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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s554 | supercontig | LSalAtl2s554:518802..535376 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008900 >EMLSAP00000008900 ID=EMLSAP00000008900|Name=EMLSAP00000008900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=181bp
MEAKSLPKRGGVVIEEDIDHSSINPLPLETPPVLLXPTXPSSSTAPASSN SASAHQILFIPQFSSIGGGLVEEGXDKRPSCSSSQSVAVSTAATIISLIQ SSDGSLLPESLNPTSIDKEISSVVIAASTTTTATKRSFSQHIMEEEEEDE DEEEAGGHLSWNPDEEQDQSAEEDGKIMRHY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s554:518802..535376+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008900-704747 ID=EMLSAT00000008900-704747|Name=EMLSAT00000008900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16575bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s554:518802..535376+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAGGCGAAATCACTGCCAAAGAGAGGAGGAGTCGTGATCGAGGAGGA
CATCGATCATTCTTCGATCAATCCCTTGCCTTTAGAGACTCCTCCTGTCC
TTCTCTTKCCCACGCAKCCTTCATCATCCACTGCGCCCGCTTCGAGCAAC
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ATGTACAAATCTACTATAGTTGTCCCTGACCTCTTTTTGTGAATATATCG
TCGTCATGATGATGATCATCATCATCATCAGATTCAACTCTATCGTCATT
CGATGTATGTTCACTTAATATACTCTTATTATTTCGTCACTCTTTCACAA
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TACACATCTATGTAATAGCTAACATAAGTAGTAGGGTATTAATAGTGGTA
TGCAGTAGGTATTGTAGAGCGAAAAATCATGATGACGTCAGTCCTCTGAA
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AAAGGAAAACTTCTTTCTCTCTTTAATTCTTCCTTCCTTAGTAACATTCT
CCTAGCGAGTATGCAAGCAGGTTTTTCTCTTTCATCTCTCTTTTTATGTT
TTTAATTCTTTGATACACGAATGATACATACCAAATGGATACCAAATAAC
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TGTTTAGTATTCACCAACATCCGTATCAAACACTAAAGAACTTGATTCTG
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GTATTGTGTGAGTCCTTATTTATTTGCTTCATTAGAGTCTTAGGACAGGT
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ATAAAGTTTACAGATACCATAATGGACCTAACTTTATAAGTTTTAGGACT
GGACTAGATGGGCATCCTGTCCTAAATATGGACTGGCATAACAATATGTA
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AAGAAACAAATTTTAGTGATGTTATCAAGGACCTAACTATTTAAGATATA
AAGACTAAACTGAACCGACTTACAGTCCTCAAAAAAGGAACGATACAACA
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TCTCAGGCCATGTCTCAAAACTTGCGTCTACATAAAATTCCCTTGTTCAA
