EMLSAT00000008900, EMLSAT00000008900-704747 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008900
Unique NameEMLSAT00000008900-704747
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments
Table of all RNA interference experiments conducted using this feature, grouped by Phenotype CV: developmental defect, Molting, no molting
Gallery Image Title Gene or target symbol Sex/Stage Phenotype Datesort descending
beta FTZ-F1 beta FTZ-F1 both
  1. Nauplius
  2. Copepodid
Developmental arrest
developmental defect, Molting, no molting
17.01.2018 - 13:00
24.01.2018 - 13:00
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s554supercontigLSalAtl2s554:518802..535376 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008900 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008900EMLSAG00000008900-691666Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000039545EMLSAE00000039545-748473Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039546EMLSAE00000039546-748474Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778336auto778336Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008900EMLSAP00000008900Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008900

>EMLSAP00000008900 ID=EMLSAP00000008900|Name=EMLSAP00000008900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=181bp
MEAKSLPKRGGVVIEEDIDHSSINPLPLETPPVLLXPTXPSSSTAPASSN
SASAHQILFIPQFSSIGGGLVEEGXDKRPSCSSSQSVAVSTAATIISLIQ
SSDGSLLPESLNPTSIDKEISSVVIAASTTTTATKRSFSQHIMEEEEEDE
DEEEAGGHLSWNPDEEQDQSAEEDGKIMRHY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s554:518802..535376+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008900-704747 ID=EMLSAT00000008900-704747|Name=EMLSAT00000008900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16575bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s554:518802..535376+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAGGCGAAATCACTGCCAAAGAGAGGAGGAGTCGTGATCGAGGAGGA CATCGATCATTCTTCGATCAATCCCTTGCCTTTAGAGACTCCTCCTGTCC TTCTCTTKCCCACGCAKCCTTCATCATCCACTGCGCCCGCTTCGAGCAAC TCAGCATCAGCTCATCAAATACTTTTCATCCCTCAATTCTCATCCATTGG CGGAGGACTCGTAGAGGAGGGSGYAGATAAGAGACCCTCCTGCTCATCTT CTCAATCTGTTGCTGTATCCACAGCCGCCACTATCATATCTCTCATTCAA AGTTCGGACGGATCCCTCCTTCCGGAATCACTCAACCCTACCAGTATTGG TAAGACTTTTTATAAATATATGTTTAGGTATTTAACGGGGGTCATCACCT TTACACTAATACATAGTTAGCTAGTTAGATTGCGAGTCTGTCTTCCTTCG TTCCAACTCTACTTGCGTCTACTTCCCCCCAGCAGGTATGGCGTCTGCTA CTAAGGCGCTCATTGCATAATACTTTTTCACGCCTTGGAAGCAAAGAGAG