAGG
GCATTTTTGAGGATCCCTTTGATTTCAATCCTTGGCCAGCCTAGCAATCG
GTGTATCTGGATGAGTGGCAATTGATAGTTTCAAGCCAGTTATGAACCTT
TCAGTTTAAATTTTATTGGATCTTTTTGAATGAGCTGCTCTCTCAGTCTT
TCCCTCCTCATCTAAGGCTTTAATCACGTCATAAACTGTTGATTTTGGAT
ATTTGAAGAAGGAAATTATCTCCTGTACATTGTGTCTGCGCGTTGAGATT
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TTTTATAGATATTTCATCACAAAACCTCTCCAACACTCTTAATTAGCCGT
TAAAGTTATTCCGGATTTACATTGTACACCCTGTCGATAATGATAAAAAA
GTGTTCATTTTCTTCACTGATTCGTATAGGTATTATCATATTAAACATCT
ACAAAGTGCAAAAAATTCTTAACCCTTTACACCCTGAATAAAGTTTCATA
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AAAAAGTAATAATAAAAATTTTTAAACATTTTTTTAACAAAAAAAAAAAA
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ATTTTTATTCAAAAGATGTCTCCGATCAGAATTAACGTTATTATTCATAT
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AATGTTAGTACAAGTATGCTATGACATCTTTAAATTACGTATATTTGAAA
ATAGTCTGTATAAGAATATATATTGGACATACATATGATCGTAACACTGG
ATTTTTTGGATAATATTTATACAAATGTGATGTCTCTATCCCATCATTCT
TATTACATATTCTCTTATATCATTATCATTGTTCTTATTTCGCATTTGTA
ATTTTGTTTTTTGTACTATATTTTGGATAAATTTATCCTTAAATATGGTT
GTAGTCTATTCAAAGCCTTACAGTAAACTTATTTGCATATTGTATAATAG
TTTTTTTCTAAATGTAAAGTTGATATAAGGAATAGAATATATTCTTAATA
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ATATTTGAAAGCTATTTAAAAGGAAATGTAGCTAAAAATTTTGAGGAAAT
CGAAATTTTATGCCTCACTTTTGAGTTGCAATTAGTCAAAAATAACTTAG
AGCTTACAAAATTTTTATAATTACATGACTAAATGATTTTAAAGTTGTTA
CAAAAAATATTCAGAAACGTAAATTTTATTATTTGTATTAGTATTTCCGT
TGTTGAAATTAGTTAATTTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATAACACTATGCAA
CAAAAATAACTTCTTGGAAATTCCGTCAGCTATAATTAATAATTATTATT
GTTATTCTGGAATGTGTTTATCTATTGTCATTATCTTTTACTTTCATCAA
ACTCACTTCGAGTTATCACTTTGAATCAAACTTAATGTATACTATAAGAA
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TAGCCTAAAAATAAATTATACATCCCCAATTAATTGTAAAATGGTAAAAA
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TATGATACAAAATAACATCAATGAAAATGAATGGATTTAAATTTGATACA
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ATAAAAAAGGAAGTCTTTTTATCAGTGCGAACTATATTCGTTACAAATAA
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CTGATAACATAAAAATAAACTTTGAGAGATTATGTGAAGTTCCACAAAAG
TTATTGTTTCAAATTATATTTGACTTCTTTATATTTTATCTAAAAAATTA
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AGAAGTGTGCAGTCCAATAAATAAGAATTAAGAAAACGTAAAAAAAAAAA
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TATAATTATATATTTTTCAGGGAATACTTTTTTTCTTCTCAGATATGGAA
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AGTTGTATTGCAACTGTAGCAAGATTAATGAACATGTTGATATATATGTA
