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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000007791 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000007791 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s457:159158:178306:1 gene:EMLSAG00000007791 transcript:EMLSAT00000007791 description:"snap_masked-LSalAtl2s457-processed-gene-2.9") HSP 1 Score: 152.14 bits (383), Expect = 3.267e-49 Identity = 75/75 (100.00%), Postives = 75/75 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIVIFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD 75
MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIVIFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD
Sbjct: 1 MLIKYIEHHNSSKANLKEVMRNKHKKNIYISNILQLWTLMLAMMLPAGIVIFAKQVLIGKQTLLCHGIPITHILD 75
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000007791 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000007791 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000007791 | 3.267e-49 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s457:15915... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s457 | supercontig | LSalAtl2s457:159158..178306 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | snap_masked-LSalAtl2s457-processed-gene-2.9 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000007791-690557 ID=EMLSAG00000007791-690557|Name=EMLSAG00000007791|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=19149bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s457:159158..178306+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGCTTATTAAATATATAGAGGTAGGTACATGTATTAAAGAGATAAATTA
CTAAATTCTGACAATGGACTTAATAATTAAAACTTAATATATTTGTCCTT
TCAAAAATGAACAGTACATTGTACATGATAGCTTTACACTTTCAATCTAG
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NNNNNNNNCCAATTATACAGATTTTAAAGTTGTACACAAATGCTTTCAAT
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CTCATTGGACTTGAAGAAGAAGGGATCCATTTTCTTCCCATCAGAGGCCA
CAACTCTCAAGTACATTTTTTTTTGGTAGGATGTTTTGTTCTGAAGGTGC
CCTGGACTTCCTCAGGTGATGCTGCTATAAATTTGTCGTTTCTGCAGTTA
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CGACAGATGACTCTTTAAGTAATTACGGACTTTTTTGCCTCTCTCAAGTC
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ACATGTCATACAAGCGGCGTATTGATGCTGTTAAATGTTCCTTGATCTTG
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GATCAATAACCACGTCGAGAAGATCGGAAACCTTTTTCCTTTTTGATTCC
TGTTCACTAATTTTTTGGCCGATTTTGATCAAATCAAAACAATGCGCAAG
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TTTTTAGCGTAAAAAAATAATTTTAATGACGCAGAAAATTTCCCTGTCGT
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TGTTCCGGCTTTGTAAATTTGCGTGAGCTCATAAACCATGAATATTTGTT
GCAGACTTATAATTTGAAGTCATTGTTGGACTCAAAATAAATCTGAGGAC
TGACATCTGAGTAGTTCTTGTATATCTCCTTGTTTTTTCCCCTTGTTATT
ACAGCTAAGCTCCTCCAAATTATTCTTCAAATTACCAGGGCTATTATGCT
GATTTTTGGTTTCTTTCCTTTTAACATTCCCAAAATACTCTGACTTAGCA
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TCTGAAAATTATGTGAGAATTTATTCTGATAAACTTAAAGAAAGAAGTAT
AAAAGTCAGTGTCTCCAATTATATTGTTTGAATGATCGATTTGGAAAAGT