ATTATCTTTAACTTACACACACACAAACTTCTACCATTTTTTCCTTCTGG AATCAATAATAATAATGAGGAATAATGTTTATTTATAATAACTAATATTA TGTTATTGGTAATGTATTTTGAAATGATGAGTTGGAGGAGCTGATGAGAG GGAGATCCGTGTTTCTCAAGGGTCAGCAAAGGAAATCCCCGGTAAAGTCA TCTAGTATCTAGAGAAGGAACGAGAAGAATTAGGGGTTCGACGTGTTTAC TAGTAAATAACTAAATCGTTTCTAACTATGTAACAGCCAGAGGAGGCGAA GGAATAAATCCTAAATCACTCAAATCCAATGATGCAATGTTTATGAAAAT AAATAATATATTACAAAAAAATAAAATTTCTACACAGCGTTTCATAAGAA ATCTTCCTTTAGAGTGGATCATATGTATGTATTTCCACATTCTTATGTAA AGAAAGACGGATCATAAAGGAGTAACAACGCCTTGATCTTGCGTATACAC ACATACATATGCATAGATTTTGATCCGTCTCTCTTTAACTCTCTCTATCT ATCTACTTATGTATCTCCCTGTATATAGATTGTAAATACTTTTATTTTAA TGCAGAGTTAACCCGTTAGAGGGACGCACATACACTATTTTTCTACCATA GATACATACATACTCTTTCAATCTCCCTTTTCTTTGCTTACTCCAGAGCG GCTCTCTCAACCTTTCCTACTTAAAAAAGAAATTGAAAACAAGGTCCCAA ATCCTTTGTCATTCCTTTCAATATTGTTGACATAATCAGCAGGCTTGTTG TCGTTCGCCCATTTGAATCGTTTAGTTCACTTTCATTGTTCTTTTTTTAA TTCGTGAAATTCACTTTCATTGTTCATTTTTTTAAATTCGTTTATTTGAC TAAATCAATCACTTTGATTTCATTTATTTGACTAAATCGATCACTTTGAA TTCGTTTAATTGTTCACCTTTTAAACGAGTCTACATTTCATTGTAACCAA TGTCAGAGAATAAAATGTAATCACAGTAAATCGTCCAATTTCCAACAACT TTTAATTAAGAGGTCATCAGACTATTTGCTRTTTTGATSCCCCCAGCCAC TCTTACTACATAAACCAGCCTTTATGAAATTGGGTAATTGATTTTGTTTA TTGAAAGAGGGAGTGAAATGCTTGCGAGATTTAATACATTTTATTCAGTG CTCCTTGTTTATATAATAACCATGTCTTTCTTAATAATTTATCAATCAGG GGACACTTATTAGTTTTTATAGACATTTTCACGATAATTCGCAATATTTT TTTGCAAAAGAACAGTTGTTTCCCTTAATTTGTATCAACGTATCAACTGC CTGAATACTCAAATTGTATCTCATGATCACTTAATGAAATGCCCTAATTC ACAAAATGGAACATCTTTTTAGATTGAAGGAAGTAAGGTATTGATGTTGA TTACTAATACCATGCTGTGCAAATTTGTTTTCGTAATTAAATATTGAAAA AAAAATATGGGGATCTGAGATATCTTTTATCCTAAATAACAATGAACAAT TTAAATGTACATTTCTTGAATTCGTTCATTAACGATTTTTTGGACAATGA TCAATCCGCCTGGTTCTTAGTATGGAAATGCATTGCTGTAATAAAATTGA AGAAAAAAAAATGCAGCATTGGTGTCTAACTTTCTGGAGATTCACCATAG ATAAAATATATTTCCCTTATAAGGGCTATATTATACGTTATTTGCGTATA ATATTGTAAACATTGACATTGAAAAAACGAAGCAGTGTTAAGCTGTTGGA ATATAATATGCAGTTTTTTTTTTTCAAATGCGTCCTCGAAAGTATATACC TAAGTATTTGCGTGCATATTATAAAATAATAAATGCAATAATCCTTTATC TTCTTGTTTGGTATAATGTATGTTTATACAATCCAATGGCCTGGTTTTTG GAATTTATTTTCGGGAAAAATTTCAAAAATCTAAAGCTACTCTCAAAAAA TTACAGAAAACCATAACCGTAGAAAATTAAATTTCAAATTTTCTAGAAAA AAGCAAAAATTCCCTAATGAGGGGGGGGGGGTACAACTCTACTAGCCTAC CCTTTGCAGAGTCCCTAAATCCACTCTGTTGAGATGACGATCATTTAATA CGAATACTAATATAATATAAAAACTATATAATTATTTATTTGGCATTGGT TATTATTTAAGAGATATTACATTGTATATTAGGGTGGTTTGTTTTTCAAG TTTTTTAAAATTTCGAAGCCAAATAGTTTGGAAAAGTTATGATATTGTCA GAAAATAACCAATGCAAAATTTCATTTTTCTACGATGTCATTTTTAAGTA GAATATCTTATTTAAAGTCTAAAAGGAGACAAGGGTATTTTTTATTTTCC