EMLSAT00000002988, EMLSAT00000002988-698835 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002988
Unique NameEMLSAT00000002988-698835
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s170supercontigLSalAtl2s170:411371..433410 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002988 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002988EMLSAG00000002988-685754Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013153EMLSAE00000013153-722081Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013154EMLSAE00000013154-722082Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013155EMLSAE00000013155-722083Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013156EMLSAE00000013156-722084Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013157EMLSAE00000013157-722085Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013158EMLSAE00000013158-722086Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777394auto777394Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002988EMLSAP00000002988Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002988

>EMLSAP00000002988 ID=EMLSAP00000002988|Name=EMLSAP00000002988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=138bp
METIYLVRWTDNALITVASDIHGLNPTVNDIVPIDKFNNNNLRYNLFQKE
NKLFSVRVFNTYIASKHVHLREAHPTRKLSMLVSECQVSCNSQDSRNRIC
TCCETSSERFSVGYLPRICDSSRVPEELNQQGYLLKGK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s170:411371..433410+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002988-698835 ID=EMLSAT00000002988-698835|Name=EMLSAT00000002988|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22040bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s170:411371..433410+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAAACGGTTATTAAGAGAATCGATTTTATTTGACTTTTCTCTCTTTC CTTTGAGCAAAGGGATACAAAATGGTATATTTATTATGTGGATCCATCTG TCAGCCGTTTCTTTGGAAAGATAAATTAAAGAAACCTTTTAAAGTCACTT GACGTAAGACAACGCCGTAACCTTCTCCAATTGTTGAACAATGACGTCAA TACTGGCTAMTCCATATTTAGAGTACTATAATTAAAAAAGTGGGAGCAGG TTTGCTATTGGAAAAATTATTATTGATAATGACGTACTTTTATGTTTTTC ATAAATGGCCGAAATGGAAGAAAAAAGAAAGTTTGTTTTTAAGATGTTTT CCCGCGAGAAATATCCCAAGGATATCAACTCATGTTTGGTTTTAAAAGTT