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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s704 | supercontig | LSalAtl2s704:398191..414067 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010591 >EMLSAP00000010591 ID=EMLSAP00000010591|Name=EMLSAP00000010591|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=461bp
MKKEDVQASVRVMQALEMENEPTWKEVKSMKDILQGASPNSPEAIELNLA RATKAAGINRGEFTKILVAQKAMSVLGIDAKHLAQVMNIEKVIADNGVPA VEIARVLSDGGVPVDAHKKLAEITAAGLEKDFCAADVDSFVNLYDNFKLK SNIPDETIEHIDKTLIQVRCSLEDVADNLICSMNARGEKEHVIIRNLCET LKDTGASVQIVGTTMMGSLGKALPKTEPELMKDTGRSLTEVGYCTEDVNS TMTEILLNVLDEKPEMREDAVRACEVVMKDSGQFPDQIRKHLDAVLPPEE KKMDPRLAEELERLRAAEEAREARGEGGHDDSGSEIEYDESNRPIPKKPK NMAKAIKDRTGSGVSSRRGSSIGTTPRGSISIGGTERRGSFYSDDVSKRN SVAIVVDDPDNKINMEKALNEVFNNESKDEGKCFQTFTLKIIIYLFTIMT SLYTYKTYSTN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s704:398191..414067+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010591-706438 ID=EMLSAT00000010591-706438|Name=EMLSAT00000010591|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15877bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s704:398191..414067+ (Lepeophtheirus salmonis) TCGGACCCAGAGGACAAGGCTGCACGCAAAAAATGAAAACAAGAAGGAAA
AAGATTTTCCCCCGCCTACTTAATTATAATATTAATGATTTTTTTTTACT
AGAAATTATCCTAACTGATAAGATTCAAGTTGATTTAGTAGGGTTTTAAT
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GTGTCCCAGCAGTTGAAATTGCAAGAGTTCTCAGCGATGGAGGTGTGCCT
GTCGATGCACATAAAAAGCTTGCTGAAATTACAGCTGCTGGCTTAGAAAA
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TTAAACTAAAGTCAAATATTCCTGACGAAACAATTGAACACATTGATAAA
ACATTGATCCAAGTTCGCTGTTCTCTTGAAGATGTTGCTGATAATCTTAT
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TGTGTGAAACTCTAAAAGATACAGGCGCTTCCGTACAAATTGTAGGAACT
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TTCGTTTTCCCTCTAAATAGACAAATTTGAATTTGTTTTGTTTTACTTTT
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GGATTCAATTCTGTCGTGAGTGGAAACACTGGACTGCAGACGACTGGAAA
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TCTTCACATGATTCCACGAAACTAATCTGAGATAGCCAAGTACTATGTAA
AGAATATCCTCAGCAAGTCTCTGATTTCAGTTTTGTCTCGTACCAAAGAA
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AACAGTCCTGATTTGTCTCTCATTGAAAATTTGCGAGCCTTTGTCCAGAG
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AAAAAAACTGACAAAAGCTTGGGAAAAAATTTCTCCAGGTACTTTGAAAT
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GGTCGTCATATTGGGAAGTAAATAAAGTTTTTCGCCAAAGAAAATCATTT
GTTATGGTTATTTCATGATTTTTAYTATCAATTTTTGGACATACTGTACC
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CAAAGTATTTCTATGAAAATTAGAAAATATATTTGTGAAAAAAAGTTTGA
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AAAAGTTCTCGGGCTTACACATAGATGGCACTATTTCTTAAATTCACCCC
ACTTTTAATTAGTGCCAACTTTCAATGGACAGCTGTCAAAAATTTCACGA
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AACGATGCAGCAAAAACATTTTTGTTTTATAATCTTATAAAACTTCTTCA
GTCTTATGGGGACCCGAGTCTACAAGGTATAAAAATTAGTAAATAACAGT
AATCATAATTTAAAGATTTAGAGATATTTTGATTTGTATTAAATTTAAAA
TGGAGTCTATACAGTAGCTAAAAATCTAGACAACCACCAAATTTCATCAA
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GGGGAGTTAAAAAAATTATGTGCATAGTTCTTCTATCTATGACCTATCTA
TAGAAGTACATGATTAACCTTGACGGCATCAACTTTCTCTTATTTTATAT
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CTTATTTCAGAATTAAGACTGCAGTACAGTTCAGTCTCGGTCCTTTCCAC
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ATAGGAGTGTGGGTAGAACTTAATAATACTAAGACCTAAATTTGTTTGAG
