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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000008900 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000008900 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s554:518802:535376:1 gene:EMLSAG00000008900 transcript:EMLSAT00000008900 description:"augustus_masked-LSalAtl2s554-processed-gene-5.0") HSP 1 Score: 352.443 bits (903), Expect = 7.898e-125 Identity = 181/181 (100.00%), Postives = 181/181 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MEAKSLPKRGGVVIEEDIDHSSINPLPLETPPVLLXPTXPSSSTAPASSNSASAHQILFIPQFSSIGGGLVEEGXDKRPSCSSSQSVAVSTAATIISLIQSSDGSLLPESLNPTSIDKEISSVVIAASTTTTATKRSFSQHIMEEEEEDEDEEEAGGHLSWNPDEEQDQSAEEDGKIMRHY 181
MEAKSLPKRGGVVIEEDIDHSSINPLPLETPPVLLXPTXPSSSTAPASSNSASAHQILFIPQFSSIGGGLVEEGXDKRPSCSSSQSVAVSTAATIISLIQSSDGSLLPESLNPTSIDKEISSVVIAASTTTTATKRSFSQHIMEEEEEDEDEEEAGGHLSWNPDEEQDQSAEEDGKIMRHY
Sbjct: 1 MEAKSLPKRGGVVIEEDIDHSSINPLPLETPPVLLXPTXPSSSTAPASSNSASAHQILFIPQFSSIGGGLVEEGXDKRPSCSSSQSVAVSTAATIISLIQSSDGSLLPESLNPTSIDKEISSVVIAASTTTTATKRSFSQHIMEEEEEDEDEEEAGGHLSWNPDEEQDQSAEEDGKIMRHY 181
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000008900 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000008900 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000008900 | 7.898e-125 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s554:51880... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s554 | supercontig | LSalAtl2s554:518802..535376 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | augustus_masked-LSalAtl2s554-processed-gene-5.0 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s554:518802..535376+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000008900-691666 ID=EMLSAG00000008900-691666|Name=EMLSAG00000008900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=16575bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s554:518802..535376+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAGGCGAAATCACTGCCAAAGAGAGGAGGAGTCGTGATCGAGGAGGA
CATCGATCATTCTTCGATCAATCCCTTGCCTTTAGAGACTCCTCCTGTCC
TTCTCTTKCCCACGCAKCCTTCATCATCCACTGCGCCCGCTTCGAGCAAC
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CGGAGGACTCGTAGAGGAGGGSGYAGATAAGAGACCCTCCTGCTCATCTT
CTCAATCTGTTGCTGTATCCACAGCCGCCACTATCATATCTCTCATTCAA
AGTTCGGACGGATCCCTCCTTCCGGAATCACTCAACCCTACCAGTATTGG
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GGAATAAATCCTAAATCACTCAAATCCAATGATGCAATGTTTATGAAAAT
AAATAATATATTACAAAAAAATAAAATTTCTACACAGCGTTTCATAAGAA
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TTACAGAAAACCATAACCGTAGAAAATTAAATTTCAAATTTTCTAGAAAA
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ATGTACAAATCTACTATAGTTGTCCCTGACCTCTTTTTGTGAATATATCG
TCGTCATGATGATGATCATCATCATCATCAGATTCAACTCTATCGTCATT
CGATGTATGTTCACTTAATATACTCTTATTATTTCGTCACTCTTTCACAA
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CCTAGCGAGTATGCAAGCAGGTTTTTCTCTTTCATCTCTCTTTTTATGTT
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ATCAAATTTAGTACATTAGTATTACTCAAGGCCTTCCACCTCAAAGAAAC