CATTTAATTTTTTGTCATATATGCCGCATGCTCTTTTGGAGAAATGCGGG CACTTAGTCAACATTTTTTTAAATTTTACCTTGTTTAAACTTTCACCAGT GGGGAAAAATGGAATGAATTGATGTATTTGTTGTCCCAAATATATGGAAA GGCACAGATCCCTCCGTAGGATCCTTCTCGGGATAGACAAGTTAACCATG TTGCTCAGACTTTGGGACTCATTGAGACGTTCGTTTGCAAGGTTAGTAGG GAATCTAAGGCTCCAAACTCGACAGATCTGAAACTAATGATTTTTTTTTG TGTGTGAGGTGCGATCGAATGAATTGCCAATCGAATCACCTACAACACAA AAGACGAACTTATCAATCGGATCAAAAAGGAATTCCTAACTTCCATGTCA CCACGTAGTTAAGGTCTGTAAGCGCTTTCAGCGTCATATAGAGACTATAA TTGTGGTTGGAGGTCGAATAAAATAAATTATAATCCATCAAGCTTTCATA ATCTGATTTTATTCCTTTAGTCTGATAACTGATTTGGGAAAAAATTTTGT TTGGAAAAAAAACAAAATATTTCGTGTTACACATAGCTTTGGGTACTCTG TACTTCAACAGGTTTCTTGGTGGTTATTTAAAGTGATGAAAATCGTTTGT ATTATTTACTTTGCCTGTTTTTTGGAGTTGGTAATCTGAAAAGTAATTTT TTTTATCCAATTGTTGTCATTAATAATTTAACCCCTGAGTACTGGACTTA TTTGTAAACTACATTCAGTTATATGCAAAGCATCTTTGAACATTCGTATG TGCTCAATAAAGACAAAGAGATAGACATACATATTTGAACAACGCAGCAC AGGAGAAATTATTCAATTGAATTAAATTTGCATAGGTTCGTGCCTCAGTC GATCCTAGAGAAGGAAATATACATTATGTATAAGGACTTCAAAGAAGATT CTTAGGTCAGATAGAGTCATTGTAGAACTATTTACTTATACTTACTAAGT GCAACTATATCTGAAAAATAAAAAAAATAAAAAGACGTTGAGTAATGTTT GAGGAATTTTTTGTGGAGTTGTAAGTCCGTGTTGAACTCTGAATGGAATT AATGATCGAGATCGGAATAGTTCTTACCTATGTCCTTGTTTTTTTCCTTC TTTCCCTCTTCTCTCGTCACCTTTGATTGTAGCTGATTTAATGAAACACC ATAACAGCTCAACTTCTCTCTCCCAAAACATTCTTTAAATTGTAATGGTT ACCATGTTCATTTTCGTTCATTTCCATAATTAGTAGACTGCCCGACTGTT AAAAACTCAATCTTTCCTAGTAATAGGGACTCTGCCCTTCTGACTGTTAG AGACTCTGTCTGTCTGTCTGATTGTTAGCGACTCCGTCTGTCAACCATTA ATACCTTCTCATCACAAAAAAAATTACTTGATTCATGATGTTGAGGAACC ATTTTAATTTAGTGATCCTTTTCTCATTTGCAGTTACAATTTTATGTCCA TGTTGGACTCAGAATAGAATTGAGGATCGCAGTCGGAGTAATTCTTGGCG ATATCCTTGTATATTTTCTACTTCTCCCTTGTCAATGCTGATTGTAGCTG ATCTCCTCCAAGGCATATTTCAAATTATCAGAGTTACTATGTTAATTTTG GGATACTTTTTTTTATCCAAACATGCCCATTATACCCATGACTTTAATCA ATACATATTAATGTTGATTATAGGGAGGTATAAATGCATTATTTCTATGA CGAGAACCTTTATTTATATTTGTATTTTCAGATATTCAATGCATTACCTA CATCTGTATTGTTTTGATCAAAAATCCTAAGTGAAGAATAATTTATTAAA CTAAAGCAAGTAAGAATGATTCTTCTCCGAATTGAATTGGGATATCATTT GTATTCTTCCACGAATCAACGACACTTTATATCACCAAATTAATTGTATT CATTGCGCTTAAAGCAGCCAATATTTATCATCACTTAAAAAGGCTGAGAT ATTAATTACTTTATGACGCAGAGGGCTTTATTGGACACAAATTAAGTCCC