EMLSAT00000010591, EMLSAT00000010591-706438 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010591
Unique NameEMLSAT00000010591-706438
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s704supercontigLSalAtl2s704:398191..414067 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010591 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010591EMLSAG00000010591-693357Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000047196EMLSAE00000047196-756124Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047197EMLSAE00000047197-756125Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047198EMLSAE00000047198-756126Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047199EMLSAE00000047199-756127Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047200EMLSAE00000047200-756128Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047201EMLSAE00000047201-756129Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047202EMLSAE00000047202-756130Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047203EMLSAE00000047203-756131Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047204EMLSAE00000047204-756132Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047205EMLSAE00000047205-756133Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000047206EMLSAE00000047206-756134Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777303auto777303Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010591EMLSAP00000010591Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010591

>EMLSAP00000010591 ID=EMLSAP00000010591|Name=EMLSAP00000010591|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=461bp
MKKEDVQASVRVMQALEMENEPTWKEVKSMKDILQGASPNSPEAIELNLA
RATKAAGINRGEFTKILVAQKAMSVLGIDAKHLAQVMNIEKVIADNGVPA
VEIARVLSDGGVPVDAHKKLAEITAAGLEKDFCAADVDSFVNLYDNFKLK
SNIPDETIEHIDKTLIQVRCSLEDVADNLICSMNARGEKEHVIIRNLCET
LKDTGASVQIVGTTMMGSLGKALPKTEPELMKDTGRSLTEVGYCTEDVNS
TMTEILLNVLDEKPEMREDAVRACEVVMKDSGQFPDQIRKHLDAVLPPEE
KKMDPRLAEELERLRAAEEAREARGEGGHDDSGSEIEYDESNRPIPKKPK
NMAKAIKDRTGSGVSSRRGSSIGTTPRGSISIGGTERRGSFYSDDVSKRN
SVAIVVDDPDNKINMEKALNEVFNNESKDEGKCFQTFTLKIIIYLFTIMT
SLYTYKTYSTN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s704:398191..414067+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010591-706438 ID=EMLSAT00000010591-706438|Name=EMLSAT00000010591|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15877bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s704:398191..414067+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCGGACCCAGAGGACAAGGCTGCACGCAAAAAATGAAAACAAGAAGGAAA AAGATTTTCCCCCGCCTACTTAATTATAATATTAATGATTTTTTTTTACT AGAAATTATCCTAACTGATAAGATTCAAGTTGATTTAGTAGGGTTTTAAT CCGTGATTTGTAAATGTGAGGAAGTTTTTGACTAAGACATCATTATTCAT CATTTTAAAATATCATAATTGGATTAACCTGAAGAAGAGAGGCTATCTTA CTCCTTCTTAGTTAGTGGTGCAAAAAACAAAAAAAAAGAGTTCATTTACA