TTTCTATTTTGAATTATTCAATTCACACATATTGTATTTTGCATATATGT
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AATTTGATTAACTCCACCTATGTATAAATGTAAGTATGTGTAAACAAAAA
TACCGATAGTTTCAATTTCAATATATACAGATCTAAATTTATTTATACAT
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AGTACAAATATTAATCGAACAAAGTTTCATACGTGGGTATTTATGCTAAC
ATCAACTATAGCTTCATTCAATAGAAGAAAATAATGTTGTATTAAGAGAA
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CATTTTATTTAACATTACATAATGTTCAATACAAATATCAAGTACGTCTT
TATTTTATTGACTTCCTCGAAGGGAAAGAAACAAACTCCGGCTCCAGAGT
GTTTTTATTGTTTTTCTTATTTTCAGTTGTATAAAAGAATATAAAGTGTA
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AAGTTCCAGATGAAATCAGGGCTATGACAGTACTCCCAAAAACCCTCACA
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CAAGTACATGCTGGACGGAGTGGATGAGGACTTCATCTACGTCTTGCTTG
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CTCACCTGAGGAAACTACCTATGTCAGATGAATTCTGAAAGCAGGGAAAA
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GGAGGKGTTGGCTGATGTTGACATGGAAATTATTCTCACAGATTGGCAGG
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TCGTTACATTGTACATTGCCTCACTCATTTTTACATTTTTGGATGTTGGA
GACTCTCCACTTGACACTGGTATTAGGATCGGGGCAGAGTCTGAAGAAGA
ACAAGTCGACCTCAGAAAGTATGTTGACGTCATGAGCTGATGAGGGCTAC
CCGCATCAACAGACATGTTTCTCACCTCTATCTAAGCTCAATCTCTGTTC
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GGATAATAAGGTTCATCAAAGCTGCATTGGTATAAATGAAACTAAAATGG
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TAAATATATGATAAAATGGCAATCATAACGTGAGTTTCAAGAGTTTGTTA
GGATCCATATAGACTAAACCGCTTACTTTGCAAACTTTGAAAAATCTAGG
GAAAAATTCAAAGTTATAAACGGTTTGGATGCACTTCCGACAAATTGAGG
ATTTGGAAGCCTCGTGACAATATCAGAAACATCCACAATGCCATGGTCAA
TATTACCCCAATTAGTGTTTCTCATACAGAGCCATTTTATGTATTTTATT
ATGTTATTAAAACATTTGTAATTATAAAAAACTAACGATTCTACAACATA
ATTTTCCACAGTGTATTCGATATTTACAACTTAATCTTTGTTTGCACAAC
AAATTTCACTCACAAATAGAGATTAATTAAAACATAAATAAAAAATCGTT
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TATATCAATAAGCAATAAAACTACAGTCCAACGAAAAAAATTATTGAAAT
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TATTAGCTTATGTCACGTGTTGTTTTTTTTTACTTTTGTCATGTAATAAA
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TTTTTGATTTTTTTAACCATGCAACTTATTATAACTTCAACTCTTTTTTT
TATACTGTAAAGTGTAAAATTCATGGAATTAGAAGTAATAGTGTGATTTA
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TTATTAATACAAAATATTATATTTTGTCAAATCCGTTTCCTCGTAAATAT
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TGGGCCCCTTTTTTTAAATATATATATCTTGTTTATTATTGGTCATATCG
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TGGGGCAGTATTGCACTCGACCAATTCAGCCGTGAACTGTTGTGCGTGGA