TTAAAACAATGAAAAGTTCAGAACTATGACTAAAATTCTTGGGTATCTTA ACTAATGCAACAAATTTAAATAAAAAAACGTTTAATTGCCTCAAATATGT CTATGAATATATGCCTAATTATTAACTAAAAAATATATATCATAGAATTT TCTGCTTTCTTGAAGGTTTGTTCTTGTTTTCATGTTGACTTTTCAAATAT ATATGTACAGAGTTTGGAAGCAAAACGTGGACTCTTAATAAATGATAACC ATGTTATGAAAATAAAGCGGTTTTGTGATTTTTCCCTGCATATTCTGTAT CTCCTGTTCTTTCTGCATAAGTAAACATTAGTAAGCATTTCTCCAAGATC ATCATGAGTGAGCAAGGAGCAAAAAGGCAGAGGATACGACTTTCACAATA 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TTTTTTTTTTTTTTCCATTAATTTTCCTTTAATTGGTCAGATGGAGTTGC ACTGATTAAGTATAAGTAAATATTAAAGTATTATATTTACTCCATCTGAC TTAGGAATCTTGCTTGAAATACACATATGCACAAAACGTGGTTTGACATC GCAATCAACAGACGGCTGATAGAAAAATAGTTTTGTTTGTATCCCATGTG TCTAAGAGCAACATAAAAAAAGGCAATGCAAATGCAAAATCCTTCGGGCC GGTGTCAATACCAAAAAGTCTACTGGTACCATTGATATTTCTGATAGTCT ACAATATTACATCCCCATAAACCCAAAAAGTACAAAAAATATATATACAG CAACAGTATGGCTGGSATTTGCCATGCCTCCMTTTGTCCCTCCTCCAGCC CTGACTTCAAGCCCCTGGTCTTTGTAGTTGGAGAAGAATTTCTGCAGTGC CTCTAATCCAAATTTGGACTTGCTCCGAGCTGAAATAATGTCAGCAAAGT ACACCATAGACACGGCCTTCAATGTCAAGAACTTCCAATCTATTTCCGGC GTGCTGAAGCTCTTTTTTAAATAACGCAGTTTTATTACATGGCCAAACAA TAAAAAACACAAAATTATTAAGTTTTTTATTTTATCATATGTGTGGAAGT AATAAAAAAATTTCATGTGAGCAACCTCCTCCGTCCTAGTTTACAATATC AAGAAGTCTATTGAGGAGTGCCTTCCCATAGGGCCATGAAGAACCAAAAC TTGTYCAGCCACAATATTACTCACTTATTGCTCCCCTCCAGYACAGACAT CAACCTCCTGAACTTTATTGATGGCTCTTTTTATTGGTCTCTATCCTTTT ATTTCCAATTTTACATTATTTAATTATAGGTTCTAATATTACTTTTCTAT GTATTTTCGGCTTTCTCATTAGGTCTATAATTATAAAAGTGTCTTATTTT CACATTTTTTTATTCTATTCGGAGATATACAAGGTGTGGATCAGAATTTC TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TAACTTTTATTCTAAGAGATAATATAATTTTAATTTATATATAAATGGAT GTATTAGGAATACGATCATTCAATGCCAGTATCTTATCACAGCCTCAATA TGGTGCCTAAGGCGTAACAAACGTTGTGGATGSTCTCCTCGGGYTAGTCG ACCACTCCTTCGCCACACTGGCCTTGAGAGACTCCAGATTTGGGATAGTG TTAGTCCTCGTCTCAATGACCAGAAATAGTCCAACAGATTCAGATTATGG GTGCTGGGGATCCAGAAGCTGGTCATTTTGCAGGTACATAACTTCTAGTT CCTTTAGGTCGTGTGTGCTGATGCATTGTCTTGCTGCCCCACATTGGAGT AGTTGGATTTAAACTAAGACAAGACAGCATCATGTAGTAGAACTCAGTGC TCACAGACTATCCAAGCCTAAAATTGTATGACGGCATTTTATCGAATCCC AGTTCAACACACCAAGGACTATGACCTAGGCGGAATTATTGGTCCTGAAG ACGCCCTCGGCCTCCTCTATTCAATACAGAAGCTAGGCATAAATGCATCG ATTTTGGACCTGGTCAACAGTGGAAATCTTCATAACACTGATGAATTTCA