AATATGTATCTATATGAGTTCCTAGTTCCTCAACTTCCAACGTCATCCTT
TGTTTAGTATTCACCAACATCCGTATCAAACACTAAAGAACTTGATTCTG
TGCCATGAATTGGTTATTAATATCCCCTTGGATTCGTTTGTATGTATTTG
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GTATTGTGTGAGTCCTTATTTATTTGCTTCATTAGAGTCTTAGGACAGGT
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GGACTAGATGGGCATCCTGTCCTAAATATGGACTGGCATAACAATATGTA
TGACAATTTCTTAGGAACGGTCTTATCAGTCCTTGGGATCGGTCTCTATG
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AAGAAACAAATTTTAGTGATGTTATCAAGGACCTAACTATTTAAGATATA
AAGACTAAACTGAACCGACTTACAGTCCTCAAAAAAGGAACGATACAACA
CTATGTATGACTTTGTTTATGAGAAAGAAATTTCGGTCCATGGTCTCTAT
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TCTCAGGCCATGTCTCAAAACTTGCGTCTACATAAAATTCCCTTGTTCAA
AAAAATTAAATGCTTCCTTGTCCATCAGATTTTTTTTTATTGAAAGAGTA
AAGCCCGGAAATTTTCCTACTAATCAGATATGAAGGGATATTAATCGTAA
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CTTGCAATTTGAATTCAATCTTGACATATTTTAATTACCTTTTAACAGTC
ATGAATGGGATTGACGTAGGAAGGGCGCTTTTAAGGTGTTTTGGACACTT
ACGCCTCCCCTTAAAAAATTTGTTATAAGATGAAAGTGTTTGTAGAAAAA
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TCTTTTTTTTTTCTTTTTTTGACACCATATAGAAGTGACTAAATGTGATG
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AATATAAGTACCTTAAATCAAATAAAGGCTCTAAACTATAGCTAAAATTG
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TCATTAATTTTAGTTCATGATTGTTTTTATTTTGATTTCTAATCCCCTGA
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ATCAAAGAAATTCATTTTATTAATCTTTGAAAGAGTTGAAAAATTGCTCC
TTCTGTGGCTTGGAGGAGAAAAAATCCTTCATTTATTTAACGAATGTCCG
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AAAAACTTTATCAAAATCTAACATATAATTTCAAAAGTCCATGATTTCTA
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GTTCTAGGACTGATCCAACACACATAATATTGATATAAGGAATAATAATT
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AATGTCCTAAATAAGAATCGACTCAACACTACAACATATTTTAAAATCAT
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ATACATACATACATGGATGATATTTCTGTATGTAATGTTTGTGTAGGTAC
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AGTTGGAAAGAAATAACCTCCAACTTTCACTGAGTATATGTTTCCACACG
GAGTACGCACCAGGTGATGATGCGTATACCTCTTTTTTTTTTTTCATTAT
GTTCGTGAGTAAATCAGAAACGTTATAACTTATTACTAAGAACTTGTATT
GTTTGATAGAGGGAAAAATATTGAATATTTCCTTAGTGTGTGTTGCTGGT
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AAAAAAAAGTTCAAAACTTAAATTTCTAAATAAGACTTTTTGTAAAAAAA
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ATTAAACGTACCATCACTAAAAATATATTTATAAAAAAGTTGTTAATGGG
TTTTGTTCTTTTTTTACGGCCCTTCTTAAGGATGGAAAAGACAAAAGTAA
CCTACTTGAAGTTGTTTCTTCTTTCTATAAATAAACTCTCCCAACTTTCA
CCTTGTTTATTTTATATTTATGTCCCCATTTTCTAGATACATATATCCAT
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CGGAATAATAATATTTCATATACGATTCTGATTTATTTTTAGTGGTATTT
TACTATATATTACTTTTCCAAGTTGTGAAAAAATAATAACCTCTCAAATT
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GAAAATATTATTAATATTTTTTAATTTCAAAAAAACAACAACAAAGACCA
GCGGGAATTCTTCCCTCAAATATTGATGTTACTACCACGACGATCTGTTT
AAGAATGAACAAAAAAGGAAAAAAAAGAGGACACGCCCCCAACTTTTTTT