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TGGGGTCGATACTCTATCAGTTTGTGTTGTACAACAGTGTTTCGAGAGAA
AAAAAATCCGCTCAATTCTGTCCTTTACTGTGAACAACTCGACCGTTTGA
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GACATCATCAAGACAAGGCCAGGCAGCACATGTCTTTGATGGGGCCCGAG
AATCTCTGGGAGCTAGGACAGGAAGTTCTTATGCATCCACCCTACAGTCT
GGAACTGGCACCAAGTGACTACTACCTGTCAGTTGTCTACATCCAACGCG
CTTGCAGGTACAAATTCGGCCTCAATACAGAAATGTGAATATTGTTTATC
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AGTTGGATTCTCTTTGACAACAAATTATCAAAGAGAACGGGGCATATTTG
GCATAACAATTCTTTTAAAGCATTGGAATATGTGAAAAATACGAAATTAC
TTTTTCTCCGACCTAATATATCTTATATTTATAAAGCAAAGGTTGTTAGT
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GGATAAAAAAGTTGAACTGAGATAGAAAAGGTAGTAGATATTTATAAGTT
TNNCTGTCTGTCTGTTGTTGATGCGTAATAACTCTGAAAAATACCAATAA
TCCAGCAAATATATGATAAGTTACATGTATACTTATCAATGATGTGAAAT
TGATAATGCGATTGAAATGCATTTATTGGAATTTTTTTACATTGATTTAC
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AATTTGTCATTAGTATAATAGTATTATATTTGTATGCATACATAGAGAAT
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ATGATTGGATTGATATTGATGAGGTAAATAATATTTCAACTTAAATGTAC
TTTCATTGTAATTATAGGTTTTTTTTATAAAAGGAACGAAGCTTTATCAA
TCACTTGTAATACAGTACCATTCATGTACAAACAATTTCGTTTACTTTAT
TACATTAATTCCTCCACATTAAGCAATTTATTTTTGTCCATGACTTGAAA
CTAACTGCCTAAAATGTTGCTTTGAAATTATTTTAGTCTTAAAAGACATG
TGAGCTGATAGGATGTTGAACTTTTTATTTATTTCATAATAAATTAGTTT
TTATTTATTACGTTTAGAGATATCCTTACAAGAACAAAGTAAGAAGTCAT
TCCTTAGCTATAAATTGTACCTTTTGTTGCATTTTTTCATTGCAAAGTAT
ATGATTTATGCATTTGTATAATTGTATGTTAAATGTAAATGAAAAAAAAA
AAGTAAATATACAACACAAGCTGCTAACTTGCATAATTTTTGTAAGTTAG
GGTATATTCTCTATTGCAATCACAAACGTATTTCAAGGTTGGGAGGTTGG
GATCTTCATGAAGATGCTCGGAATTGGAATAGGGTTTGGGAAAAATTGAA
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TCAGTAACATTTAATTAATTTTGTCTCCATTGGAGACCTCGTCAGAAATA
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AACCTCACATAAATTAATGTTGGGAGAAAAGCTGCTTCGATTTTAAGACT
ATTGCACCTGTTTTAAGTTATATTTTTCCCATCTCTAGTCTATATATGAT
AAGTAATTATTATCTCTTCTAGGACCCATATTAAATATGATTAATTACTT
GCAACAAATTTTAAATCTAGTATCTACAAAACACCTAAATTAGAAGATAC
ATTTTAAATAAGTTAGTCAATCTGTGAATTTGATAAAGTAAGTCCATGAA
GTTACTTTTAATCAACTAAACGAAATAGATTGAATTTTTTGAGCTAAAAT
GCTACTTTATTCTAGATGTTTGACAAAGCTTTATTAGTAATTACAAAACC
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TGAGTTTAAACCGATTTATGTTGTTTTAAGCAATTGGATTGGCCAATTGC
AAGTCCACTTCAAAGAGACGAAAACATATCAATACACATCATGGCTTTTA
ATCGATTTCTTAACAATCGATTACTTGGGAACACAACTTTTAGTTTACAC