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AAGCCCGGAAATTTTCCTACTAATCAGATATGAAGGGATATTAATCGTAA
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CTTGCAATTTGAATTCAATCTTGACATATTTTAATTACCTTTTAACAGTC
ATGAATGGGATTGACGTAGGAAGGGCGCTTTTAAGGTGTTTTGGACACTT
ACGCCTCCCCTTAAAAAATTTGTTATAAGATGAAAGTGTTTGTAGAAAAA
CCCTGCATGAGTAATTTCTTTTATTTATAAAAGAGACGTCAGCTAAAAGG
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TGGTTAGCCCCAACGAATGCTTTTTGCATGACGATGATTACGCTCAATGA
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TCTTTTTTTTTTCTTTTTTTGACACCATATAGAAGTGACTAAATGTGATG
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TTCTTCGTCGAATATTCGTCAATTTCTATCAATAAATTATCGTTATCCTT
TAAGTGTGCCGAAGATGCCATTTTCGTATAGACAAATTTGATTCTGACAA
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AATATAAGTACCTTAAATCAAATAAAGGCTCTAAACTATAGCTAAAATTG
TTGGGTATTCCGAAAATTAGAATAAAAGATATATAATAGACTCAAATGTG
TTTATGAAATATTATACATTATGTGTTGTATGAAATAAAAAAAAAATCTT
TCATTAATTTTAGTTCATGATTGTTTTTATTTTGATTTCTAATCCCCTGA
AACAATATTGGCGTGTTGGCTATTTATTCGGTCCTCAGAACTGTTACAAA
ATCAAAGAAATTCATTTTATTAATCTTTGAAAGAGTTGAAAAATTGCTCC
TTCTGTGGCTTGGAGGAGAAAAAATCCTTCATTTATTTAACGAATGTCCG
AAAGAAAAACACGTGGTAAGCATGACTATCGGGTTTTTAAATGCTTTGTT
TAAACCATCAATCCAAGACTGATTGGTTGGTGATGACATCCCCTTCCCAT
AAAAACTTTATCAAAATCTAACATATAATTTCAAAAGTCCATGATTTCTA
CAGGCCTCGATTTATTGGGCGAAATACTACTACAACTTTTGGAGGTATCG
GTTCTAGGACTGATCCAACACACATAATATTGATATAAGGAATAATAATT
TGTAAGTTTTTAGGACTGAACTGGACGGGACCGGACCGAGACAGGAGTCT
AATGTCCTAAATAAGAATCGACTCAACACTACAACATATTTTAAAATCAT
TATCCAGTATCCCTTTGCCTTCTCCACCTCCTTGAAAGAGAACAAACATC
TTTGTCAACTGCCTTGTTTTATGATATATTCTAGATAGGTATATCGAGCC
TAGTTAATAATTATAACTACATAATTCTTTCACGCCCAAAGAGAAGAGAA
ATACATACATACATGGATGATATTTCTGTATGTAATGTTTGTGTAGGTAC
TAGAGAGGCAAATATACATATATATATATATATATATGTATATGTTACAT
AGTTGGAAAGAAATAACCTCCAACTTTCACTGAGTATATGTTTCCACACG
GAGTACGCACCAGGTGATGATGCGTATACCTCTTTTTTTTTTTTCATTAT
GTTCGTGAGTAAATCAGAAACGTTATAACTTATTACTAAGAACTTGTATT
GTTTGATAGAGGGAAAAATATTGAATATTTCCTTAGTGTGTGTTGCTGGT
TAAAATTTTGAACAAATGATTCAAAATATTATGTAGATGGTGCAATTACA
AAATAAAAAAACAATGCGGATCTTGATGCAATTTTAGTAAAAAAATTGCC
CATGACGATTTTTATTCTTTAATATTTTAAATAATAGTTTTTTAAAAAAA
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TATTTAACAAGTTACAATCTCTTCACAAAAAATTATATATATATATATTT