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CAAATAAGAGGGGTCTCTATATAACAAATGTATACTATTAAAATTCCAGA
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AGATATTTGAAGGTTTTGTATAAAATTATTCTCAATTTGAAAAGTTCTAA
TTTTGAAAAACAGATTAGTCTTTTTGTTCTTTTTTTAGTGCTGTTTTTAT
GTTATACTATTGTGGTTTTTTTTTCCTTCAATTATCTATTAATTTTATTG
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AATAATATTTTCAACATGTCATTAGTAACCAATTCTGAGCACATATTACA
AATAATTTGTAAAAATAATCTACTTTCAAATTCAAAACTTATACCTTTAT
GATCCCTTTAAATATACTAATAAATTAACTTTCAATTATATTTTATAGCT
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GTCACTATATTGGGGGTTTAAGTAGAGTATCATGTTCAATTTCTTTAAAA
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GTGTACATAATTATACCTATAATTTGTTTTAACCTTTAGGCTTTTCTTGA
GTTTGGAATAAATTAGTAATTATAAATAAAAAGTAATGGATAAGATCAAA
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TTCAACTCCTGTACATAAAATTTCAATCATACTTTCTTACAGGCCAAATT
AGTAATACTATAGAGTTTGGTGACATCATTTCTCTTTTACCTATTTGATT
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TACATATAGTATATTTCTTTCTCTAGGAATCACCGGGGTACGAACGTACA
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TGGCGATTCCATGTGATTCTCTCTGTTTTTCATGAGCACACTCACACGTA
GTTACTCAATACTTAGACGTTCTCGCCTCAAGAATAGAAAAATTATAATA
GCAACATTATAATTTAAAAAAAATTGATTTGATGAGTCAATGAGCACTTT
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TGCTGTCCAGTCATAATTACAGTCCCCTTAGGTAATTCTTGACCTGTATT
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GCTTCATACATGTTTAGAAATTGCAATTGTGCTATGTGTAAACGTTAACC
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GTTTTTATTATAACCTCCATTATTACCGTTTTCTTTTTTTTATAGTACAG
AATATATACTCTATATCTGCCCAAGTTGAGTTTCAAGTATCTAGTTCAAG
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AAACTTTTTCTTTTTAATATTGCTATAAAAAAAAGACAAATAAATATTTT
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AACACCACTTTATTCATATGACCACCGTCGCTGGCCTTACAGTAGCCCCT
TTTGTATTTTCGATTTCATGAGCTTCAATAGCTCCAAGGGCGACTCCAAT
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CGAGGTGGGCAGTTGACGTTGCCGTTTCGGCTTATGATGCGATTGTCGAA
GACAATGTGCAAAAGATCTACTGTAACGTTGGCTGTGTGGCACGTAGCGC
CATCCTGTTGGAATCAAATGTCGTCGATGTCTTCTTTTTCCATTTGAGGA
AACAAAAAATCTTCCAACATGGCCCGATAGCGCTCACCATTGATCGTAAC
GGCAGCTCCTTGCTCTTTTTCTCGCTTTCGGCAAAAGCAGCAATGTTTTC
GATTGAACGCACTGGTCGAACGCAAGAACACGTTGTTTTATCCATTAACG
AACCAGTTTTGCGCACACGCTTCACAAATTTATCCACAAACTGCCTGGAA
GGCGCTTTATTTCTACCGACGTAATTTTCTTGCAGTTTCGTTTGAAGACT
CTCCATTTTGGAAGTAAGTCTTCAGTATTTCCTAATTTTGTTCGAGCGTA
AACTTAACCATCTCGTAACCCGGAGACCTTTTAAAAAATATTAGACACAA
TGAGAATGTTACTACAGCTGTCAAGCGTCAAAAAAGTGGTAGTTCAAAAT
GCAATCGCTAGATTGGGTTATGAAAAGGTTCTGTGATTATTTTTTGATAT
TCTGTTACCACCGTCTTTTTACATCAACAAACAATACAAATCGTTTAGTC
ATTTCATTATCATGAGCGAGCTACAAGCAAAAAGGCAGTGCATCCAATAT
CTCTTAGATGCAAGAGTTGATTTAATGAAGATTACGGACATTTTTATGTG
TTCTAGAAGCCTGGTTTTTAAGTTGGCCAAGATGAAAAAAAGAAAAGAAA
AAGAATACATCTTCAGGATGTCAGAAAGTGGAGGGKCAAATTTAAAGAGG
GATACGAAATTTTTGTAAAAGTTGGAGAAGAATATAAAGGAGGATCCGAT
TAAGTTGATGACTCGCCTCACCAACGACTTCTCTGTGGCTCCTAGGACCA
TTGGGAGGCCTATAAAGCACAACTTAGGATTAGTTTATCTCACAAGGATC
CCACTTCACCTTCTGTCAGAGGCTTCTTCAGAGCCAGGAGGGTCGAGAGG
TGCAGAAAAATCCCCCCATGGATCAAGTCAAATTGGTCAATTGTGAAAAC