CGTCTTTTGGATCAACCTACAGTTCAACTTGCAGCCTCTCTTTTAGACAT
GAATGGAATACCTTTAAAAGTAAGTTGAAACATATCTTTCTTTCTTTCTT
TTTTTCAAATAACATTTTATTATTTAATTTAACCCTTCATTACAATCCTG
GAATCTTTGGAAACCTTAGTTTATAAAAAAGAAGTGTATATTCTCGTTAA
TTTCGTGTTTTTGACTATCTTTTAATGTGAATTCCTGCTCTCTTTTTATC
CTTTTTTATTTAGTTTTTTTTTTTAATTATCAAGTATTACATAAAATATT
ATCGATTACAAAATTTTACTTCTTAAAAAAATCCATATTCATTTCTAGTA
GTACTTGACAAGCTGATCACGAATCGGTAATGTAGTTTTTTTTTTTTTAT
CAAATCTGGTTTTCGAAAAGTCTCCATTTTAAAACTTAATAGTATTTTTG
TACTTTTAATAAGTTTTAGCCAACTTTGTATTATTAAAAAATTCATAGTT
CATACAAAAGTTCATTTATACTTTGCAAAATTTTATGTAGATTTTAAATA
TGTGCTTTTTGCTTGATATGTGATCATCAAATCCTGAGGAAATGCATTTT
AAAAGATAAAACTTGCAATAACTAAAAACAACAACAGTACTCTATTAAAT
AATGGATTATATAGTACATTTTCATGTGACGCCACCAAAGTTAATGTCAG
TCATTTTGGAGGCCTAAATAACTAATTTTTATAACAATAAAAACTCTTGC
ATATTCATAGTAAGGAAAACTATTGGATGTTAAAATGGACCAACAAATAC
ATACCTTACTGTCTATCGAAAAATTATCCCTTTATTGACTAGTCTTATTA
TATATCTGACCATAAAATTTATTAAAAATATATTATTGGATCGTTATACA
ATCTAATTTCCATAATGTAGATAAAAATATTATAATAAGAGTTGAAAGAA
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TATTACTTTGATTATGTTCAAATACTACTGTTTGTTATTGGGATCAAGTA
GTATTCAATGCTAGTGTTAAGCTTTTCACATTCTTAAAGACAATAAATGG
ACTTAAATCCAGATTCTATTGATAATTAGTTNTTATGTAGTATAAATATC
AACTTTAATCCCCCAAGATGCCATATCCTTCAATTATGATACAATTGATG
CCACCTATAAAAATGTTCTACACCCGTGGGAGCTTTATAAAATAATGATG
CTATTTATAATTGCTAGCCAAAAAGGGTTAAGTTGAATATTCTGATGATT
ACGTAATCCCATATAAAATATAAGTACATATTTGATTACAACATAAAATT
TAGTAAAATTACAACTAACATTCATGTTAATTAAGGATTTTTTACAAGCT
CAAAAGTTGGTTTAAACTAAAAAAAGGTAAAAATAATCAAAAATTATCAT
AAACCAGATATTTAATATGAAAAAAACTAATTACAGAATCGTGACCAGCT
TACCTAGTACTACAATAAATGAATATGCAATTATCGTTATTATTTTTTAC
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AAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTGTAAMAAGACACTAAAGAAGCGAAAGAAA
AATATTATATACAGAGGAAGTTCTACAAAAACTTTAAATAAATTAAGAAG
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AATAGTACATTCAAGGGCATTGTACATATTTGCTAAGGATTACAATATAA
AGCTTATCACAATTACCATCATATTTGAAAAACTTAAAAATTGTATATCA
ATACACATACGTACATTGATGTGGAGTATTTTGTTATGAGTAATCTTTTT
AAAAAAATTTCTAGGACTTTTTGTTTTGGGTTGTACAAAATTCCAAAGAA
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GATTTTTTCCCCATGTGCCTTTGAATAAATATTTCAAAAAACTATTATTT
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TTAAAAACCCTTAATTGGTCTTAAAGTTTATAAACTATCAACGTGAGTGA
CAACAAAGTATGTTGTTTTGACATCTAATTATCAAATAACAAAAAAAATT
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TATATTAATTGATCATTATTCTGAGATGTACTTAGTACCTACTTTCGATT
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