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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s170 | supercontig | LSalAtl2s170:411371..433410 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002988 >EMLSAP00000002988 ID=EMLSAP00000002988|Name=EMLSAP00000002988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=138bp
METIYLVRWTDNALITVASDIHGLNPTVNDIVPIDKFNNNNLRYNLFQKE NKLFSVRVFNTYIASKHVHLREAHPTRKLSMLVSECQVSCNSQDSRNRIC TCCETSSERFSVGYLPRICDSSRVPEELNQQGYLLKGK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s170:411371..433410+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002988-698835 ID=EMLSAT00000002988-698835|Name=EMLSAT00000002988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22040bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s170:411371..433410+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAAACGGTTATTAAGAGAATCGATTTTATTTGACTTTTCTCTCTTTC
CTTTGAGCAAAGGGATACAAAATGGTATATTTATTATGTGGATCCATCTG
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GAAGTGTTTGGTGTCTTATGGCAATATATATGGCAAATCTCTGAACAAAA
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AGTTCAACACACCAAGGACTATGACCTAGGCGGAATTATTGGTCCTGAAG
ACGCCCTCGGCCTCCTCTATTCAATACAGAAGCTAGGCATAAATGCATCG
ATTTTGGACCTGGTCAACAGTGGAAATCTTCATAACACTGATGAATTTCA
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GCCTCTTCTCTTTTAGGTTTGTATTGAGGAGGMGAAAGGGAATTAGAACG
ATACTCAATTCATTATGAACGGCGGSCATGATGGGYTTTGGCCGACCGTG
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ATTTGCAATCTTCTCTTTGCATTTATTCGCATTGTGGAAATCAAGATACT
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TTGGATGAATTGAGAGCATCACTTAGCATGCAACATTCAAACAAAAATAC
TGGACAAATTTTCTCCTGCATCCCGTATATAATTTCAAGATAATTTAATA
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TGTATTTCAAACAATTATCTTGCTTTAATATAATTGTAACAAAAGATATA
TGTATTAAGTAATAAAATTACTTTTCCAACACAAACTTTACTCACAAGGT
ATAAATTGATTTGTAGATACATTTGTTAAAATCTGAAATTAAGTAAAGGA
TTTTTTGCACAACTTCTGTATATGTATGTTGCCCGTCAAGACAAAACCAG
CCTAAAATATTTTTTGTCAGACTGAGCCTGTATTAAATTTGTATTCTTAT
ACATATAATAGTAAATTTATTTACAGAAAATATTCTTATTAACCCTTTGG
TTACGGTACTACTTAAAGTAGCCAATCACAATTGTAGATTGTAAAACTGA
TGGTTCTTCAAGACATGGAAAACGGTAATATATCCGAAACCATACTGTTT
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AATAGCATGATCCCGGATATTGTCTTAGAAAAAGCAGTATGTCTAGCTGC
ATAGGACCAAACTATTGCTCTAAGATTTTCTTTATGAGTTGCCTCTCAAA
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TATTAGATTAAACTTCCGTCTCTTGGCTTCAGATGAACTATAATCGCAGG