CATAAATTGAAGTCAAGATGGGTCCCTTCATGGTAGAGATCGTCTTTTGT CGTGTGACACGACGTGGACGTAAGCTTAAAAAAGGCATGAATAAGGCTGG ACTTAGTAATATGCGAAATGATGGTCCAAGTACAACGTTTATACCAGCGG ATGATACTGTTAAGATCACATTAGATCTATCTGAAAACGGTCCAGTCTTT AATGCTCTGGATGAAATGATGATGAAAATGCTTGAGGATGACGCGTCTGA TAGAAAAAAACCTAAGAAATCAGGTGGAGGAGCTGGAGGAGGCGAGGCTA AAAAGGNCCTTAAAAAGTCTTTTAAAGTCCGGCATTCCTGGTATTGAAAA AATGTTTGCTCCTGCCGGAAAGGGCAAAAAAGGAAGTGCTAAAGGCTTCC ACAAAATGAATGAAGGCTCAAAAAAAAAGTTTATGAAAGCTATTTTTGGA GAAGATGGAACAGCCATTGAAACTGGCACAGCTGCAGCCCTTATCGCCGC TACTTGCTCCGGAGGAGATCCGGAAGTTGGTGATAAAATTGCTCAACTTC TAGTGCCAGAACTTGGGGATAAAATAGATCCTGCAATGATGGCAGCCTTG ATGGTTGCTTGCTCCATGATTAGTGCCGGTGCTGGAATGGAAGAGGTAAG AAAGACACTTTTTTTTWTCCTTCATTTCCCKCATTATTGCAGAAAAYTTT AAAKCGRCCMTTGGACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNAGCCTTTATTTATTTGATGTTATATATATTTTTTTTCATAA AAAAATGGAAATATTTTTAAATATCCCATACAAAATTAATCAATTTAATG TTTTGACATAATTTCTTTAACCTTGGACGAAGAACAAAAAAAAAGCACAG CTGCTTACAACTTATACTTAACTACTTAACTCCTTTTTTAATATTAAAAC ACCCATATGACAAAATTTTGTGGCCAAAATGAAGAAAATATAGAAACATA CATATAGTCTAAAATTCATGATTTCAATTATTAAATATATACTGCCCCTC AACACAAAAGCAAGTTTGAATGATTTTTTTTTTGAGAATTAAGTGTGGAT TAGAATTATATTCTTTCACGAATTATTGTCAATTTAAATAAGCAAATTAT TCCTATAAATCCATTGGAGCTCCTACAAATTGCGCAGACAGTAGTCAAAA AGAATCGTCAGAATGAAAGAACGGGGAATTGATAGATTTTATTTGAGAAG AGGCCATATTAGGTCCAAAATAAATCTATTAAGTCAAATAAACGTTTTAA AGAATACCTTAAATCATCCCACAAATGTGAGCACAAATCCTATAGTTAAC TCAAATATTTAGATGAAACTTTGGCCTGTCTGTGCTATATGAAGGGGAAA AAATGAATGGGATTTTCTACTTTTCTTCAAGATTGTTTTTATGTTGACGC GCCTCATTTATACATTAATTAATTTAATTTTTCTTCTTCTTTGTAATCAA ACATGTATATATCATTTAAAAAGCCAAACAATTAACTTAATGTGATAATT TTGTTGAGATTGGACTTTTGCTATTAATGTTTTTGTTTTTTTGACCACTT GTTTAAACATACTTTTCATTCTTTAGAACTGAAAACAGATTTGTTTTTAT CGTCTTTTATAGTATACTCAATTAGATGAATGGCGGGTGATTCTCAAAAG TTATTCCACTTTTAAATTATTTTGGTCAGTTGAACATCACTCAAAAATTC TTTATATACCTATAGTTTAATATTTAATGAGGCATCAGCTTTGTTTACAA AACAATCGAGTGGTGTCAAAGTAATACGACTCCCTGAATGAATAACTCAA AATTATAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNCTACGAAATACCTTAAGAATAATAAAACACAGTTTCTTT CAAAGATCTAAAGGACCTTGAAGTATAATGTTTCTATGCCATTAGGTTTT AAAAGCCATGAAGGCTGAGCTTTTGGATTCTGGGATGTCAGAGGAAGATA TTTTCAGAAAGACACAACTTTTGATGCAGGCATTTGGCCGAGACGAATCA GGAAGTCTTGCTGAATATTCTTTGGTAGGAAAACAGAAGAACTCTGCTCT CAAAAAGATTGAATTATCACCAAAAGACTTTGCACAGGTAGATATGCATA TTTGAATGCCTTATTAGCTACATGGGTATTTTACACTTATTATCTTTTTT CTTCTCAAGATTGTTCTCCTTCAAAGAACCATTGCAGCTAGTGGTGCAAC TCCAGAAAATATTGCAAAAGTTATAATGATTGAAAATCAACTTTCTAAGA GGGGTNGCTCAACACAGGCACATTGCAGATGCGTTAAAAAAATTGATAGA TCCGAACAAAGGGAGAAAAGATACTATTGAAAAATTATCAAAAGCGATCA CGGATGTCAAAATGAAAAAAGAGGATGTGCAGGCCTCAGTTCGCGTTATG CAAGCCCTCGAAATGGAAAATGAACCAACATGGAAAGAAGTTAAAAGCAT GAAAGATATTCTTCAAGGTGCCTCTCCCAATTCACCTGAAGCCATTGAAT TGAATTTGGCAAGAGCAACCAAAGCAGCTGGAATTAATCGTGGTGAATTC ACTAAAATCCTAGTTGCTCAAAAAGCAATGTCTGTACTTGGCATTGACGC