CAATAAGTATTAAAATAGATTATTAATTATGAAAGACATTATTCTAAACT ATAAAAAAACATTACTAAATTATTTAAAATCTACAATCCGAAAGAAAAAA AATAATGCGCGCTATACACGGCTCATCAAATTTACATAACTTTTTTTATC TTTTTTATTTCCATAGGACAATTTTAGAAAAGAAAAAAAAACTTTTTCAA CACTTTTTATAGGTTACAAAAGTGTCTTATCAAAATTATTCATTGCAAAA TAACTACAAATGTCCTAAGGTACATATCTATATTTGCTAAGTTTATTCAT AAGTTGATTGAGAGTTATGACCTAAAGATGACCTCGTAGGACAATAGAGT TTTGCGGAGATCATTTTCAACCCAGTTCACAACTTTTCTACATAATCGAA ATTCGATCAAAGTTGGAAAACAAGCCGCCCTATTGATCTTGGAGAGACCT ATGTACAAATCTACTATAGTTGTCCCTGACCTCTTTTTGTGAATATATCG TCGTCATGATGATGATCATCATCATCATCAGATTCAACTCTATCGTCATT CGATGTATGTTCACTTAATATACTCTTATTATTTCGTCACTCTTTCACAA CGAGAGAGAATGTGAGGGACTGCTTCTGATTGCTCCAAACTAGCAATGAC GATGATAAATCATCGTTCTATCTCACTATATGTACATAGACTATTATTAA TACACATCTATGTAATAGCTAACATAAGTAGTAGGGTATTAATAGTGGTA TGCAGTAGGTATTGTAGAGCGAAAAATCATGATGACGTCAGTCCTCTGAA CTTTCACCAGGACGGTGGATATAATAATAATAAAAAGAAATTATGCAAGA AAAGGAAAACTTCTTTCTCTCTTTAATTCTTCCTTCCTTAGTAACATTCT CCTAGCGAGTATGCAAGCAGGTTTTTCTCTTTCATCTCTCTTTTTATGTT TTTAATTCTTTGATACACGAATGATACATACCAAATGGATACCAAATAAC CAATCAAACAATACCTTATTCTTAACTCTCCTCTAGAGCCCTCATTTCCA ATCAAATTTAGTACATTAGTATTACTCAAGGCCTTCCACCTCAAAGAAAC AATATGTATCTATATGAGTTCCTAGTTCCTCAACTTCCAACGTCATCCTT TGTTTAGTATTCACCAACATCCGTATCAAACACTAAAGAACTTGATTCTG TGCCATGAATTGGTTATTAATATCCCCTTGGATTCGTTTGTATGTATTTG ACGTTCAGGTCTGTACAATTCTTTTAGAACATCAGAATAAAACCGTTCTT GATCTGTCCCACAAAGAAAAATGACGTTTACAATTAGAAATCTATGCCTA GTATTGTGTGAGTCCTTATTTATTTGCTTCATTAGAGTCTTAGGACAGGT ACTAAGAGTCCTTCGGACTCTTAGTGCAATAACTGATTGCAAAAGAAGAA ATAAAGTTTACAGATACCATAATGGACCTAACTTTATAAGTTTTAGGACT GGACTAGATGGGCATCCTGTCCTAAATATGGACTGGCATAACAATATGTA TGACAATTTCTTAGGAACGGTCTTATCAGTCCTTGGGATCGGTCTCTATG ACCGTTAGTCCTTTGAAATGTCAGTACTAGAATTGATTTAAAAAAAAGAA AAGAAACAAATTTTAGTGATGTTATCAAGGACCTAACTATTTAAGATATA AAGACTAAACTGAACCGACTTACAGTCCTCAAAAAAGGAACGATACAACA CTATGTATGACTTTGTTTATGAGAAAGAAATTTCGGTCCATGGTCTCTAT GTACGAGTATATTGAAAAAACCATTAAGACCAAACAGAAAATAAGTTTGG TCTCAGGCCATGTCTCAAAACTTGCGTCTACATAAAATTCCCTTGTTCAA AAAAATTAAATGCTTCCTTGTCCATCAGATTTTTTTTTATTGAAAGAGTA AAGCCCGGAAATTTTCCTACTAATCAGATATGAAGGGATATTAATCGTAA ACCAAATTGAAAACACTAGTCAACACACTACATACATAATGTGTACCTCT CTTGCAATTTGAATTCAATCTTGACATATTTTAATTACCTTTTAACAGTC ATGAATGGGATTGACGTAGGAAGGGCGCTTTTAAGGTGTTTTGGACACTT ACGCCTCCCCTTAAAAAATTTGTTATAAGATGAAAGTGTTTGTAGAAAAA CCCTGCATGAGTAATTTCTTTTATTTATAAAAGAGACGTCAGCTAAAAGG ATTGTGATTTTGTCAAATTTCTCCACGCTTGTATAAGTACAGTGTTAAAT TGGTTAGCCCCAACGAATGCTTTTTGCATGACGATGATTACGCTCAATGA AGAGGAAAGGAGTTCATTTTTTTTTAAATGTTTTGTCCGACTAAAACAAA