TTTTATAGAAAGGAGGTTCTATTTGCCAACTTTCAACTTACTACTATTGG
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CCTCCAATTCCTTTTTAAATTGCATTGGAGACCCTACCTTTAAAGAAAGT
TTTTCATTTCAACGGAAGCCTCATAAAGGAGACTCTAGCAATCTAAGTCA
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AAACCCTTTGGATTTCTCCTTTAAAAGTCGAAAGGAGAAATGATTCTGCA
AAGGGATGGCGACCTCTTCATACTGCTTACAAAAACTGCTCTTTCTGTGC
CTTAGAGAAGGAAAACTCTTTTTTTTTTTTAATTTTACGTATGTCCAAGA
GCAAGCTACGTTGTCTGCATGGCTGATGGCCTCTTGGAGGATTCATTTCC
AATATCGATCATCAAAACTGATTGCTTGGTGATGCCGTCCCATTCCCATA
AATACGAATCATTTCAAAAGTCCTACTTATTCTCCACTTTGTACGTACAA
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GGGATAAATCACTCCACTTAAGGTAGGAGATTTTAGATAATTTTTTTTGT
ATTATCTACAATTAATCAAGTTCTTAATATAATATATATTTATTTTTTTG
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GTTTGAAAAAAAATATATATATTATTTATCCAAATTTCAACTTATTATCA
ATAATAGCTTTGACGCTCAAAAGAGGGTAATATATTCCTTGATTTTCAGA
GGATTTTACCTTTGCTTTGGCAGAAAGCTGAAATAGATAGTTGCCTTTGA
ATTATTAACATTTTCTTCCTTAGCATTAAGAAAAATAAATTCATGCAAAA
AGGGGAACCAAGGGCCACTCGACAACAGCCAGCTATGTTCTGTCAAAAAC
ATTCCACATTCCTTACAAAAAAAATTAATTCTGTCGAAACATGAGAGTAC
AACCTAACAAAATGGATAATTATAGTTTAGTTGAATAATTAGAAACAATT
TTGATTCCATATAACTACTCTAATTTGTAACAGTATCTTACTATTTATAT
GATACGTATATAATATTATTAAAACAAGATTTATCTCGTTCGCTGGACCG
ATAATGCTCTTATAACTGTAGCATCTGATATTCATGGCCTCAATCCAACA
GTGAATGTAAACACTTGTTTATCGAAAAAAAAGAAGAGTCACTCAACCAA
ATACAATTCATGAATATAATAGCTAGGGGTGTGAATGATAGGATGGACCA
AAATTGCAATGGTTACAGGATAAATATAAGATCGAAAAAGTGTTGATGGG
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GCAAAAATATGCCAGTGTTACAATTTCGGAGAAAAATTGAACAAACTTTT
ATTCAACAAGCACCAGTTCCGGAGAAATCCGGTAGACATTGAATTTTTCG
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ATATCCCCAGCAATATTTCTAAAAGTTTTTCAATGTTTATTTTTTATGTT
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AGATCAATTTCATATTTTTATAACAAATATAACACCTTGCTATATTTGTT
GTACGAAAATACACGGAAACCAAGTACAAATCATATTTTCTTTACCTGTA
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TTTGAGTATTGAATGTATATTTATTTTTAATTTATGTATATAAATACTAT
AGGCATAAATGACTTCAAATATAGTAACAATTGTTAAATAAAATGGGTGT
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GCAACTTGGAATTTTCCTCATTCCCATGAACCCCACACCACTTTTTGATA
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ACATTTATTCAATAAAACTGCTGTTAGCTTGGACCACAGGTTCAAATCGT
CCTCAAACGTCCCACTGCCTTCTTGTCCATCCCATTGTCTAATGTACGGA
ATCCCGTAGGATCTTGTGGTGCTGTGGGGACCTTTATGGGAAACTCATTC
AACATTGCTCTCAACAAAATAGTCTAAAGGGTCTTATTCCGGACAGTTAA