TAAACATCTGGCTCAAGTCATGAACATTGAAAAAGTTATAGCAGATAATG GTGTCCCAGCAGTTGAAATTGCAAGAGTTCTCAGCGATGGAGGTGTGCCT GTCGATGCACATAAAAAGCTTGCTGAAATTACAGCTGCTGGCTTAGAAAA AGATTTTTGCGCTGCTGATGTTGACTCCTTCGTCAATCTATATGACAACT TTAAACTAAAGTCAAATATTCCTGACGAAACAATTGAACACATTGATAAA ACATTGATCCAAGTTCGCTGTTCTCTTGAAGATGTTGCTGATAATCTTAT CTGTTCAATGAACGCTCGAGGTGAAAAGGAGCATGTAATTATTCGAAACT TGTGTGAAACTCTAAAAGATACAGGCGCTTCCGTACAAATTGTAGGAACT ACCATGATGGGATCCCTTGGAAAAGCACTACCCAAGACAGAGCCAGAACT TATGAAGGACACCGGTCGCTCTTTGACCGAAGTCGGATACTGCAGTAATT ACATGACCACCACTTAAAACCCCTTTTTCCAAATTTATCGACAAACCCAT TCATTCTTTTTTTCTTCTACCATTTTTAGCTGAAGATGTAAATTCTACAA TGACTGAGATTTTGTTAAATGTTTTGGATGAAAAACCAGAGATGAGAGAA GATGCAGTTCGAGCATGCGAAGTTGTGATGAAAGACAGTGGCCAATTCCC TGATCAAATCAGAAAGCACTTGGATGCCGTTTTGCCACCTGAAGAGAAGA AAATGGATCCTCGATTAGCAGAGGAGTTGGAGAGACTTAGAGCAGCGGAG GAAGCAAGAGAAGCCCGAGGAGAAGGCGGCCATGATGATAGCGGTAGTGA GATTGAATATGATGAGTCAAATAGGCCCATTCCAAAAAGTAAGAGTGGGT ACAATTTTTTTTCGTTTCCCGTTCAAAAAATTGTACTAAAAGTATGGTTG TTTAAAAAAAAAATAGTCAAATTAAGTTCCTTTCAAAAATAAATTATGTC AAGTAAAATCCAAAATAAGTGACACAATCACAAATATATCTTCCTTAAAT AGGGAATTGACATTTGTTTGAGGTTTTTTTTAAAAGATAAAAAGAGTTTG CTTAAAAAATAAACAAATACTTCTTTCTTTAATAATTAAATAGTTAATGG AACTCCCTTAGTCCTCAGTAAGCTGTTTATCTAAAATAGTTTTTATTATC ATCCTACTTTTCTACACTTTTCTAATACCTATATTTATTTTTGCATTTTG TTCGTTTTCCCTCTAAATAGACAAATTTGAATTTGTTTTGTTTTACTTTT ACTTAAAACAATTCCCTATTTTTCTTTTCTTTTTTTTTGCTCGAAATCAA GAACAAATTTGCAGTCAATCAAATGTGTTTCCAACCAGATATTTATTATT TAAGTTATAGAGCCCAAAAATATGGCAAAAGCTATTAAAGATCGAACTGG AAGTGGAGTGTCCTCTCGAAGAGGATCCAGTATTGGTACAACCCCACGGG GCTCCATATCTATTGGTGGAACAGAGCGGAGAGGATCGTTTTATTCAGAT GATGTGTCAAAGAGAAACTCTGTTGCCATTGTCGTCGATGATCCGGACAA CAAAATTAATATGGAAAAAGCTCTTAACGAAGTTTTTAACAACGGTAAGG 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CTCCAATTTCCTCAGGTTTGGGCCATTATCAGCCACCAGGTAGTGTCAGA TCTTCACATGATTCCACGAAACTAATCTGAGATAGCCAAGTACTATGTAA AGAATATCCTCAGCAAGTCTCTGATTTCAGTTTTGTCTCGTACCAAAGAA ACTGGACCTCCTTCGAAGATGAAAATGTTGTCTGTCACATCATGAGCCAT TTTCCAGCAGGATGGTGCCCCTTCTCACCACTCCAAAAAGGCACAAAATT TGTCTTCAGATAACATAGATTCTTTCTGGGGCAAAGGTGCTTGGCCTGCC AACAGTCCTGATTTGTCTCTCATTGAAAATTTGCGAGCCTTTGTCCAGAG GGACCTCAATGAAAATGTGCCAGMAGCATCAGAAAATGAACTAAAAAAAA AAAAAAACTGACAAAAGCTTGGGAAAAAATTTCTCCAGGTACTTTGAAAT AATCTGTATGAAGGGATACCAAAACGCATAAAGCATGTATTAAGCTTAAA GGTCGTCATATTGGGAAGTAAATAAAGTTTTTCGCCAAAGAAAATCATTT GTTATGGTTATTTCATGATTTTTAYTATCAATTTTTGGACATACTGTACC TATGAACTCCTAATATAAATGCTTTTCGCAGTAGAAATACTTTTTTCCAA GATATAAATCCTTTATTACTCCATTCAACAAAAAAATAAGAGTGCCTAAA CAAAGTATTTCTATGAAAATTAGAAAATATATTTGTGAAAAAAAGTTTGA TTTTTACCTTGGTTGAATGCTTTTTGACCTTACATATATTATATATTGTT CATGAATGTTTATTTTAATCAAATTGTTTTGATACATAGCACATGTGCTG AAAAGTTCTCGGGCTTACACATAGATGGCACTATTTCTTAAATTCACCCC ACTTTTAATTAGTGCCAACTTTCAATGGACAGCTGTCAAAAATTTCACGA 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