CTTTTCTAATCCTAAAACTTTTTTTTTTTCTACGAAAAATCACATTTCCA
ATTATGGTATAAGTAGTGTTGTAAATCGTGTGTAATTTTAGCTGGCCCGT
TATTTCTAGAATTAGTAATCAGAAGAATGAATTTTCTTTTCCTTAGCAGT
TGTCATTATTATTTATTTCTACGAATTGAATTATATTCAAAACCTGGTAA
CCTTCGTGTGTGTTCATGAATGAGGGAGAGTAATCTTGAGGATTTATTGC
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ATATTGGAGAAGTTTTTCCTATTGTTCTTATCCTTTTTTCCCCCCTTCTC
CCTTCTAACAGTTGATTGTAGCTGCTCTCCTCGTAAACATTATTTAAATT
GTCGTGGTTACAATGTTGATTTTAGTCTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTT
AAATCCCAAAATTAGTATAATTAAGTATAGGTCTGTGCGTTATGAAAGCT
GTTAATCTGTAATTATTTATATCTGCCATCCAAATCCGCACATAATAATA
TGCGGCGTCTCATTCAGGCCCCTGGTTAATGAAGCAGTTTTGAAAAAAAT
ACGTTTGTATAATATACATATGTATTTAAATAGGTTGAAACCCCTTGCTT
TCAGTGTTACAGCAACAAATTGTAAATATATTAAGGATTTCTTTTTTTTA
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AACGATTTATTTTTTAACGCGAATATTTTTAACCTAATTATATATTAATA
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ATCTGCGATTGAAAGTATTCAAATTTATCATCAAAATAACTGTTGAATTA
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GAAATATAGTGCTTCACGAAGCATGATTGAATCTTAAAAAAATTACTGTT
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AATTGATGTTTTTTGCTCCAATTGCAAGGTAAGGACTTGGCTAACATGTG
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TATTGCAATGCAAATTTGTTGAATTCCTTATTTCGATAAATGAATCAGTT
CATTTGCCGCCTCGATTATGCCATTTCACGCCTTTAGATTATTTTTTTGT
GGGTCACGTGAAGTCATTGGTCTACACCAATAAACAAGTGACGTTAGAAG
AGGTAAGAGAAAATATCCAAAGTGAAATTCCTAAAATTTCAGTCAATTTA
TTGGAAAAGTAGTGGAGATTTGGTACAGCGATTGGACTTCAGCAGTAAAT
GTGCTCGTGATGGTCAAGCTAGATAAATTAATTTTTATTCAGAAATGTAT
ATGCTTATAATTTMMTACTNCGATTGGACTTCAGCAGTAAATGTGCTCGT
GATGGTCAAGCTAGATAAATTAATTTTTATTCAGAAATGTATATGCTTAT
AATTTGTACTCAAAAAAAAAAAAAAATTTGGCAAAATCTTTAACCGTTTG
AGTTTAATTTATATAAAAAAATTGAGGTACTCTTAATGAACCCTCCCCTT
TACAATGCCTAATCTAAAAGAAAACATTATTTTCTCATACCGAATATAAT
ATTCATTAGATTCTCAAACTTATTTTTGTAGTCTGTTGGTACACATGTAC
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CTTCTCAGAATCGTTCATTTCAGCGACATTTTCATATAGTAAAGCAGAAG
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GTTGAATATTTATTCATTTAAGCCCAGAACTAAATACATATAGTTTTGAG
CAAAGTCACAAACGGCTCAATAATCCAAGGTTTACTATAATGACATTCAA
CAATAGAAACGATAGGACATCCTTTTTTAAGGTTCCTACTCCACAAGTAT
CAATCGATCAAATTAATGGAATGCAATCCCATTTAATCAGTTTTGCTAAC
TTAGCCTTCCACAGAATCCTGCAGAGTAGAGACGAAATCCGAGAAGTTTT
GAGCTAAAAATGCTAGATTTGTTCCATTTGATTTTAATGAACGTTCTGGT
GAGTGATGACGTTCAAAAAATGACGCCATTATTCTTGTATTGTTAACAAT
AGGAAAATGTTGCTGGAATGAATGACGTTGAAAAAGGCGGACCCAAATAA
ATAATTGATCAAATAAATGCAGTTGAGATAAAACTTGCAGAAATTAACAT
TGCTCAAATAAATGCACACGGTCCACAACAACGTTTGGAGTCTAAGTTTG
TTTTTGACAGATGAATGGATTTGACGTCTTTTAATGATCTCCACGATTTT
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GTGACAATTTTGAAAGATTGTTAATTATACTAAAATAGCTATTATTTACA
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AAAAAAAAAATTATACAAGTGAGAAATTGGAAAAAATGACCCCATTTCTT
TTAAGCGGATAAATATAAGCAGGTTACAAGGAAGGCCTATATATCAAAAC
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ATCCTTTAATACAGGTCGCTTGTGGTCAACACATCATTTGGCTTGTAATA
AAATAAGGCCCCACGTATTATTTCTTGATGTATTCAATATTTATATGTAC
