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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1117 | supercontig | LSalAtl2s1117:84476..96586 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000733 >EMLSAP00000000733 ID=EMLSAP00000000733|Name=EMLSAP00000000733|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=678bp
MKIKNRECDSLLEISNSLYNTRSGNSACGGSDSNNSVHNAQIEIIPCKVC GDKSSGVHYGVITCEGCKGFFRRSQSSVVNYQCPRQKNCIVDRVNRNRCQ FCRLQKCLALGMSRDGGGALXPSGRSSHNGNSPDSSCFDTQQQPSSTDMS YEGGGATSGFSYGSDLSPYNGGYTFTNIPPPPHPPPPPPQQQHPQPGSEW TDYGNVXSTTSPFXSRSTPLDIPNPNNTNSSNSNNNNNNNNSSNSGGIHG APGPPESRIPSTSTASTSSSSSSSSSSSTSTSTTTTSSSGSASRHNNNNT STAAIPKAESPSTLVAVPGMKHPSQTSYGSSNRIGMTIKQEVTDMISGQT HLEGREEEDPLSMGYDVDSTSNFATHQPSKSHHHLQPPPHPPSLHPSHHQ PNHPSHHHPHPAXQQXQPPVHTQXXQPQAQQHPGHHHHPSGSFSSGMHNN HELYLLQEELQNDRIGVLLTNSIFEAHTRTSLLTRSQIHEQCKQGVDQVK LYTFKNMSQEELWLCAAQKLTNVIQQIIEFAKMVPGFMKFPQDDQITLLK GGAFELAVIRMSRYFDLSQNAVLFFDIMLPMESFMTTGDTGEMNLVNQIF DLAKAVFQTLQRELTNRPPMVPTKGDVSVLTKLLNKRHTLREINFLHTEA LTRFRSGNGSMIEFPALYRELFSSDHPS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1117:84476..96586+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000733-696580 ID=EMLSAT00000000733-696580|Name=EMLSAT00000000733|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12111bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1117:84476..96586+ (Lepeophtheirus salmonis) AATGAACAGAAACGAACGACATAATATGTAATATTTCCGCTCCTAAGGTA
CGCACGGTACTTTACCTCCATTTCATCATCATAGCACCGTCTCCTATACA
TACACAGGAGGCAGTAAGTTTTTCCATTTTTTCTTTCTTCATACTCGGAT
GACAATGATGATGCCTTTTGCTTGCTATTGCGTGGATCAGTCACGTGTCC
ACTAATTTCACATTCAGACGTATGTTACATACTCCCTGCTATGTAAAGCA
GCTCCAGCCAGCTGAATACCATCATCACAGAGATTCCATATTTCTAAAAT
ACCAAAATTTGTGCGTGTTTGTGTATGTGTGTGAGATCAAATCCCTGGTG
CTCTGAGATTGGTTACAATGAAAATTAAAAATCGTGAATGTGACTCCCTT
CTCGAAATAAGTAATTCTCTGTACAATACCAGGAGTGGAAATAGTGCTTG
CGGTGGCTCAGACTCTAACAACTCTGTTCATAATGGTAGGATTCTTTTTT
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AAGTTGTAAAATAAACTTTCACTCTAGAAGAAACAACTTTCATGATGATA
CCTTGTGTCTATATTTCTTTGCTCTGTACTAATCCATATCTCTTTTTCAG
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TTTTCTTCCCATCGGAGAGTTTACTTTGTGAATGCAGTTAATGGAGGTTT
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CTGGTATATCATTTTTGAATGAGAAAATATATTACTGATATAAAGGGAAG
ACCCTCTAAATATTAGCAATTGAGAGGGAAAATATGTATAATATATATTT
TAATACTGCATTTTTTTAAATACACCAAGTAGATAGGAATTCATCATTTA
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TTATTTTCATTTACTTTTTTAACGAGTAGTATTCAAGCATATTCGACACT
CCTACTCGACACAAAAAGTAGTCACATATAGCCAACTATATTTTGACAAT
TACTGTTCAAGTGGTCTTTGTTTCACTACTTGCTGACTAACTTTATTTTG
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CTCAAGACATTTTCTATTGATTTGCCTCACTCAGTCTCTGCCTTGCTTTC
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GACCTACTGACTGAATTACATTGTATGTGTATATGTAATGTTTTCTGTGC
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TTTTTTTTAAATAAAGAAAGAAGAGAAAAGAAACGAAAAGTCATAAAATA
TGTTATAATATTATACACATATATATATTTAATATAGTTCACTATTTTTT