ATTTCTAGGACAAGAAGATTTTCATAAACGCCGGAACGACTGCTGGCTTC
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CAAACAATGTTCCTCGGCGTTGTGCCTTCAATAGAAAGAAGATACTTCCG
TTCTTTTTCAAGGCTGGTGTGAAAATCAGCCGAGAGGCCTACTATAAGGT
GCTTAGGTACACCATCTTACCATGGCTGAAGACCAACTAACAGGAGGATA
ACAAATGTGTGGACTCAGAACGGCGCCCATTCTCACACACAAGGGTCAAA
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AGATTTGAACCCACTGGACTTTTCTATATGGGAGACTTTGGAGNAGGGAA
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TGGCCATATTGAGAGCAATTTTTTTTTTGCAAAAACCTTGTCTACATGTT
TTGTTTACATTATTTCTAAATCCATCTCTCAAGTCCACATTTTGCCCTAC
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GCATTTCAACGATCCCCTGTCTTCAATTTCGAGATAGAAAGATAAAGTAT
GACCGCAGGCAAACTTATACAATGTATCCAATTTGTTAAATAAGTATATT
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AAATTTCATTTTTTAGTCCTTGGATTGAGATGATGTGTTTCTGATTGTTA
TGAAAAATATGAAAAGGACCTTTATAACAGGAAATTTCTGCTTTTGTTGT
CTACTAAGTGCTTTTTGAAAAATATTTCTTCACTACATTTACATGATTTA
ATGTTATATTTCGCCTTGAAAGAAAGCACACTATATATTTTGTAGTTAGA
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GCCTTGTTAGTGGAAAAAAATGACGAGAAAGTGAGTTACCTTTTCTATGG
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GTTTTAAAGTGAAGACAATAAAGAACACATTAAAAATGCTTGATTTGTTG
TTTGGAAAACTTTTTTCCCCTATTTATAAACAGGGGATGACAAAAAATTA
GAAAACATTTCGACGCCATATTCAATTCTACATGTTTTAATTTTACGCCA
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GTTGTTCCACTTTTTGGTAATTATGGCCTTCAGGGCATCGACATTCGAGT
GATAAGTCTTGTTCGTCTTGCTCTCCAAGGCGCACTAAACAGAGAAGTCC
GGGGGGTTCACGACAGTTGAGGACGAAGGCTAGAGGTCTACCGACCAGAA
GGTAGGCATTTTCTCCCTGCAGAAATGCTACACCTACTTGGACTAGTTTT
CCAGGGCGCCGTCTTGGGTAAACACATAGTTGTCTATGGAGAACGTGCTT
TTTAACAGTGGCAAGTCATGATATCTGAGGACCTTGTAGTAGATGTTCGT
GTTGACTTTTTTGGTGGCCTTGAAGAAGTAGGGATGCATCTTGCTGCCGT
GGCATGGCACGAAGCCAAGTGCCATGACCTGAGCTGTATGTTTTGTTCTG
AAGATTCTCACGACCTGAGCTCTTGAGTAAGACAAGAAGCGATCATTTCT
CCTGTCCAGAGCAGCATCCACTGTGATCTTCTTGTCGGAGATCACACAAA
CAAGGCAAACCTCAAATTGTAGATTCTTGTCAGCTCTTTTGAATGACACC
AAGTATAAAATAGTCTGACTTTTAGAACTGAGGCTAYTCAGMCTCTWAGA
TGATTCTAATTTTGAGTCCTCACCCTGTAGGAATCGAGGTTTGACTAGAG
ATTTTGGGTAATAAAGATTATTTTCATACTTTTCGGAGTAAAAGCAATCA
GAAACATACCAAATCCATCCAATTCAAGCGCAAAAGTTTTATTATTTAAT
AGTTCATTTTTGGATATGAAACTCATAATCTATATTATAGAGTAGTAACT
GAGTATATACAGCTTCTTTCCTAAGCATAAGTACATAGATTTCATTGTTA
CCTAGTTTCTTGTAAGAGGATGTATGTTGTTACTTGTGTATATGCAATCC
AAGCATTTCTATTGAAAATATAAGGGTAATAATCATTTCTCAAATGAGTA
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AACCGGTCCTATCAATCCTTAGTACCTTTCCTTAAAACTGTAGGCCCTTC
GGACTGTCAGTAATAAAAGTGATTTTAAAAAGAGATAATTTGAGTGACGT
CATCAAGGACCGCACTTTATAAGTTTTAAGACTGAGCTGGACAGGACTGA
GAGTGAACTGGATGGGGCTGCAGTTCTCAGTCCTAAATAAGGATTGACAC
AACACTAATTCCTAGTGCAAATAAATCAAGTCTGGATCCTTCAAAATACA
GACTCGAGTCCAAAGCTCTCATTTCTGTTTTTTTTAACTCAAATAATCCA
TATCAACCTGTATGTCTGACCCTATTTTAAACTGTTTTTACATTCAATAT
CAAAACCAGTTTTGACTACTTGGTTGTGGTTTTATAGTCAAAAATAAAAA
CTGGTTACATTAACCACATTTTTTGAGTACTAATTAAAACATACCTATAT
CAATGCAAGTATTTTCTCTTTTGTGTCTGTTATATGAAAAATATAGAAAT
CATTCAACGTGTATTGTTTAAACTTCTTCTTCTTGAGGATAATGAAATTG
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