CAGTTAAGCTATGTCCCTTGAGGCAGTTGAAGAGCTTCTGACACTGGCGA GCCTCTTCTCTTTTAGGTTTGTATTGAGGAGGMGAAAGGGAATTAGAACG ATACTCAATTCATTATGAACGGCGGSCATGATGGGYTTTGGCCGACCGTG AACTCTTTTGGTCTGCCATCGACGAATGATATGTAATGGACCGTAAAGAT 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TTTTATAGAAAGGAGGTTCTATTTGCCAACTTTCAACTTACTACTATTGG CCGACTGCATAACGAGCATGTGAAGAGGTGGTCACAGACGTTTCTACAAG TTAACAAAATTATTTACATTATGAAAAGATTTATTCATTGGTTTCTTTGT CCTCCAATTCCTTTTTAAATTGCATTGGAGACCCTACCTTTAAAGAAAGT TTTTCATTTCAACGGAAGCCTCATAAAGGAGACTCTAGCAATCTAAGTCA AGCGAAAGGTTCCAACGTCTGAGATACATTACCATGTCGAGGACTGGAAC AAACCCTTTGGATTTCTCCTTTAAAAGTCGAAAGGAGAAATGATTCTGCA AAGGGATGGCGACCTCTTCATACTGCTTACAAAAACTGCTCTTTCTGTGC CTTAGAGAAGGAAAACTCTTTTTTTTTTTTAATTTTACGTATGTCCAAGA GCAAGCTACGTTGTCTGCATGGCTGATGGCCTCTTGGAGGATTCATTTCC AATATCGATCATCAAAACTGATTGCTTGGTGATGCCGTCCCATTCCCATA AATACGAATCATTTCAAAAGTCCTACTTATTCTCCACTTTGTACGTACAA ATAAGGCCATGATTCCANNNNNNNNNNNNNAATAAGTTGGTTTGAAAAAA ACTTTATCTTTTGGAGCAGTTTGGGGAAGAAGAAATTTTTGCTTTGTCAA GGGATAAATCACTCCACTTAAGGTAGGAGATTTTAGATAATTTTTTTTGT ATTATCTACAATTAATCAAGTTCTTAATATAATATATATTTATTTTTTTG AGTTGTTGCATATACATCTCATGTTATGTGGGTTGAAATAAATTATTGTT GTTTGAAAAAAAATATATATATTATTTATCCAAATTTCAACTTATTATCA ATAATAGCTTTGACGCTCAAAAGAGGGTAATATATTCCTTGATTTTCAGA 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AGATCAATTTCATATTTTTATAACAAATATAACACCTTGCTATATTTGTT GTACGAAAATACACGGAAACCAAGTACAAATCATATTTTCTTTACCTGTA GTCATGTACCACACAAGCTACCAACCTTTCATATATAGTATGTGTACTAT TTTGAGTATTGAATGTATATTTATTTTTAATTTATGTATATAAATACTAT AGGCATAAATGACTTCAAATATAGTAACAATTGTTAAATAAAATGGGTGT TAATTGATTAGTATAGGGAGGTTTAGTGATTATTTTTGAACATTCTCTCT CAGTCATTCTGTCACATAAGCAAACTATAATAAACATTTAGTGTATCAAC ATCATGAGTGAACAAAAAGCCAAAAGGTAGCGCATCTTAGATCTCCTAGA TGCTGAAATTGAGATGGTTAGGATTACACAATTGTGAAGTGCTCCAGAAG CCTGGCTTTCGGGGTTGCCAATATGATGAATAATAGATAAATCTCTCACG GAAAGCAGGTATGGAAAACGCAATTTAAAGAGGGATTCAAAGTTCCTTCT CCAGTTTGGGGAAGAAGATCTAGGAAGACTGTGCCAAATTCATGAATAGC CTGGCCAACAACTTTTCTGTGGCTGYTAGGACAAAATAGGGGMGTGAAAG GCAACTTGGAATTTTCCTCATTCCCATGAACCCCACACCACTTTTTGATA GAGGTTAAGAAGGCAAGGAGGCTAGAAAGCCCACCTTTCTGCTGGCCAAC CATGTGTTCATATATGTGCTTAAGATTTTTTGTAGAGTAATCCTGAGAAT