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TCTAGTGTACTTTTACTGGTGTTACAGGGTACCCAATCGGCTTMCAAAGA
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AACATGTTGTGTGGACTTGGCCTTCATGATCATCAAGACGTTATAAGGAC
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TTGACATAAATTGTTCGCATCGGAGAAGAAACAGAAAAGATATTTTACTG
GAGGTGGGTGATAGACTTTTCSCCCCCCCCCCCCTTGGAAGCCAACATTA
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TAATCTCTAAAGAGATATTTGTCTGATCTCTTTTAAACTTTAATGTAGGG
ACGCCTAGGTGGAATGATGGCTTCCAGAGGGAGGAAGGCCTGGCATGTGT
ATGTAGTTATCTATCATAAAGCCTAAAGTGTTCAAAAGAGTCTTGCAACA
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CCCCCCCCCCAAACCTCTTTCCAACCAATTTTCTGATACGTCTCTAGAAA
GTGTGGTGTGAAACCCCAGGATCTCTGGCATGGTCCCTCATGGATTTGAG
TAGATTGGCCTGGGCTGTTTTATTTAAATTCTCTTGTCTTTAGCTTTTTC
GTCAGAGCCCTTCTTCCTCTCCAACTTTTTGGACTTACTGACGGCGTAGT
CGATGGMTTTGTGCACTCCAAACTGCTTGGAGMGCACAAATGAAACTTCA
TCTATCCCTTTCAAGTGTCATTTGCTCGACTTGTTCGTAGCTATAAATGT
CAAGTTTGTTTTGTTTTGGTACTAATTGATTATGCTTGAATATATCGAAA
TATGAATTTACTTCAATCACTCAACCTTAATTAATTATTGAATTACTAAG
TGTTCAGATTTCAATGGATCACCCGGTGCAATAAGTTATAGCAAGGAATA
GTGAAATGAGTTAAGTTGCGAGCTTACGAGTTTTAGGATTTTTTAAAGTT
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TTGATTTGTTAGGGCAGTGAATCCTAAGTATTTTGCAAATGTAAAATAAA
GAACCCAAAGGCTGATATCATGAACCCAGACAATTTGAAGAATGTTGTGC
GAAAAAAGGAGCTTCGATGTCATACGTTGTATTTTATTATCAAGAAGCAG
CTATTCTTGAAGAAAATGAACACACTTAGCACTCTGTATCTAGCCCAGAT
ATCGGCAAGAATTGCTCAAATGTCAATAATTATCCTACTACGACATTAAT
AAGGACTTATTGCTAGTGTTGTGTCAGTTCTTAACTATTCGATCCAGTAC
AGTCCTGTCGTAAGTCTACCAGTCCGTGGGGCCGGTCCTTAAATGTTGGT
CCTTTTAAATTGTCGATGGGTTATGAAGCCAAATAAGATATATGAGATAT
GTATTAAAAGCCTTGCATAATACTAGCACAAAAAATACCCCTGTTTTTAA
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ATGCGTATAACTACAAATCTGTAAGAACGAAATAATCCACAAAGATTATA
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ATTCATTTACTTGTTTGTAATATAGGCAAAGTACTACTATGAATACATAA
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ATAACTAATTAAAAAGGGAATAAACTCCCTCAATGACGTCATGAATGACC
GCTTTTACTTTCATTAAGGAACCTCAAGTTCGACTCGACTGGACTGAACC
GACTCAACACTATTTTTTGTTAGATACAGTGTTGGCTATTGTTTATTTCA
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TGGTACCTTTTATTTTAGCGTACGGGCAGGTCATATTAGTAAAATCATAT
CTATATATACTCAATCTTCTTCGTGAGTCCAAGAACATAACTAGTCTCTT
TTTTCCTCCAGTATTACTTTGATTGATCAATGAATACAAAAAATTAACTT
TTTCTTTGATACGTGCTATTGATTTTATTAATCTTCTTTCTGCAGTTTTT
TTCTCATTTTTAGACTGGGAGGCTCTTATTTGCAAATAAATAAAATAACT
TCATACGTTACATGAATGGAATAAAAGTTATATAAAATATCGATTAGACT