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ATTTATTTCGTCCAGTCCATTCCTAGGACCGTCCTTATCAGTCCTTGGAA
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ATAATATCGTGCTATTGTTTTGACGTACTGGCCCTTAATCTTCTCTTTTC
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ATAGGGTAACTCTTATTATRTACTTAAAAATCAATGTTTGTATTTTCATT
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GAGTTAATCTTTCTTTCTCTTTCTTTTTAGAACTTTTTTGAGTATAAGAA
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TAATATCTTATTATTTTTGAATATTTTCAGAATCCAAAGACGAAGGTAAG
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AATGAGGGTATTGTAATCGTAGCTTAGAGTTTGAGCTTGTTTACGTAGTT
GCTGCTTCTATTGCTTTTTATAAACATGATATTATGGTGAATCCTCCTTC
AAATTTGAGACAGCCTCGAGGGAAGAATTCAACATAGTATGATCATGTAA
TAGGCATTCATCTTAATTCAAAATTTACAGGTCCATCGTGGAAAGATAGA
CTTGCCTCACTTGCATCCGTTGATCCATCCGAGTTATCCATTGAAAATTC
GCTAAAGCTTGTTGATAAAGAGCTAGAAAAAATTGCACATCTTCCCGAGT
CCAAAAAGGCTATAGCCATGAATGAATTACAACTATTAAAAAGAGGATTA
CTAACTGACATAATAAAGGACCCCGACCAGAGTAAAGACAAAATATTAAG
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CTCACTATAAATATTTAGGGGGTTGCTACAAAGGAGATCCGACTCTCATA
GTCGTAGTCAATATTCCTCCCGTATGTAAACTACGACTACAAGCTCTCAT
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GAAAAAGAAATTAATGTGATTAGTAATACGGTACAAAGTATAAAAACAGA
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ATTGATTGAGTTTTTTTTTTCGAACAAGAATTCATTTAAGTTCTTAGAAG
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TCCATGTTTAACACATATAAAATAAATCTCTCTAAAAATGTAGTATTGTT
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TTTTTTAAACTTTTATTTCAAAAAACAAAGCCCCCTCCTCCCCCAACAAT
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AAAACCAAAAAAATCACTCCCCCACAATACTACTTTTTTACCAAGAAAAA
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GTTTATTTATTTCCATTACTTTGTTGGCTCGGATCAGATGCTTCGACATC
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AGAATGTTACAGGTAAAATTTTTATAGCTATGCATGCTGCTTCCCTTATG
AAGAAACAAAGCTTTTCCCGCGCTTATTTATCAGTCTCTAAATTTGCATC
CTATTTGCTTTTATTAGGTTTGAGCTCTAAAGTTAATCAGGGGCAGTTAT
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GGTACCGACTCTTTCTTTTTTTCTTTCTCTTTTTTTCTCTCTTTTTTTAA
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CTATTATCTATTACATAATTTATATAGCAGTCACTGACGGARCCGCCTTA
CTTATCGGAAAAGGTAACAAACTCCTTACCAACTCAATCCTTGCATTACT
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ATACAGGATATTTTAAANTTTACAACAATCAGGTACTATTCGTACTTAAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTTAGGTA
CTATTTTAAAAGAACCTTCCGAAGAAGTTGCCAATATTATTTATAGCAAA
GGTAGATAGACTACTTAAATTTGCTGCAACTAAAAGCTATTTTGCCAACT
ATTTTCTTAGGACTCTCATCACTAAAGGACCCCGAGCAAGCTCAAGAAAT
AGTTAAAGGCATACTCTCTCAAAGAGGTTAGATTTATATATATATATATA
TATATATACACTATTTAGAATAGTAATTTTAGTTAGGGGTTTCNCAGACG
AAGTCTTACAAATGGCTAAAATACTTTCTAACGAAGGTATGTTAATCTAG
GAAATGACTAGTGTTAATAGTGACTACTTATTTAATCATTTAGCAGCCCA
AACAGATAGGACTGGTAGTCTCTTAGCCCAGAAGGAAAAAGATACAAGCA
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AAAAATCAATAATTTAGTTCCAGATGATACAATTTTGAGTCAGGATATAG
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AGATAAAGTAAAAGCTCCTATGTCTTTTACAGGTATAATTACAACAAATT
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TCCTTGACATCCGATAAAAGTCAAAAGTTGGCTAATGTCCTATCACTTAA
AGGTAAAAGTCCTAATGATGAAAAAAAGTGTTTATCCAAAAATTTCCCAT
TAAAATATATAGCTGATAGTTCTTTAGCTGAAATAGGAAATGTTTTGGAG
AGTAGAAGGAAGGAAACTAGTGGAACTGAAAAAGGAAAGACGAATCAATT
AGATTTGACTTTAGGGCTTATTAGCTC back to top
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