TTTTAATCCACATTTGTTCACAAAAAAATTCAAAAATAACCAGCTGTTCA
AAAAAAAAGTTCAAAACTTAAATTTCTAAATAAGACTTTTTGTAAAAAAA
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ACAGAAAATTACATTCTCTGTAAAAAAAAAATTGAAAAATTTAATAAATT
TCAAATATTAAATTTTTTAGTAATAAGTATATATTTCTTTATTTTTTTTG
GGGGGGGGGTATTTTTTTTAATAACTCAAAAAACTAATAAGTAGTTAAAT
ATCAGCAAATACTACTAATTTTATTTCCGGAAAAAACACCCAATTCTCCG
ATTAAACGTACCATCACTAAAAATATATTTATAAAAAAGTTGTTAATGGG
TTTTGTTCTTTTTTTACGGCCCTTCTTAAGGATGGAAAAGACAAAAGTAA
CCTACTTGAAGTTGTTTCTTCTTTCTATAAATAAACTCTCCCAACTTTCA
CCTTGTTTATTTTATATTTATGTCCCCATTTTCTAGATACATATATCCAT
AGTAGTGATGTGACGATTAATCGGAATAGGGGTTTTTCTGGAATCTGCAT
CGGAATAATAATATTTCATATACGATTCTGATTTATTTTTAGTGGTATTT
TACTATATATTACTTTTCCAAGTTGTGAAAAAATAATAACCTCTCAAATT
AAGGAAGTTTTGCTTTTGTCTAGAAAATTAAAAATTTTATATTGAATTTA
AAAAAAAATCAATATTTGATAAAAAAATCATTTTCTGTGAATAACTATGT
ATTTTATGACCAAGCATGCCCCCACAATAATTAATAATGTTTTGCAATGA
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GAATCAGTATAAGGATTTTTGTGTTTTTTGGAATCGTTCCATCACTAAAC
CATACTATGAGAACGTACTTTAATAGTATTCTTTTTGCATGAGGTAACAA
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AGCCACATATATACCTATTTATTATGCAACCAAATTAAATGCATAGGTGA
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CTGATTTGAAATTGAGAGTCATGATATGATGCTTTATGAATGTTTATAAA
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GAGTGTTCGATTAAAACTAAGATTTAAATCTACTTTATCAAGAACAAAAT
AAGGAGTGAGTACCTTTTTATTACAATAAATGTTGTGTCGGCCCTTATTT
TGGACGGAAAACTGCTGTCTAGTTCAGTCCTGCATATCAGTTTTAAAACT
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CAGTCCGAAGGACTGAAGGTTCTAAGGACCCGTATCAAGTACTGATATTA
CGGAACAAGGACTGATCAAATAAATTAGGACTCGAACCATTCTAATCATA
ATTATACCTTATAATATCAACAATATTTTCTCAAAATGTCCTGCTTCTGC
GGCCACCATGGCCTCAAATCTGAGCTTGAAGGTTTTGCATCCCTTGACGA
CTGAAACCTTCAGAGAATCAGCATAAGACTAAGGAAGCCTTGCTCTCAAC
GAAGCCCCATAGTCCAGTGGCGAGAAGTCTGGGGATGAGGGGGATGTAGG
TTTTCCTTACACCAATCTTGCATTGTTAAGGCCTTATAACCAGGGTCTGA
GTCTTTAAAACTGAGTTAAAATGGCATCTTAATATGTGATGGACTTGATT
AATTGGAAGAGGTGAATTGGTCTACTATTTGAAAACGAAGAAGAAAAAAA
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TATTTGTCACAATATCGTGATGGATATTATTTTTGGCACGAATTGAGGCA
ATTATTAGAGCTGAGGGCTCACATATTTAATTAAAGTTGTGCCGAGCACT
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GAAAATATTATTAATATTTTTTAATTTCAAAAAAACAACAACAAAGACCA