ATATATTTTTTATTTAACATGTACAAAATCTGTCAAATGAGTTTGTAATG
TTCTGACCTACTTTGTTCCTGGATACAAACTNNTTTAATAGATAGCAGTG
GTAATTGAAGGTTAGTTACTTCTTTACTGTTATTCTTCTGAATTTAAAAC
TGTCAGTCCTTGAAATATTCAACAAAAATGTTGTTGGTTTATTAAGGCAA
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TTTTTTTTTTTCACAATAATATAAATATTTTACATTTTTACTTAAGTATA
CCAGATGCAGCAAAAAAATCTTTACACTTTAAATCTAGAACTTTATGTAT
TTCACAGACCAGTTGTATTAGGTTATGTCAATGAAATAAAAATAACTAAT
ATGATGGCTTGGCTATACCAATCATCGGTGTAGCCCACTCTTGCCGGCAA
TGATGGTTTCCAGCCGGCCACGAAAGGTCTTGCACCCATTATAGATGTAG
TCCTCAGACATGACATCCCAGTGATGGTTGACGATTTTGGTTGTTGATAT
TTGTATGGCGAACAGTGCAGGCCTTGGAATCAACATGCACCAAAAATGTG
AAGTCCAATGGGTTGGTATCTGGTGAGTAGTGGCCACATTTTCTTTGGCC
AGAAAGGCAAATTGTCCTCCAACCACCTCTGGGCCTTTTTGGACGTGTGT
GCAGGCACAACATTCTGCTGGAACACCACGTTTATGTACGGGCTCATGTT
GGAGATCCTCCAATTACTTAGGAATCTCCGTTGGTTTCTAGTCAACGTCC
AAAAGTGCAGGCACAAAATTCATTGGTCACGTTCAGATAGCATTTTCTCG
GCTTCCAGAACACATAGGAAGATCTAGTTTATTTTCAGTATTTGACTGGA
ACAATTTTACGGTATTAACAAAAACATTGACAAAAATAGCAAAAACGAAA
TGCAAATATTTTTTCGCCAAACCCGATATAATTTATTCTATTTTATAACG
GAATAATTTAAAAAAGTTGGAAAAACACCCTTAAATTACGTCACAAGGGA
TCGATGTTTCCTTTTTAAGAAGCAACAAGTGAGACTGGAGTAGACCGTGG
TCCTGGGTTCTAAAAAAGAACCAAACAACACTAATTATGACATATTAAAT
AATCAGCAAAAAGAAGAAAGAGAACAAGCAACATCCATTTTCATCTTCTT
TTTTTATGTTTTTAAACTATAATTTTTCATTACAAAGATGACATCCTTAG
TTAAAACCTACGACAAGTTTTTTAGAATTGTTCTATTTTTTCCCTGCCAT
TTTTTATTTATTTATTTTTTGACATTGTATAGGCAATACCAATATTTTCA
TAATAGCTCATTTTGGATAATACTATTTATTACTCTGCACAGCCGGAATT
AGAAACTTTTTTCTACTTTGAATACAATCATCACTAAAAGGATTTTGAAT
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CTTATAATCTCTCTTCCATGTACGGTACCTCTAGGTATGTTGTAAAGGTC
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TTAATATGTATATATATACATTGTATAAGGCAATAATGATTCCTTTATCT
CTTTACAACTTTCACCACGAAAAGAAAGAATGAAATCTAAAAAAGAAAAA
AAAAAATTAATCCTTCTGCATCTATATGTACACTAGGGTGGTTTGTTTTT
CAACTTTTTTTTAAATTTCAATTACAACTAGTACGGAAAAGTTTTGAAGT
GGTAAGAAAAATGCCTATGCAAAATGTCCTTTTCCCATGAGGTCATCTTT
AAGTAGTACATTTAGTTATAAGTTTGAAAGGAGACAAAAGATTTCGTTAA
TACAGATTAAAATACAATATTTATCATTAGTTTGCCTTTATTAATTATTA
TAGAGATTATTCGAACCGACATATATCATTAGTAAAGTTTTTTTTCTAAA
GTAGATACCCAATAGAGCCAAAAAGATTAAAGAACAAGAGAAATTTGGAT
TCTTTCCTTGTAAATGTAAAAATATAATGATGCACGATATATGCGGATCA
TTCATTATATTTTACTATATTGTTATTTTTTCTAGTAGTCATTTTTAGAT
TTTTAGAAAAGAAACTTTATAAATACTTTTTATAGGTTAAAAAAATGTCT
ATCAAAATGATATTCTATAAAATAACTAAAAAGGTCTTACTTATATCCAT
ATTCACTAAGAAAAGAGTATGATCGAGATGTGTGAACTTAAGATGGCCTC
GTAGGACAATGCAATTTTGCATTGCTTGCTCTTATATCAAATAACAACTT
TTCCGCACAAGAAGTAATCGAAATTGAAAAAAAAAATGGAAAATCAAACC
ACTCTAAAATATATGTACAATTTATTTATATAGTATTTTTTAAAGCAATT
CTATTTTTTCCCCTCTCTTTTTCCATARATATTTGCACCAATTTCCCTTC
CYCGCCYCCGMAAGCSCCTTCATCANCGACAACAMCATCCATACTAACCT
CATCTACAAATAAAAAACCTCGTTCCCTCAAAATCGTCGAATGTCTCGMC
TCTYCCYCGACGMCACACMCCMCAGCCTCTCCATCGTCGCCATCAACCTC
TTCATGGAATCTCATTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTCGCATCCTTCCGTAGAATCACCTTC
ATCGTCTTCGAGTCCTTCTCATCAAGGAGGGGGAGGKAAGAGAAAGACCA
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