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TATATAATGATTAATGCCCCAGAGTGACAAAGTTTTACTTGAGGGCCCTG
CTATGGCATGGTTTTATATCAGCTGTTGCTGAGGAAATTTATGCTAATTG
TGTGGCTTTTTGTAATTGTCTAATTTATATATTATATATGTATAAAATAA
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GTCACAATCCATGTATGTAAGTCTATGACAGAGTTGAAGGAACTTTTTTT
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GAAACAAAGGGAGAAGGTTGAGGATGAAGTTCGCTACCACAAGGAAATGA
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TCTCATAATGGTAACTCTCCAGATTCTTCCTGTTTTGATACACAACAACA
GCCCTCTTCGACAGACATGTCCTATGAAGGAGGTGGCGCCACCTCTGGGT
ATGTATACAACCTTGTTGTTTATTTGAGTGAATGATTAATATTAATACAT
TTATGATTATAGATTTTCCTACGGATCGGATCTGTCCCCCTATAATGGAG
GCTATACTTTTACAAACATCCCTCCACCTCCCCATCCTCCACCTCCTCCG
CCACAACAACAACATCCTCAACCTGGTAGTGAATGGACAGACTATGGGAA
TGTGGMCTCGACCACGAGTCCCTTCGMCTCCCGCTCCACTCCCCTAGACA
TACCAAATCCTAATAATACGAACAGTTCTAATAGTAATAATAATAACAAC
AACAATAATTCAAGTAACAGTGGAGGGATCCATGGAGCACCGGGGCCGCC
AGAGAGCCGGATACCTTCAACCAGTACTGCATCAACCTCGTCATCCTCAT
CCAGTTCATCATCCTCCTCCACTTCCACTTCTACGACCACAACTTCATCA
TCGGGGAGTGCGAGTAGACACAATAATAATAATACAAGCACGGCCGCCAT
ACCCAAAGCAGAGTCTCCTTCTACCCTCGTCGCAGTACCAGGTAAATTTC
TTTCATATAACTACTCTTTTGACGATGTATGTATATTCATAATAATCAAA
CCTGGGGCTGTATGCGTACAGCACATTACGTATGTACAAGTATGTACCGG
GTGGAAACTATAAACTTACACACTTGGAAAGCAAAAGAAAATAGCCTCCC
ATTCTTCAATTATGCACTTAAATCAAATCTTTATTCATCTTTTTCTGATA
CATAGCAATGGCAAATTGATTTATTATATTTGACCCCCATTGGCCTCACA
GATGGCAAATACTCTCTTGCAAAAAAGTTACAATCAGCCCACTCCTCGTC
GACGGAGGCCTTCATGGCTTCAACGGATGATACAGGCCCTCCTGTCAATG
TGCCACCAGAATGAAAAGTAAAGGGGATTGACGTCTAGACTGTATGGTGG
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GGGTCCTTCATCTACCTAATAGACGATGTTGCCATCGGGAAAATTTGCCT
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GCAAGCCTGTAACCCTCCAATAATTAGTTAAGAGGGCCACAATACCTTGC
GCCTTAGTGCTAGGCTTCCTTTTTATCGTATCGTTTGTGTATCGCTTCCC
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CTGTTGGAGTGGTACACGCACGAAGAAGAGTTAATGCCTTGAATCTCACT
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GGRGATATATGGCTATCTATACAATTATAGAACGTTTTAATTTCTTCACA
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TCCCCTCTTTCGTTTTTGATACGAGATATATATATATATATGTATACATC
TCTTATAAAGTGTCTTTTTTTTTCTCTTTCTATGTAAATTTCTCAGGTGG
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TCTGAACATTTAGAATTTTAAACTTCCTCAAGACATAATTTATTAATCAA
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GAGCTCTCTTACTCATTAATTTAGCCACCTTAAGCGGCAATTATGGCTTN
CAGGAGGCGGGGGRAGGCCYGCCGTCCGKTGCAGATGTAGTCATATGTCA
TGGTGTCCCAGTGCTGACTGACTGTGGCTTTGAGGGCATCGGTGTTTAGA
TGACGGATACTGCATGTCTTCCCTGGACATGTATTCACAAGTTGTAGTCC
AGGGGTTGGCATGAGGGCTTTAGGGGGACCAAAACTATCAAAGAAAGTGT
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GGGGCCTCTCCAACCTCAAAAGGCTCTTTCCACCTACTTTTTTATAGCTC
TCTGGATAGTTTGGTGTGAAATCCCAAGGTATCTTATATGGGCCCTCATG
TTCTTGAGGAGATTGGCTTGGGRTGTTTTYTTTWACTCATCCGGATCCAG
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GCTCAAGTTTGTTTTGTTTCGTAAACAATTGTACATGCTTTAATATATCG
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TTTCAATGGACCACCCCGCAGCACAAAATATTTCATAGACTTATTTCACA