GCGAAAGAAAAACGTGATTAAGCATTTTTTGCTTGAAGTTACTGATCCGA
CCATAGAGTAAGTAATTTATAGAGACGATGAGCTATTTTTGGTGACAGTT
TGGCATTGTGATAGAGAAGGTTCTTTTTATATAAAGCGTTCAAGGAAGAA
TTCAGTTGCAATTTGGTTATGAAAAATTAATTAACTATCTTTCTGGGCGG
TAAAAAAATAACAGAAACTCTTCAAGTTAAAAGACATTCTACATTTCAAG
TACATATAGATATTACTTCAGTCAAATGGTCCATATGTTTCCCGTCTCCC
TGTATTAATATAAAAATGTTTCTTGGTCTCTTGTTCCCTTTTGCAGAAAA
AAATATTGCCTTAAACTCTTTCAAAAGAAAGAGTGGTGGAAATGACCTAA
TAATGGGACCAGCATAGATAAAAATCAATCAAACAACTCCGTAAGCTTCT
TAATAACTGTGTAGCAGTGATCTTCATGCCTTCTTTTCAAACCTGTCTTT
TTATTGGGCCAAAGAAGACTGCCTTATTATACTCTTGACCAAAACCCGTC
TCCAGCATCTATTGACCATTCGTTTGATTAAAAAAAAGTATATTTTGTAT
GTTCAACTTCCCTCTAATCTATATTTTCCTCTGTTAAAACTCTATCTCTC
TGGAGTCTTTTACAAATACTCAAATTTGATAATTCATTAAAGACCTCCCC
CAATAAAATCTTAATCGACGTTTTAGCTATGAACGTACGKCTTCCATGAA
CATGTKCTKKCTCTTGCCATTCCATTATTTGTAGCGTCTTCATTACCATN
CTCCCATATTACCTTTAAGTTCGTCTTCCAAAAGAGACTTATTTTGCCGA
GTTAATTGAATTGATACAATGATTTGCAAGAAGAATATCCCAAAAGGAAG
GAACAAATTAACTTCCTATAGTGATGATTCACTCATTCATCATGTGACTT
GCTTCTCTTTCAACCTACCTTACCTAACTATCCCTATTTGTGATCAGTTT
AAATTTTCCTCTATATATTTCTTTCTCTTTGTAGTCTGAGCTATTTGTAG
GTCTCTTAAAAAGGAATAACTTTTTATTTTTAACAGTTTCTTCTACTACA
TTTTATGGTATGTCTGGACTTCATACTTTCTCTCTCGAAATTGGTGACCA
CGTAAGTGGATCGCAAGGCTCAATTATCGTAACCTTTTAATAGTATGGAA
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ATATTGGAACAATCCGCACTTTTGAGGATTATGAAATTAGATGAAAGGTC
TCATTATGTAAAAGGAGATGTGAGTTTGTCTCTTATGAAGGATTTCGGTG
GGGCGGGGGGGGGGGGGGGATGGATTCTGAGTCGATTCGTGAAAGGAGCA
CTGAGCCCAATATGAAATAAAAAGTTGTAGTACCTTACATAATGAGATTC
ATACCTATGACAGTCTTCTCTTTTCCAACTAGTCTCCTGTTCCATTACTC
TATTCTTTATTACAATCTCCTTTGTTAACAGATGAAAATTAAAACAAACT
TAGTCAGAACTTGTCGCCTCAATACATTTTATTTTATCTATGGACCAATA
CTCAAATATTCTGTGGAGAATATAAAACTGGACAAAGAAAATAAGAACAT
AATTCTAAACCTAACTGGAATGGGCTCTCGGTAGAGTACAAACTCCCCCT
GAAATAATTTACCTTACAAATTAGCAATCACTCCAGTGACCTAGACCTTT
GACTTATGCTCAGTTTGAAGTGATTATATCATATTTACAAAATGACTTTA
TTTTGAGTTGAATATATCCATTTTTTCCAAAATTATGGTCAATTATGCGT
TTTTTCTGTTTTGTTTGAGCTTGACTTCTCAAAATTTAATAGCCTCTTGC
TCTTAACATACATTATCATCTTCTTACAATGATTTACCATAATTGGTTAC
TCACTTTTAACGTATTCCTTCTTATCAACCTACAGAGACGAAAAAATAAA
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TTTTTAAACCCCAAAAAACAATAACAAAGCAATAAAATGATAAGGGATTC
TGATCAAAAGCACTTTAAAACTAGGCACTGCAAATCAAAGTTTTTAATCT
GATGTTGAATATGAATTTAATACAAATATAGGGTGCATTAAAAAGAATTT
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TCCAGGGATATGAAGTCATCAATATTGTCTTGGAGCCATTTCATACATTT
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