GCGGGAATTCTTCCCTCAAATATTGATGTTACTACCACGACGATCTGTTT
AAGAATGAACAAAAAAGGAAAAAAAAGAGGACACGCCCCCAACTTTTTTT
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CCTTCGTGTGTGTTCATGAATGAGGGAGAGTAATCTTGAGGATTTATTGC
GGAGTTAATGTTGTAATTTGTACTTGGACTCAGAGTAGAATTAGGGATCG
ATATTGGAGAAGTTTTTCCTATTGTTCTTATCCTTTTTTCCCCCCTTCTC
CCTTCTAACAGTTGATTGTAGCTGCTCTCCTCGTAAACATTATTTAAATT
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TCAGTGTTACAGCAACAAATTGTAAATATATTAAGGATTTCTTTTTTTTA
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ATCTGCGATTGAAAGTATTCAAATTTATCATCAAAATAACTGTTGAATTA
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GGCTCAATGGCTTTTTTAATTAGCAAAAAAAAGGCGTTATTGATCAGGCA
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TGGCATAGACTTCATGCMGGAGGGATCATTGAGCCATATTTTTTGGTGGT
GATGATAATAGCCACTTTAATGTAAATGAAAATCAATATTACACCATGAT
AATTGATGTTTTTTGCTCCAATTGCAAGGTAAGGACTTGGCTAACATGTG
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TATTGCAATGCAAATTTGTTGAATTCCTTATTTCGATAAATGAATCAGTT
CATTTGCCGCCTCGATTATGCCATTTCACGCCTTTAGATTATTTTTTTGT
GGGTCACGTGAAGTCATTGGTCTACACCAATAAACAAGTGACGTTAGAAG
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GTGCTCGTGATGGTCAAGCTAGATAAATTAATTTTTATTCAGAAATGTAT
ATGCTTATAATTTMMTACTNCGATTGGACTTCAGCAGTAAATGTGCTCGT
GATGGTCAAGCTAGATAAATTAATTTTTATTCAGAAATGTATATGCTTAT
AATTTGTACTCAAAAAAAAAAAAAAATTTGGCAAAATCTTTAACCGTTTG
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ATTCATTAGATTCTCAAACTTATTTTTGTAGTCTGTTGGTACACATGTAC
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CTTCTCAGAATCGTTCATTTCAGCGACATTTTCATATAGTAAAGCAGAAG
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GTTGAATATTTATTCATTTAAGCCCAGAACTAAATACATATAGTTTTGAG
CAAAGTCACAAACGGCTCAATAATCCAAGGTTTACTATAATGACATTCAA
CAATAGAAACGATAGGACATCCTTTTTTAAGGTTCCTACTCCACAAGTAT
CAATCGATCAAATTAATGGAATGCAATCCCATTTAATCAGTTTTGCTAAC
TTAGCCTTCCACAGAATCCTGCAGAGTAGAGACGAAATCCGAGAAGTTTT
GAGCTAAAAATGCTAGATTTGTTCCATTTGATTTTAATGAACGTTCTGGT
GAGTGATGACGTTCAAAAAATGACGCCATTATTCTTGTATTGTTAACAAT
AGGAAAATGTTGCTGGAATGAATGACGTTGAAAAAGGCGGACCCAAATAA
ATAATTGATCAAATAAATGCAGTTGAGATAAAACTTGCAGAAATTAACAT
TGCTCAAATAAATGCACACGGTCCACAACAACGTTTGGAGTCTAAGTTTG
TTTTTGACAGATGAATGGATTTGACGTCTTTTAATGATCTCCACGATTTT
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GTGACAATTTTGAAAGATTGTTAATTATACTAAAATAGCTATTATTTACA