TTGTTGGGGAGGGTTAAAAGTAAAGATGTTCGAATATATATTGTCATAAA TAACTCCAAGCAATTCTGGGCACACACCCGTATTATTTACATACATATAT TATAAATTGGTAACTGGTATTGTTTTTGTAATAACCATTACTCGCTTGTA ACCACTCTTTTTTGTATCTTCATTTATAAACTTACAAATTCAAGACATTT TCTGCAAATAATAGATTATATTAAATTGTTTTTAGGATATTGTTCCTATA GATAAATTCAACAACAACAACCTCCGATATAATCTTTTTCAAAAAGAGAA TAAATTGTTTTCGGTTCGCGTCTTCAATACATACATCGCCTCTAAGCACG TTCGTAAAACAGCTTTCACAATTAAAAGAATACTTGTCCTTTATACTTAC TGGATATATTGTAGAAGTCTTTGCAGATACATTTTCAACTTTTAAAGTTG CTTTATCTCGGGGTTCAATTTGAATTTCTCACTTAAAATTAATTTGCAGA GACTGGCTGAATTATCTCTTTCATATGAGACTTTGTTTTCAGAGAAGGCC AATGCGATAAACGCTTCTCACTTTCTAAAGCTTTTGAACTAATCGAAGCA CAAGGGGGCTTCAAAAGTCATTGTGCAGGTTAGTGAAAAAAAGTTTGCGG GGGATACACAAAATAATAAGGGCAAGAATAAGTCACATGGGGACAAATCC AGTGAAAATGGGGGCTGAGACATGATTCGACGGTTTCATAAACAATTTTC ATTACAGCTTCAACGTTTTCATTTGTTATTGACATGGTTGGGCGTCCTGA GTGATGCTGATCATTGGCCTCCTCCCGGCCATTTTGGACAAGTTTCTACG ACTTGTAAAAACATTTTCTTTTTCTCAGAACCGTTTCATCGTAAGCCACT GTCAACATTTCTAGGCTTTTGGAGAAATTAATTTTATTTTGACACAAAAT TTGATGCAAATTATTGAATCCATGTGTGTCAATAAAATTAAAAAATTGCC AAAGACGCAAAATACTTCTACCGTTATGCTTCTCCCGCACAAACTTAACA TATTTTATCACTGAAACAGTTAATATATGCTCATGGTGAGTGATCTAACA TAAAAAAATAATAAAATCGAGCATTCCAAATGTTCCTTGCCGCGATATTT GATAATTTATTTTACTTTTTGAACACACCTCGTATAACTATGATGTAGTA TATGTTGTTTATCAAACTTGGCATCGTTTTTATTAAATAACTATCCTTCT AAAATCATTGAAATGATAATTAATTTAGAGTGAAATTAAAAAAAAAAAAA TCATCTGGTGTTGAAATACCAAAGTTCTGTGAATTCAGTAAATGAACAAT GGAGGACATCACCTATCTCATTTGATTTTCAAAACCATGTAAAATAACTT TAAATTATGCAATAAAAAAGTGTTCTTATTTTTAAAACATACCTTTTGGA ATAAGAAAGTTATGGCATTTTTACAGCTCACCAACTAACATGATTTAAGT ATAARCCAGCCACATATAGGAACAAAGAAATCCTGATTTGTATTACGTGA CCTTTCCTGGAAAAAGAAACAGAAAAAGGCCCAAAAATAGTTGGCCGTTG TTTGCCAATGCTTACCAACTACGGAACNAAAGGGTGGTATATCTTKCCCT TCAKAAGCCGAGGAAAAAAAGTAAAATGCTGCTGTGAATTTAATTCTTAA TTGACTTTTTTTTTTAAATTAATAAAAATCAACATTATAAAATAAACTTG ACATTTATTCAATAAAACTGCTGTTAGCTTGGACCACAGGTTCAAATCGT CCTCAAACGTCCCACTGCCTTCTTGTCCATCCCATTGTCTAATGTACGGA ATCCCGTAGGATCTTGTGGTGCTGTGGGGACCTTTATGGGAAACTCATTC AACATTGCTCTCAACAAAATAGTCTAAAGGGTCTTATTCCGGACAGTTAA GAGGTCAATCACTAGGGGGGACTTACTTCACATTCTTAGAATAAAGAAAA TCTAGTGTACTTTTACTGGTGTTACAGGGTACCCAATCGGCTTMCAAAGA 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