TCTTTTTTTTTTCTTTTTTTGACACCATATAGAAGTGACTAAATGTGATG AAACAAGACGAAATGAACATTGGCGTAAGCATATATATTTACGTGACCCT TAACACAAAAGCAAACTAGACCGATTTTTCTCAAAATTGAGTGTTTTGTA TTCTTCGTCGAATATTCGTCAATTTCTATCAATAAATTATCGTTATCCTT TAAGTGTGCCGAAGATGCCATTTTCGTATAGACAAATTTGATTCTGACAA TTAAGGAATGACCAATTGATGGATTGTGTGTGTAAAACCATAATGGGACC AATATAAGTACCTTAAATCAAATAAAGGCTCTAAACTATAGCTAAAATTG 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GAGTACGCACCAGGTGATGATGCGTATACCTCTTTTTTTTTTTTCATTAT GTTCGTGAGTAAATCAGAAACGTTATAACTTATTACTAAGAACTTGTATT GTTTGATAGAGGGAAAAATATTGAATATTTCCTTAGTGTGTGTTGCTGGT TAAAATTTTGAACAAATGATTCAAAATATTATGTAGATGGTGCAATTACA AAATAAAAAAACAATGCGGATCTTGATGCAATTTTAGTAAAAAAATTGCC CATGACGATTTTTATTCTTTAATATTTTAAATAATAGTTTTTTAAAAAAA ACTATATTNCTATTAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTAAACATTCAAAGATT TTAGTTGAATACTAAATTTGTTCAAAAATAATTTCAAATATACAATTTGA TATTTAACAAGTTACAATCTCTTCACAAAAAATTATATATATATATATTT TTTTAATCCACATTTGTTCACAAAAAAATTCAAAAATAACCAGCTGTTCA AAAAAAAAGTTCAAAACTTAAATTTCTAAATAAGACTTTTTGTAAAAAAA ATTGAAGTATTACATTTTTTTGGAGAAAAGTTTTAAAAACGTAGTTATTC ACAGAAAATTACATTCTCTGTAAAAAAAAAATTGAAAAATTTAATAAATT TCAAATATTAAATTTTTTAGTAATAAGTATATATTTCTTTATTTTTTTTG GGGGGGGGGTATTTTTTTTAATAACTCAAAAAACTAATAAGTAGTTAAAT ATCAGCAAATACTACTAATTTTATTTCCGGAAAAAACACCCAATTCTCCG ATTAAACGTACCATCACTAAAAATATATTTATAAAAAAGTTGTTAATGGG TTTTGTTCTTTTTTTACGGCCCTTCTTAAGGATGGAAAAGACAAAAGTAA CCTACTTGAAGTTGTTTCTTCTTTCTATAAATAAACTCTCCCAACTTTCA CCTTGTTTATTTTATATTTATGTCCCCATTTTCTAGATACATATATCCAT AGTAGTGATGTGACGATTAATCGGAATAGGGGTTTTTCTGGAATCTGCAT CGGAATAATAATATTTCATATACGATTCTGATTTATTTTTAGTGGTATTT TACTATATATTACTTTTCCAAGTTGTGAAAAAATAATAACCTCTCAAATT AAGGAAGTTTTGCTTTTGTCTAGAAAATTAAAAATTTTATATTGAATTTA AAAAAAAATCAATATTTGATAAAAAAATCATTTTCTGTGAATAACTATGT ATTTTATGACCAAGCATGCCCCCACAATAATTAATAATGTTTTGCAATGA TTTAAAATATTAAAGAATTGGTATCGGGAATTTTGGCAAGATTCGTATGA GAATCAGTATAAGGATTTTTGTGTTTTTTGGAATCGTTCCATCACTAAAC CATACTATGAGAACGTACTTTAATAGTATTCTTTTTGCATGAGGTAACAA GAGGGAAAGAGAATGGATGGATGGAGGTCTTGAAGTTTTTTAAAGGAATG AGCCACATATATACCTATTTATTATGCAACCAAATTAAATGCATAGGTGA CGACGATTATGAGAATAATAAAAATGCTCCATAGATCCTCTTAACTTTCA CTGATTTGAAATTGAGAGTCATGATATGATGCTTTATGAATGTTTATAAA AAATTTAAAAATACTTTTTCCACCCAACCAATCTAATGATGTACACTCTA GAGTGTTCGATTAAAACTAAGATTTAAATCTACTTTATCAAGAACAAAAT AAGGAGTGAGTACCTTTTTATTACAATAAATGTTGTGTCGGCCCTTATTT TGGACGGAAAACTGCTGTCTAGTTCAGTCCTGCATATCAGTTTTAAAACT GATTAAATATGGTCCTTTATGACGTCACTCAACTTCCGTTCTAGGACTGA CAGTCCGAAGGACTGAAGGTTCTAAGGACCCGTATCAAGTACTGATATTA CGGAACAAGGACTGATCAAATAAATTAGGACTCGAACCATTCTAATCATA