AAATACTAAATTGTGAAGAAATAACAAATCTTTCAAAAGAGAAATGTCAA
AAAAAAAAAATTATACAAGTGAGAAATTGGAAAAAATGACCCCATTTCTT
TTAAGCGGATAAATATAAGCAGGTTACAAGGAAGGCCTATATATCAAAAC
AACTTTATAAAATATAATATTTTATATATTATGTACGTTTCATCTTTTTA
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ATCCTTTAATACAGGTCGCTTGTGGTCAACACATCATTTGGCTTGTAATA
AAATAAGGCCCCACGTATTATTTCTTGATGTATTCAATATTTATATGTAC
ATATATTTTTTATTTAACATGTACAAAATCTGTCAAATGAGTTTGTAATG
TTCTGACCTACTTTGTTCCTGGATACAAACTNNTTTAATAGATAGCAGTG
GTAATTGAAGGTTAGTTACTTCTTTACTGTTATTCTTCTGAATTTAAAAC
TGTCAGTCCTTGAAATATTCAACAAAAATGTTGTTGGTTTATTAAGGCAA
ATAAGATATATATTAAAAGCATTGCACATATCTAGCCAAAAAGTATCCTG
TTTTTTTTTTTCACAATAATATAAATATTTTACATTTTTACTTAAGTATA
CCAGATGCAGCAAAAAAATCTTTACACTTTAAATCTAGAACTTTATGTAT
TTCACAGACCAGTTGTATTAGGTTATGTCAATGAAATAAAAATAACTAAT
ATGATGGCTTGGCTATACCAATCATCGGTGTAGCCCACTCTTGCCGGCAA
TGATGGTTTCCAGCCGGCCACGAAAGGTCTTGCACCCATTATAGATGTAG
TCCTCAGACATGACATCCCAGTGATGGTTGACGATTTTGGTTGTTGATAT
TTGTATGGCGAACAGTGCAGGCCTTGGAATCAACATGCACCAAAAATGTG
AAGTCCAATGGGTTGGTATCTGGTGAGTAGTGGCCACATTTTCTTTGGCC
AGAAAGGCAAATTGTCCTCCAACCACCTCTGGGCCTTTTTGGACGTGTGT
GCAGGCACAACATTCTGCTGGAACACCACGTTTATGTACGGGCTCATGTT
GGAGATCCTCCAATTACTTAGGAATCTCCGTTGGTTTCTAGTCAACGTCC
AAAAGTGCAGGCACAAAATTCATTGGTCACGTTCAGATAGCATTTTCTCG
GCTTCCAGAACACATAGGAAGATCTAGTTTATTTTCAGTATTTGACTGGA
ACAATTTTACGGTATTAACAAAAACATTGACAAAAATAGCAAAAACGAAA
TGCAAATATTTTTTCGCCAAACCCGATATAATTTATTCTATTTTATAACG
GAATAATTTAAAAAAGTTGGAAAAACACCCTTAAATTACGTCACAAGGGA
TCGATGTTTCCTTTTTAAGAAGCAACAAGTGAGACTGGAGTAGACCGTGG
TCCTGGGTTCTAAAAAAGAACCAAACAACACTAATTATGACATATTAAAT
AATCAGCAAAAAGAAGAAAGAGAACAAGCAACATCCATTTTCATCTTCTT
TTTTTATGTTTTTAAACTATAATTTTTCATTACAAAGATGACATCCTTAG
TTAAAACCTACGACAAGTTTTTTAGAATTGTTCTATTTTTTCCCTGCCAT
TTTTTATTTATTTATTTTTTGACATTGTATAGGCAATACCAATATTTTCA
TAATAGCTCATTTTGGATAATACTATTTATTACTCTGCACAGCCGGAATT
AGAAACTTTTTTCTACTTTGAATACAATCATCACTAAAAGGATTTTGAAT
ACAAATAAAGTATGATAAATTTAAATATACAGTGCTTGCTTGCTTAGTTC
CTTATAATCTCTCTTCCATGTACGGTACCTCTAGGTATGTTGTAAAGGTC
TATAAATGTTGCGAAAAAAATAGGATGATTCGATTTATTGAATCTAAATT
TTAATATGTATATATATACATTGTATAAGGCAATAATGATTCCTTTATCT
CTTTACAACTTTCACCACGAAAAGAAAGAATGAAATCTAAAAAAGAAAAA
AAAAAATTAATCCTTCTGCATCTATATGTACACTAGGGTGGTTTGTTTTT
CAACTTTTTTTTAAATTTCAATTACAACTAGTACGGAAAAGTTTTGAAGT