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CGTCACATATTGAGTTATTCAGACTCAATATAGAGAAATCCCATTCTAAT
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ATAGAGGGTCTAGCTTCTTCCTTACCTTTACTTAAATATATTTTTAGCCC
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CTCATATGGTAGTAGTAATCGTATTGGTATGACGATCAAACAAGAGGTAA
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CTCTTCATCCTTCACATCATCAGCCAAATCATCCATCTCATCACCATCCT
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TTATTAATTTCCAGGAGCATTTGAATTAGCGGTGATAAGAATGAGTCGTT
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GCACGGGGTGGACTGTAGTTTCCTTCAAAATAAGAAAATCCTTAAAAAAA
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TTTTTTCAAAAAATTAAAAAATTGACATTAAATTGTTTTATCTATAAATT
GCTATGGATTCTTAAATTTTTCTCCGAAAAATTTTATTCTGAATTATTTT
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AAGATTTAATTTCTTGAGAATAACTATGGACTTTTTAAATATTTCTCCAA
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AATTTTTGATTTTTTTTTCCAAAAAATTTAATATTTGAAATATAATTTTT
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AATATTTTGAAACTTTTTTTCAAAAATTTATATTTAAAAAATATATATAT
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AGACATACGCTAAGGTCATAATCAATTATTAATTATTCATATTCATTTTG
TAACTCGTGATTCTTTTTTTAGGGAAATCAACTTTCTTCATACAGAGGCC
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ATATCGTGAATTATTTTCGTCCGATCACCCGTCTTAAAACAAAAAACATA
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AAAACGAATGAAATTATAATTCCTCCTTCCAAAACAAAACACTATTAACA
CAAATCTTTTATTATATTACGTACACATGAACATTGTCGTCATTTCGTCT
TGTTACCTTACTTATTTTGTGTTGAAGTCGCGAATCTCTTAAAATCCCTT
TTATAATTATTAACTTATTTTTTTAAGAGAATTATTTTTCAAACTTACTT
TATTTGTGGAAGAGTGAGTGATGCTAGGATCGTCTCGATGATATCTCGGC
TTTCGGTACGTTACTGCTCTTTTTCTTAGAAGTGTCCGTAGGGGGGTGGG
CCTGAGGGGCTCAGGATGAAAAAATATTACGCAAAAATAGGGGTAATTTT
GTTTTCTTAAAAATAGGCATTCGTGCAAATTATGCAACAAAGCAAAAAAA
AAAAATATTTATAACTATTTCCTAAAAATAGCTATGAATTTTTAATTTTT
TTTTTACAAAAATGTAATATTTGAAATTTTATTCAAAAAAACTTTTTTTT
GAACAGCAGTGCTGTATAATTATTTTTCCAAGAGACTAAATTCTTCGAGT
TAAAATTTTTGGGAAGAGATTAAATTTTATAAAATAACTTTTTTGATTAT
AAAATTAATTAAATTTGTTTCTTTTAAATTGAAGAATGGGATTTTTTTAA
ATTAGGATAATTATTGCTGTCTCGGTCCTTATTTACTCGGTCCGGCTCAG
KATTATCACGGGTCTCTCGGACTGTCTATACTAGAACAGATTTAAAAAAA
AGGTTGAGTGACGGAAATTTATAAGTCTTAGGACTGATATGCAGCACTGA
ACTGCGCCGGACCCCTGGAGTCTTAAATAAAAACCAACACAACAATAGTC
ATATCCATCAATATTTTGCAAAGSGGGGGGGGGGGGGTAATTACCCCTAT
GCTTCCGACGCCACTCTTGTATCACTTTCATAATACATCAGGATTTTACT
AATAACATCAACTCTTTTATTTCAGACTGCAATGAAGAAGATTTTTTTTG
TAGAAGGCGCTTGATATATTATAAAAAAAAAAGAAGTAGACATTTTGACA
GAAATATTTTTTAAATTATATTATTATCCAAAAACTTTTATTATTATCAG
TGAGAGTGATTTTTTTTTATAAAACAACAAATATAAGTGTTTCTTGTGAT
TGATGACTACGAACGATTATTACTTCAACTACGAACCAATAAGAATGAAA
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CTACATACAAAAGGACGAGAAAAGTAAAACTGAAGAACTTATGAGAAAAG
ATTATTATTGATGTTTACAATATTATTATATTAATATAATTACTATTTTT
ATCATTGTTATAAATATGTTTCAATTAAAATAAGTGTTTTAATTCATTAT
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