ATTATACCTTATAATATCAACAATATTTTCTCAAAATGTCCTGCTTCTGC GGCCACCATGGCCTCAAATCTGAGCTTGAAGGTTTTGCATCCCTTGACGA CTGAAACCTTCAGAGAATCAGCATAAGACTAAGGAAGCCTTGCTCTCAAC GAAGCCCCATAGTCCAGTGGCGAGAAGTCTGGGGATGAGGGGGATGTAGG TTTTCCTTACACCAATCTTGCATTGTTAAGGCCTTATAACCAGGGTCTGA GTCTTTAAAACTGAGTTAAAATGGCATCTTAATATGTGATGGACTTGATT AATTGGAAGAGGTGAATTGGTCTACTATTTGAAAACGAAGAAGAAAAAAA AAATGTTACCACAGTCTGAGAACACGTTATCATCGGAAATATCTCTACTA ATCAGTCTATTAAACAACATCTAAGACTGAATCGACAAAAAAATGTCCTC GAAACTTATCTCGACACACATATTTCGGTATATTAAAGGTTCGTTACATA TATTTGTCACAATATCGTGATGGATATTATTTTTGGCACGAATTGAGGCA ATTATTAGAGCTGAGGGCTCACATATTTAATTAAAGTTGTGCCGAGCACT ATATTGACTTGATTTTGTTAAATCCTCTTGTTTAAATTTTCCAATGCAGA GAAAATATTATTAATATTTTTTAATTTCAAAAAAACAACAACAAAGACCA GCGGGAATTCTTCCCTCAAATATTGATGTTACTACCACGACGATCTGTTT AAGAATGAACAAAAAAGGAAAAAAAAGAGGACACGCCCCCAACTTTTTTT CTTTTCTAATCCTAAAACTTTTTTTTTTTCTACGAAAAATCACATTTCCA 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GGCTCAATGGCTTTTTTAATTAGCAAAAAAAAGGCGTTATTGATCAGGCA GAAATATAGTGCTTCACGAAGCATGATTGAATCTTAAAAAAATTACTGTT TGGCATAGACTTCATGCMGGAGGGATCATTGAGCCATATTTTTTGGTGGT GATGATAATAGCCACTTTAATGTAAATGAAAATCAATATTACACCATGAT AATTGATGTTTTTTGCTCCAATTGCAAGGTAAGGACTTGGCTAACATGTG GTTTTAACAAGGCGGTGCCACTTGTCACACAGCAATAACTAATATCTATT TATTGCAATGCAAATTTGTTGAATTCCTTATTTCGATAAATGAATCAGTT CATTTGCCGCCTCGATTATGCCATTTCACGCCTTTAGATTATTTTTTTGT GGGTCACGTGAAGTCATTGGTCTACACCAATAAACAAGTGACGTTAGAAG AGGTAAGAGAAAATATCCAAAGTGAAATTCCTAAAATTTCAGTCAATTTA TTGGAAAAGTAGTGGAGATTTGGTACAGCGATTGGACTTCAGCAGTAAAT GTGCTCGTGATGGTCAAGCTAGATAAATTAATTTTTATTCAGAAATGTAT ATGCTTATAATTTMMTACTNCGATTGGACTTCAGCAGTAAATGTGCTCGT GATGGTCAAGCTAGATAAATTAATTTTTATTCAGAAATGTATATGCTTAT AATTTGTACTCAAAAAAAAAAAAAAATTTGGCAAAATCTTTAACCGTTTG AGTTTAATTTATATAAAAAAATTGAGGTACTCTTAATGAACCCTCCCCTT TACAATGCCTAATCTAAAAGAAAACATTATTTTCTCATACCGAATATAAT ATTCATTAGATTCTCAAACTTATTTTTGTAGTCTGTTGGTACACATGTAC AAAACGGCGTGCATTCATTTGAGTAAATATGTATATATTTGGGTGAGCTT 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CCTCTTAATCCGAGGACTCACTGTATATGCATTGTAATATATATTATATG CGTACATTACATTCTTCCAATTGCCCTGGTTTGACTTTTGGGGTTTTTTT AAAATAATATTTTACATATCGCAAATGCTTACGGTTTACAACCCCTAGAT TATACGACCCTAAAATTTAGTTACATAAATTATATATACAGGCTAATAAT TGTAGAATATGTTTCTGTTTGTTACTAGATAAAGAGATATCCTCTGTGGT TATAGCAGCCTCTACGACCACGACAGCAACTAAAAGATCATTTAGTCAAC ATATCATGGAAGAAGAGGAAGAGGACGAAGACGAAGAAGAGGCTGGAGGA CACTTATCTTGGAACCCTGATGAAGAGCAGGATCAATCAGCTGAGGAGGA TGGTAAGATCATGCGTCATTATTAA
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