GGTAAGAAAAATGCCTATGCAAAATGTCCTTTTCCCATGAGGTCATCTTT
AAGTAGTACATTTAGTTATAAGTTTGAAAGGAGACAAAAGATTTCGTTAA
TACAGATTAAAATACAATATTTATCATTAGTTTGCCTTTATTAATTATTA
TAGAGATTATTCGAACCGACATATATCATTAGTAAAGTTTTTTTTCTAAA
GTAGATACCCAATAGAGCCAAAAAGATTAAAGAACAAGAGAAATTTGGAT
TCTTTCCTTGTAAATGTAAAAATATAATGATGCACGATATATGCGGATCA
TTCATTATATTTTACTATATTGTTATTTTTTCTAGTAGTCATTTTTAGAT
TTTTAGAAAAGAAACTTTATAAATACTTTTTATAGGTTAAAAAAATGTCT
ATCAAAATGATATTCTATAAAATAACTAAAAAGGTCTTACTTATATCCAT
ATTCACTAAGAAAAGAGTATGATCGAGATGTGTGAACTTAAGATGGCCTC
GTAGGACAATGCAATTTTGCATTGCTTGCTCTTATATCAAATAACAACTT
TTCCGCACAAGAAGTAATCGAAATTGAAAAAAAAAATGGAAAATCAAACC
ACTCTAAAATATATGTACAATTTATTTATATAGTATTTTTTAAAGCAATT
CTATTTTTTCCCCTCTCTTTTTCCATARATATTTGCACCAATTTCCCTTC
CYCGCCYCCGMAAGCSCCTTCATCANCGACAACAMCATCCATACTAACCT
CATCTACAAATAAAAAACCTCGTTCCCTCAAAATCGTCGAATGTCTCGMC
TCTYCCYCGACGMCACACMCCMCAGCCTCTCCATCGTCGCCATCAACCTC
TTCATGGAATCTCATTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTCGCATCCTTCCGTAGAATCACCTTC
ATCGTCTTCGAGTCCTTCTCATCAAGGAGGGGGAGGKAAGAGAAAGACCA
GGGATTGTTGTCTCCTTGTACCTACAAGGAGTTTGAGKAGGGGGTTCATT
ATAATTATGGTTGTAAAAATATAGAAAATGAAAAAAAAAAGATCTTTATT
TATTTTATCTTCATTCAACTATACATATGCTTCGTTTTTATTAGTACTTG
GGCCAGTCCGAAGGATCTGTCCCAAGTACTTATAGGACAAGTCCTAAGAC
TGTACTGTACCAAATAAATAAGGACACGCCATAATATAAATATAGACCTG
AAAGAAAAATTAAAAAATTTCAGGAAAGACGAACATATTTTATTGCTATA
ATTTATAAAAAAAATCCTCAAAAGGGAGCGAGGAGGGGTCCTAGTATTGT
GTTTGTCCCTATTTATTGGGTCCAGTACAGTCATAGGGCCAGCCCTTAAC
ACTGTTAGTCCTTCGGACTGTCCGTACTAACCCATCCCCTCCAACATGGA
CAGCATTAAATACTAAGGAAGGAACAAAATAGTTTGCACAGAGGAGTTTT
ATTATGAAGGGCGTCCGAATTGTTGCTTTTTATTTGAAAATTGAATGTTT
GAATTCAATTTTTTTTGTAAACAGCATATGGATTTTTTTTTAAATTCCCT
TAAAATCTCATATTTGAAATTTTCTTCCAAAAAAAAAATCTTCAAATCTT
ATTTTTTGGATATTTTTTCAGAAAAATTCCCCCCTCCCCCCAAACATATT
TTGCAGACGCCCCTGAGGGAACACAATGGAAATGTGAGACAATTAAAAAT
GTAACTTTGATTTTGGTGGGGTGCCCTAGTTGAAAGTGAAAAAATGAATT
TTGGGCATTTAAGTATATGAAGCTTAAAAGAAACGAAAANTAAGTTACTA
CCTCTTAATCCGAGGACTCACTGTATATGCATTGTAATATATATTATATG
CGTACATTACATTCTTCCAATTGCCCTGGTTTGACTTTTGGGGTTTTTTT
AAAATAATATTTTACATATCGCAAATGCTTACGGTTTACAACCCCTAGAT
TATACGACCCTAAAATTTAGTTACATAAATTATATATACAGGCTAATAAT
TGTAGAATATGTTTCTGTTTGTTACTAGATAAAGAGATATCCTCTGTGGT
TATAGCAGCCTCTACGACCACGACAGCAACTAAAAGATCATTTAGTCAAC
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